严重低龄儿童龋患儿成对龈上菌斑与牙本质龋损菌斑的DNA和RNA扩增子测序研究

早期儿童龋齿是一种影响6岁以下儿童的牙齿蛀蚀形式，全球有超过5.14亿儿童受到影响。重度早期儿童龋齿（S-ECC）是早期儿童龋齿中最严重和最具侵袭性的类型，其定义为年龄依赖性的上颌乳前牙光滑面龋洞、缺失或充填数量，或总体的龋坏、缺失或充填牙面数。为了增进对不同类型龋齿之间微生物学差异的理解，我们试图研究从13名S-ECC患儿中分离出的深层牙本质龋，并将其与同一部位分离的龈上菌斑进行比较，以鉴定差异丰富的菌种。通过共提取方法，我们能够利用16S基因和转录序列进行物种鉴定。通过对逆转录的16S rRNA与DNA进行平行测序和分析，我们得以识别牙本质菌斑中具有较高代谢潜力的细菌，从而检测可能驱动和/或促成这种最严重龋齿形式的潜在活性口腔细菌物种。在此，我们强调，干酪乳杆菌和Oribacterium sp. HMT-078在牙本质菌斑中显著差异富集，且RNA/DNA比率增加，表明在S-ECC患者的牙本质菌斑样本中具有活性。因此，除了与S-ECC相关的其他已确立的致龋菌种，如Prevotella denticola、Dialister invicus和变形链球菌外，这些物种可能在深层牙本质菌斑中S-ECC的进展和严重程度中发挥重要作用。