YAP/TAZ表达分析
确定YAP/TAZ在次生腭发育中的表达模式。
通过免疫荧光染色检测YAP/TAZ在不同发育阶段的腭突中的表达。
YAP/TAZ Regulate Elevation and Bone Formation of the Mouse Secondary Palate
包含基因敲除小鼠模型(Osr2Cre和Col2Cre)、组织学分析、µCT、腭突外植体培养、RNA-seq及功能验证
Yapfl/fl;Tazfl/fl;Osr2Cre小鼠 Yapfl/fl;Tazfl/fl;Col2Cre小鼠 小鼠腭突外植体培养
Cre驱动子类型(Osr2Cre、Col2Cre) 小鼠胚胎发育阶段(E12.5-E18.5、P0) 基因敲除效率(Yap/Taz缺失) 腭突抬升位置(垂直、水平、黏附、融合) 骨体积和密度(µCT测量)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定YAP/TAZ在次生腭发育中的表达模式。
通过免疫荧光染色检测YAP/TAZ在不同发育阶段的腭突中的表达。
研究YAP/TAZ在次生腭发育中的功能。
使用Osr2Cre和Col2Cre驱动子分别在整个或后部腭突间充质中条件性敲除Yap/Taz基因。
评估Yap/Taz缺失对腭突抬升时间和融合的影响。
通过组织学切片和分期观察腭突位置,分析腭突抬升延迟和腭裂发生。
探究Yap/Taz缺失是否影响腭突间充质细胞的增殖和凋亡。
使用BrdU标记和TUNEL染色分别检测细胞增殖和凋亡。
验证腭突抬升缺陷是否由腭突本身固有,而非受下颌影响。
去除下颌骨的E13.5胚胎腭突外植体培养,观察腭突抬升和融合。
评估Yap/Taz缺失对次生腭骨形成和矿化的影响。
使用µCT测量腭骨体积和骨密度。
鉴定YAP/TAZ调控的与腭突抬升和骨矿化相关的下游靶基因。
对后部腭突进行RNA-seq,并用RNAscope验证Ibsp、Phex和Loxl4的表达。
验证Yap/Taz缺失是否影响腭突间充质中的胶原水平。
使用Masson三色染色检测后部腭突骨化区域的胶原水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | YAP抗体 | Cell Signaling | 4912 |
| TAZ抗体 | Sigma-Aldrich | HPA007415 | |
| 增殖分析 | BrdU抗体 | Abcam | 6326 |
| 凋亡检测 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | -- |
| RNA原位杂交 | RNAscope | ACD Diagnostics | -- |
| 胶原染色 | 三色染色试剂盒 | Abcam | -- |
| 组织成像 | Leica DMi8显微镜 | Leica | -- |
| 外植体培养成像 | Zeiss转盘共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 外植体培养 | E-钙黏附蛋白抗体 | Zymed/Invitrogen | 13-1900 |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | 74104 |
| RNA测序 | Illumina HiSeq 4000测序仪 | Illumina | -- |
| 微型计算机断层扫描 | MicroCT50 | Scanco | -- |
| 骨骼成像 | Zeiss SteREO Discovery v12显微镜 | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠品系与基因敲除 | Cre驱动子类型(Osr2Cre、Col2Cre)、Yap/Taz敲除等位基因、小鼠遗传背景 阅读提示:见Materials and Methods中的Mouse Husbandry |
| 胚胎分期 | 胚胎发育阶段(E13.5-E15.5)、Theiler分期 阅读提示:见Results和Figure legends |
| 腭突抬升表型分析 | 腭突位置分类(垂直、水平、黏附、融合)、样本量 阅读提示:见Results和Figure 2E |
| 腭突外植体培养 | 培养时间、旋转速度、气体条件、培养基成分 阅读提示:见Materials and Methods中的Palatal Shelf Cultures |
| 骨形成分析 | µCT扫描参数、骨体积和密度测量方法 阅读提示:见Materials and Methods中的Micro-Computed Tomography |
| RNA-seq分析 | 样本收集条件(E14.5后部腭突) 阅读提示:见Materials and Methods中的RNA-Sequencing Experiment |