在B细胞肿瘤细胞系中验证阳离子载体上调CD20
验证多种钾/钠阳离子载体能否上调B细胞肿瘤细胞表面的CD20抗原表达。
用不同浓度的SAL、MON、NIG、NAR等处理Raji细胞48小时,通过流式细胞术检测CD20表面水平,并评估细胞活力。
Potassium/sodium cation carriers robustly upregulate CD20 antigen by targeting MYC, and synergize with anti- CD20 immunotherapies to eliminate malignant B cells
包含体外细胞系实验、患者样本离体实验、动物模型体内实验、CRISPR/Cas9基因编辑、RNA-seq和CUT&RUN等机制验证,证据层级丰富。
Raji细胞系(Burkitt淋巴瘤) 原代CLL和DLBCL患者细胞 SCID小鼠皮下移植瘤模型 P493-6淋巴母细胞系(MYC Tet-OFF系统)
盐霉素(SAL)和莫能菌素(MON)的浓度及处理时间(如0.25-0.5 μM SAL, 0.05-0.1 μM MON, 48小时) Raji细胞CD20表达水平(MFI)及MS4A1 mRNA水平变化 MYC蛋白和mRNA水平变化,以及MYC敲除或抑制对CD20的影响 动物实验中SAL(2.5 mg/kg)或MON(1 mg/kg)及利妥昔单抗(10 mg/kg)的给药方案 CRISPR/Cas9敲除MYC或SGK1对CD20表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证多种钾/钠阳离子载体能否上调B细胞肿瘤细胞表面的CD20抗原表达。
用不同浓度的SAL、MON、NIG、NAR等处理Raji细胞48小时,通过流式细胞术检测CD20表面水平,并评估细胞活力。
验证阳离子载体在患者来源的原代恶性B细胞中能否有效上调CD20表达。
分离CLL和DLBCL患者原代细胞,用SAL或MON处理48小时,通过流式细胞术检测CD19阳性细胞中的CD20 MFI。
测定阳离子载体预处理是否增强抗CD20单抗和CAR-T细胞的杀伤作用。
用SAL或MON预处理靶细胞后,进行CDC、ADCC和CAR-T细胞杀伤实验;在体内SCID小鼠模型中评估联合治疗的抗肿瘤效果。
阐明阳离子载体上调CD20的分子机制,特别是转录调控机制。
通过RT-qPCR检测MS4A1 mRNA水平;RNA-seq分析转录组变化;GSEA预测调控转录因子;Western blot检测AKT、FOXO1、MYC等蛋白水平;利用CRISPR/Cas9敲除MYC或SGK1;使用MYC抑制剂10058-F4;通过CUT&RUN检测MYC与MS4A1启动子结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与处理 | 盐霉素 | -- | -- |
| 莫能菌素 | -- | -- | |
| 尼日利亚菌素 | -- | -- | |
| 那拉菌素 | -- | -- | |
| NK细胞分离 | EasySep人NK细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19055 |
| T细胞分离 | 人T细胞富集试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19051 |
| 细胞培养 | 人血清 | Sigma-Aldrich | H3667 |
| 白细胞介素-2 | Peprotech | 200-02 | |
| T细胞激活 | 抗CD3/CD28磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 11161D |
| CAR-T细胞转导 | 抗CD20 CAR慢病毒 | BPS Bioscience | 78606 |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | TR-1003-G | |
| CRISPR/Cas9基因编辑 | pLenti-CRISPRv2质粒 | Addgene | 52961 |
| Cas9核酸酶 | Integrated DNA Technologies | 1081058 | |
| tracrRNA | Integrated DNA Technologies | 1072533 | |
| 重悬基因组编辑缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | N10025 | |
| 电穿孔 | Neon NxT电转系统 | Thermo Fisher Scientific | NEON1S2YR |
| 膜蛋白提取 | Mem-PER™ Plus膜蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 89842 |
| 质谱分析 | nanoElute(纳升超高效液相色谱) | Bruker | -- |
| Compact(电喷雾四极杆飞行时间质谱仪) | Bruker | -- | |
| 原代细胞分离 | Histopaque 1077 | Sigma-Aldrich | -- |
| NLRP3抑制 | MCC950 | -- | -- |
| MYC抑制 | 10058-F4 | -- | -- |
| SGK1抑制 | EMD638683 | -- | -- |
| 抗体 | 利妥昔单抗 | -- | -- |
| 奥法木单抗 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与药物处理 | Raji细胞处理浓度:SAL 0.25-0.5 μM,MON 0.05-0.1 μM;处理时间48小时 阅读提示:Methods部分“Surfaceome analysis”及Figure 1B |
| CD20表达检测 | 流式细胞术检测CD20表面水平,使用抗CD20-FITC或PE抗体;需要报告MFI值 阅读提示:Figure 1B和Methods部分“Flow cytometry analysis” |
| CDC实验 | Raji细胞预处理浓度和时间;RTX浓度范围;人血清作为补体来源;孵育时间 阅读提示:Figure 2A和Methods部分“Complement-dependent cytotoxicity assays” |
| ADCC实验 | NK细胞来源(健康供者)、效靶比4:1、孵育时间3小时、RTX浓度0.03 μg/mL 阅读提示:Figure 2B和Methods部分“Natural killer cell-mediated cytotoxicity” |
| 体内动物实验 | SCID小鼠品系(CB17/Icr-Prkdcscid/IcrIcoCrl),皮下接种Raji细胞数量,给药方案:SAL 2.5 mg/kg或MON 1 mg/kg(第5、7天),RTX 10 mg/kg(第9天起隔日),肿瘤测量和终点 阅读提示:Figure 4和Methods部分“In vivo experiments” |
| CRISPR/Cas9基因编辑 | Raji细胞核转染的RNP复合物组成,电穿孔条件(1500V, 30ms, 1脉冲),敲除基因靶点(MYC、SGK1) 阅读提示:Methods部分“Genome editing using CRISPR/Cas9 technology”和Figure 8C |
| RNA-seq分析 | 样本处理条件(SAL 0.5 μM或MON 0.1 μM,18小时),测序平台(nano-UHPLC-MS),分析参数 阅读提示:Methods部分“Surfaceome analysis”和“RNA-seq” |