评估 MEN1 对铁死亡的影响
验证 MEN1 是否调控肺癌细胞的铁死亡敏感性
在肺癌细胞系中敲低或敲除 MEN1,使用 erastin、RSL3 等诱导铁死亡,检测 ROS、脂质过氧化和细胞活力。
MEN1 Promotes Ferroptosis by Disrupting CD44 Alternative Splicing to Suppress Lung Cancer
包含体外细胞实验(铁死亡、剪接报告基因、ChIP、RIP)、体内动物模型(Kras突变肺癌、异种移植)及患者样本分析,并进行功能验证和机制验证。
A549、NCI-H460、Sk-LU-1 肺癌细胞系 KrasG12D;Sftpc-CreER 肺腺癌小鼠模型 KrasG12D;Men1f/f;Sftpc-CreER 小鼠模型 M-NSG 免疫缺陷小鼠肺转移模型
MEN1 表达状态(敲低/敲除/过表达/回补) CD44v6 表达水平(siRNA 敲低或抗体阻断) erastin 或 RSL3 处理浓度和时间 PAF1 表达水平(siRNA 敲低)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证 MEN1 是否调控肺癌细胞的铁死亡敏感性
在肺癌细胞系中敲低或敲除 MEN1,使用 erastin、RSL3 等诱导铁死亡,检测 ROS、脂质过氧化和细胞活力。
确定 MEN1 缺失对肺肿瘤生长和转移的影响
利用 Kras 突变驱动的肺腺癌小鼠模型和尾静脉注射的转移模型,对比 MEN1 缺失后的肿瘤负荷、生存期和转移情况。
检验 CD44 变异异构体是否是 MEN1 调控铁死亡和肿瘤进展的关键介质
在 MEN1 缺陷细胞中敲低 CD44v6,检测其对铁死亡敏感性和细胞侵袭能力的影响;分析临床样本中 CD44 变体的表达与预后关系。
阐明 MEN1 影响 CD44 前体 mRNA 剪接的分子机制
通过剪接报告基因、ChIP、RNA-IP 等技术,检测 MEN1 对 Pol II 延伸、剪接因子招募和 CD44 可变外显子包含的影响。
验证靶向 CD44v6 是否能治疗已建立的 MEN1 缺陷肺肿瘤
给予原发性肺癌小鼠模型 CD44v6 干扰肽或erastin治疗,观察肿瘤生长、转移和铁死亡指标的变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM 培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640 培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| GMyc-PCR 支原体检测试剂盒 | Yeasen | 40601ES20 | |
| 药物处理 | 爱拉斯汀 | MedChemExpress | HY-15763 |
| RSL3 | MedChemExpress | HY-100218A | |
| 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648-5G | |
| Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 | |
| 甲磺酸去铁胺 | KKL MED | 138-14-7 | |
| Z-VAD-FMK | KKL MED | 161401-82-7 | |
| Necrostatin-1 | KKL MED | 4311-88-0 | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L3000075 |
| Lipofectamine 2000 转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | 11668019 | |
| 蛋白质提取 | RIPA 裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂 | Solarbio | P6730 | |
| 蛋白质定量 | BCA 蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | -- | -- |
| Smart 化学发光底物 | Lifesciences | H31500-1 | |
| RNA 提取 | TRIzol 试剂 | Yeasen | 10606ES60 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Yeasen | 11141ES60 |
| qPCR | TB Green 预混液 | Takara | RR820A |
| CFX Connect 实时荧光定量 PCR 系统 | Bio-Rad | CFXConne | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8 试剂盒 | Biosharp | BS350 |
| 集落形成实验 | 结晶紫 | Solarbio | G1062 |
| 侵袭实验 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY581/591 荧光探针 | Thermo Fisher Scientific | D3861 |
| ROS 检测 | ROS 检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| Iron measurement | 组织铁检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A039-2-1 |
| 测序 | NovaSeq 6000 测序平台 | Illumina | -- |
| 动物实验 | 小鼠 CD44v6 多肽 | -- | -- |
| 人 CD44v6 多肽 | -- | -- | |
| 对照多肽 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞铁死亡诱导与检测 | 细胞系 MEN1 状态;erastin/RSL3 处理浓度和时间;脂质 ROS 检测探针浓度和孵育时间 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture, Cell proliferation assay, Measurement of lipid peroxidation; Figure 1 图注 |
| CD44 可变剪接分析 | MEN1 状态;PMA 处理浓度和时间;剪接报告基因类型;Pol II 延伸速率测定方法 阅读提示:Materials and Methods: CD44 splicing minigene assay; Inhibition and reinitiation of transcription; Results: MEN1 prevents CD44 variant generation by repressing RNA alternative splicing; Figure 4 图注 |
| 体内肺癌模型 | 小鼠品系、基因型;他莫昔芬剂量和给药方案;肿瘤诱导时间;肿瘤负荷和转移评估方法 阅读提示:Materials and Methods: Experimental animal; Lung injury scoring; In vivo treatment with erastin and CD44v6-specific peptides; Results: MEN1-modulated ferroptosis is required for suppressing lung tumor growth and metastasis; Figure 2 图注 |
| CD44v6 干扰肽治疗实验 | 多肽序列、给药剂量、频率和途径;肿瘤模型类型;治疗后检测指标 阅读提示:Materials and Methods: In vivo treatment with erastin and CD44v6-specific peptides; Results: CD44v6 peptides suppress the growth and metastasis of preexisting lung cancers by reactivating ferroptosis; Figure 7 图注 |
| 临床样本分析 | 样本来源、数量和组织类型;CD44 变异体和 GPX4 表达检测方法;生存分析方法和分组标准 阅读提示:Materials and Methods: Human lung cancer samples; Survival analysis of patients with lung cancer; Results: CD44 variant–GPX4 signaling is upregulated in lung cancers and associated with poor prognosis; Figure 6 图注 |