构建诱导型APP过表达模型
在不同年龄阶段(6-18月或12-24月)可控地诱导突变APP表达,以模拟人类AD发病时机。
使用Tet-Off系统,携带tetO-APPSweInd和Camk2α-tTA双转基因小鼠,通过多西环素饲料控制APP表达,分别在6个月或12个月时停止多西环素诱导12个月,并设置持续多西环素抑制的对照组。
Selective vulnerability of the aging cholinergic system to amyloid pathology revealed by induced APP overexpression
包含行为学测试、分子生物学、转录组学和蛋白质验证等多个独立证据层级,并涉及功能验证和机制验证。
诱导型APPSweInd转基因小鼠(Tet-Off系统) C57BL/6背景双重转基因小鼠
APP诱导时间:6-18个月或12-24个月 多西环素处理:200 mg/kg饲料,抑制或诱导APP表达 行为测试:旷场、转棒、倒置网格、条件性恐惧、Morris水迷宫 胆碱能标志物检测:Chat、Slc5a7、Slc18a3的mRNA和ChAT、SLC5A7蛋白水平 RNA-seq分析:全脑转录组,FDR<0.05,性别作为协变量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在不同年龄阶段(6-18月或12-24月)可控地诱导突变APP表达,以模拟人类AD发病时机。
使用Tet-Off系统,携带tetO-APPSweInd和Camk2α-tTA双转基因小鼠,通过多西环素饲料控制APP表达,分别在6个月或12个月时停止多西环素诱导12个月,并设置持续多西环素抑制的对照组。
评估APP过表达和年龄对运动、协调、学习记忆的影响。
进行旷场试验、转棒试验、倒置网格试验、条件性恐惧试验和Morris水迷宫测试。
确定不同年龄组APP过表达是否导致淀粉样蛋白沉积差异。
通过蛋白印迹检测全长APP、APP-CTF、BACE、PS1-CTF;ELISA测量脑匀浆中Aβ40、Aβ42水平(TBS、TBS+Triton、GuHCl可溶部分);qPCR检测Aβ清除受体(Ager、Cd14、Cd36、Lrp1、Msr1、Tlr2)和降解酶(Ide、Mme)的mRNA水平。
评估APP过表达和年龄对炎症反应和自噬的影响。
通过qPCR检测炎症因子(Ifng、Il1b、Il6、Tnf、Ccl2、Ccl6);通过蛋白印迹检测自噬相关蛋白(LC3A、LC3B、ATG3、ATG5、ATG7、ATG12、Beclin-1、p62)。
无偏倚地识别由年龄和APP过表达引起的基因表达变化。
进行全脑RNA测序,鉴定差异表达基因(FDR<0.05),并通过IPA进行通路分析,重点分析细胞类型标志物表达。
验证RNA-seq发现的胆碱能基因下调是否在mRNA和蛋白质水平一致。
通过qPCR检测Chat、Slc5a7、Slc18a3的mRNA水平;通过蛋白印迹检测ChAT和SLC5A7蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物饲养 | 多西环素 | Ssniff | -- |
| 旷场试验 | EthoVision XT行为追踪系统 | Noldus | -- |
| 转棒试验 | 转棒仪 | Med Associates | -- |
| 条件性恐惧 | 近红外视频追踪系统 | Med Associates | -- |
| 蛋白质印迹 | 抗Aβ抗体(克隆6E10) | Covance | SIG-39300 |
| 抗BACE1抗体(克隆D10E5) | Cell Signaling Technology | 5606 | |
| 抗早老素1抗体(克隆D39D1) | Cell Signaling Technology | 5643 | |
| 抗LC3A抗体(克隆D50G8) | Cell Signaling Technology | 4599 | |
| 抗LC3B抗体 | Cell Signaling Technology | 2775 | |
| 抗ATG3抗体 | Cell Signaling Technology | 3415 | |
| 抗ATG5抗体(克隆D1G9) | Cell Signaling Technology | 8540 | |
| 抗ATG7抗体(克隆D12B11) | Cell Signaling Technology | 8558 | |
| 抗ATG12抗体(克隆D88H11) | Cell Signaling Technology | 4180 | |
| 抗beclin 1抗体(克隆D40C5) | Cell Signaling Technology | 3495 | |
| 抗p62抗体 | Cell Signaling Technology | 5114 | |
| 抗ChAT抗体(克隆EPR13024(B)) | Abcam | ab181023 | |
| 抗SLC5A7抗体 | Abcam | ab135043 | |
| 抗PSD95抗体 | Cell Signaling Technology | 2507 | |
| 抗突触素抗体(克隆SY38) | Abcam | ab8049 | |
| 抗GFAP抗体(克隆D1F4Q) | Cell Signaling Technology | #12389 | |
| 抗CD11b抗体(克隆E6E1M) | Cell Signaling Technology | 17800 | |
| 抗CD68抗体(克隆E3O7V) | Cell Signaling Technology | 97778 | |
| 抗Iba1/AIF-1抗体(克隆E4O4W) | Cell Signaling Technology | 17198 | |
| 抗TREM2抗体(克隆E9O9F) | Cell Signaling Technology | 59621 | |
| 抗肌动蛋白抗体(克隆C4) | MP Biomedicals | 869100 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠抗体 | Agilent | -- | |
| HRP标记的山羊抗兔抗体 | Promega | -- | |
| RNA提取 | peqGold TriFast | Peqlab | -- |
| RNeasy小提试剂盒 | Qiagen | -- | |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| qPCR | TaqMan基因表达检测 | Applied Biosystems | -- |
| StepOnePlus实时PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| AMPLIFYME SYBR通用预混液 | Blirt | -- | |
| RNA测序 | Illumina HiSeq 2000 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | APPSweInd转基因小鼠(B6.Cg-Tg(tetO-APPSweInd)102Dbo/Mmjax)与Camk2α-tTA(B6.Cg-Tg(Camk2a-tTA)1Mmay/DboJ)杂交产生双转基因后代;C57BL/6背景。 阅读提示:Materials and Methods - Animals |
| APP诱导和抑制 | 多西环素处理:饲料中200 mg/kg多西环素,用于抑制APP表达;在指定年龄(6或12个月)撤除多西环素诱导表达。 阅读提示:Materials and Methods - Doxycycline treatment, Experimental design |
| 行为测试 | 旷场(20 min)、转棒(4-40 rpm,3次/天,3天)、倒置网格(最大7 min)、条件性恐惧(0.75 mA, 2 s电击,在60和120 s,训练184 s)、水迷宫(6次/天,5天,平台直径10 cm,60 s)。 阅读提示:Materials and Methods - Open field, Rotarod, Inverted screen test, Morris water maze, Contextual fear conditioning |
| 分子检测 | 蛋白质印迹:20 μg蛋白,抗体稀释及孵育条件;ELISA:依次提取TBS、TBS+Triton、GuHCl,使用人Aβ ELISA试剂盒。 阅读提示:Materials and Methods - Immunoblotting, Aβ ELISA |
| RNA表达分析 | RNA提取:peqGold TriFast + RNeasy;RT-qPCR:500 ng RNA逆转录;TaqMan探针用于Chat、Slc5a7、Slc18a3;SYBR用于其他基因;数据用2^-ΔCt法。 阅读提示:Materials and Methods - RNA extraction, Reverse transcription and quantitative PCR |
| 转录组分析 | RNA-seq:50 bp单端,STAR比对至mm10,DESeq2分析,FDR<0.05,性别作为协变量。 阅读提示:Materials and Methods - RNA sequencing |