iPS细胞分化及表征
建立并验证从iPS细胞分化出内皮细胞、周细胞、平滑肌细胞和星形胶质细胞的方案。
分化iPS细胞为iECs、iPCs、iSMCs和iASs,通过免疫荧光、qPCR和蛋白质组学进行验证。
A fully iPS-cell-derived 3D model of the human blood-brain barrier for exploring neurovascular disease mechanisms and therapeutic interventions
包含iPS细胞分化与多组学验证、3D微流控模型构建与功能验证、CRISPR敲除与机制研究、小鼠体内表型对照及LNP治疗挽救实验,形成多个独立证据层级。
人iPS细胞来源的3D微流控血脑屏障模型 iPS细胞来源的内皮细胞(iECs) 内皮细胞特异性FOXF2敲除小鼠(Foxf2iECKO)
iPS细胞分化方案及细胞纯度 FOXF2敲除效率及克隆特异性 3D培养条件(细胞比例、基质胶、培养时间) LNP处理浓度与时间 TEER测量条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立并验证从iPS细胞分化出内皮细胞、周细胞、平滑肌细胞和星形胶质细胞的方案。
分化iPS细胞为iECs、iPCs、iSMCs和iASs,通过免疫荧光、qPCR和蛋白质组学进行验证。
构建包含所有BBB细胞类型的3D微流控模型,并验证其形态和功能特征。
将iECs、iASs与iPCs或iSMCs以一定比例混合在纤维蛋白水凝胶中,注入微流控芯片,培养形成血管样结构。
研究FOXF2缺失对BBB功能的影响。
通过CRISPR/Cas9在iPS细胞中敲除FOXF2,分化成iECs后构建3D模型,检测细胞连接、内吞、TEER和通透性等。
在体内验证FOXF2缺失的表型。
使用内皮特异性Foxf2敲除小鼠(Foxf2iECKO),分离脑微血管进行免疫荧光和电镜分析。
测试LNP递送Foxf2 mRNA是否能挽救FOXF2缺失引起的BBB缺陷。
将封装Foxf2 mRNA的LNPs灌注到3D培养物中,检测CAV1、TJP1水平和内吞活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Essential 8 Flex培养基 | Thermo Fisher Scientific | A2858501 |
| 玻连蛋白 | Thermo Fisher Scientific | A14700 | |
| Geltrex基质胶 | Thermo Fisher Scientific | A1413302 | |
| StemFlex培养基 | Thermo Fisher Scientific | A3349401 | |
| Accutase | Thermo Fisher Scientific | A1110501 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
| DMEM/F12 | Thermo Fisher Scientific | 11320033 | |
| ROCK抑制剂 | Selleckchem | S1049 | |
| IV型胶原 | Sigma-Aldrich | C5533-5MG | |
| 内皮细胞培养基 | PromoCell | C-22011 | |
| 血管内皮生长因子 | Peprotech | 100-20 | |
| 毛喉素 | Peprotech | 6652995 | |
| CDH5微珠 | Miltenyi Biotec | 130-097-867 | |
| 平滑肌细胞培养基 | Promocell | C-22062 | |
| 血小板衍生生长因子-BB | Peprotech | 100-14B | |
| 转化生长因子β1 | Peprotech | AF-100-21C | |
| 骨形态发生蛋白4 | Peprotech | AF 120-05ET | |
| 明胶 | Merck Millipore | ES-006-B | |
| DMEM/GlutaMAX | Thermo Fisher Scientific | 10566016 | |
| 胎牛血清 | Biowest | S1860 | |
| 转化生长因子β3 | Peprotech | 100-36E | |
| TrypLE | Thermo Fisher Scientific | 12604013 | |
| Neurobasal培养基 | Thermo Fisher Scientific | 211003-049 | |
| B27补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 17504044 | |
| N-2补充剂 | Thermo Fisher Scientific | 17502048 | |
| 胰岛素 | Sigma-Aldrich | 10515 | |
| 多聚鸟氨酸 | Sigma-Aldrich | P4957 | |
| 层粘连蛋白 | Thermo Fisher Scientific | 23017015 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | STEMCELL Technologies | 78003.2 | |
| 表皮生长因子 | Peprotech | 100-15-100 | |
| 白血病抑制因子 | Peprotech | 300-05-26 | |
| 睫状神经营养因子 | Peprotech | 450-13-20 | |
| 人脑微血管内皮细胞 | ScienceCell | 1000 | |
| 人脑血管周细胞 | ScienceCell | 1200 | |
| 人脑血管平滑肌细胞 | ScienceCell | 1100 | |
| 人星形胶质细胞 | ScienceCell | 1800 | |
| 人脐静脉内皮细胞 | ScienceCell | 8000 | |
| 人脑微血管内皮细胞系D3 | Merck | SCC066 | |
| TEER测量 | CellZscope系统 | Nanoanalytics | -- |
| Milicell ERS 3.0电阻仪 | Merck Milipore | -- | |
| Transwell小室 | Corning | 353095 | |
| 转运体功能测定 | 罗丹明123 | Invitrogen | R302 |
| 阿霉素 | Sigma-Aldrich | D1515-10MG | |
| DCFDA | Thermo Fisher Scientific | D399 | |
| 维拉帕米 | Sigma-Aldrich | V4629-1G | |
| Ko 143 | Sigma-Aldrich | K2144-1MG | |
| MK571 | Sigma-Aldrich | M7571-5MG | |
| 通透性测定 | 10 kDa葡聚糖 | Invitrogen | D1820 |
| 40 kDa葡聚糖 | Invitrogen | D1845 | |
| 70 kDa葡聚糖 | Invitrogen | D1864 | |
| 3D模型构建 | 凝血酶 | Sigma-Aldrich | F8630 |
| 纤维蛋白原 | Sigma-Aldrich | F8630 | |
| 微流控芯片 | AIM Biotech | DAX-1 | |
| 钙成像 | Fluo-4 | AAT Bioquest | 271-20551 |
| 内吞检测 | FM1-43FX | Thermo Fisher Scientific | F35355 |
| 霍乱毒素B亚单位 | Thermo Fisher Scientific | C22841 | |
| 炎症刺激 | 肿瘤坏死因子 | Peprotech | 300-01A-50UG |
| LNP制备 | ALC-0315 | Avanti | 890900O |
| 胆固醇 | Merck | C8667 | |
| ALC-0159 | Avanti Polar Lipids | 8801585P | |
| NanoAssemblr | Precision Nanosystems | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648-5G |
| Mygliol | Caesar & Loretz | 1115805 | |
| 蛋白提取 | TRIzol | QIAGEN | 79306 |
| RNeasy mini试剂盒 | QIAGEN | 74106 | |
| cDNA合成 | Omniscript RT试剂盒 | QIAGEN | 205113 |
| qPCR | SYBR Green预混液 | QIAGEN | 208056 |
| 蛋白质组学 | DIA-NN软件 | -- | -- |
| NanoElute纳升液相色谱 | Bruker | -- | |
| TimsTOF pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| 显微镜 | LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| LSM980共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 电子显微镜 | JEM 1400plus透射电镜 | JEOL | -- |
| Crossbeam Gemini 340扫描电镜 | Zeiss | -- | |
| RNA-seq | SOAPnuke软件 | -- | -- |
| STAR软件 | -- | -- | |
| 样本制备 | Sera-Mag SpeedBeads磁珠 | GE Healthcare | -- |
| LysC蛋白酶 | Promega | -- | |
| 胰蛋白酶 | Promega | -- | |
| Qubit蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| LNP制备 | 荧光标记DOPE | MedChemExpress | HY-D1556 |
| LNP治疗 | Foxf2 mRNA脂质纳米颗粒 | ISAR Bioscience GmbH | -- |
| tdTomato mRNA脂质纳米颗粒 | ISAR Bioscience GmbH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| iPS细胞分化 | iPS细胞系来源、分化培养基和因子浓度 阅读提示:Methods: 'Somatic cell differentiation of iPS cells' |
| 3D模型构建 | 细胞比例、凝胶成分、培养时间及培养基组成 阅读提示:Methods: 'Generation of microfluidic, 3D in vitro BBB model' |
| FOXF2敲除 | CRISPR/Cas9靶序列、编辑效率和克隆验证 阅读提示:Methods: 'CRISPR–Cas9 genome editing' |
| LNP处理 | LNP脂质组成、mRNA浓度、处理剂量和时间 阅读提示:Methods: 'LNP formulation' and 'LNP treatment in vitro' |
| 功能检测 | TEER测量参数、通透性测定所用的dextran分子量及时间点 阅读提示:Methods: 'TEER assay' and 'Dextran assay in two dimensions' |