相互作用筛选
鉴定与kindlin-3相互作用的蛋白
使用酵母双杂交筛选人cDNA文库,以kindlin-3为诱饵,发现Myl6为候选结合蛋白。
Myosin light chain 6 (Myl6) interacts with kindlin-3 and is required to support integrin αIIbβ3 activation in platelets in mice
包含体外生化结合实验、细胞水平功能实验、基因敲除小鼠模型、体内血栓与止血模型等多层级验证。
Myl6fl/flPF4-Cre小鼠 小鼠原代血小板 小鼠胎肝来源巨核细胞
Myl6在巨核细胞谱系中的敲除(PF4-Cre) 血小板计数和体积(巨血小板减少症表型) 整合素αIIbβ3激活(纤维蛋白原结合) 血小板聚集(多种激动剂) 体内止血与血栓形成(尾出血时间、FeCl3诱导颈动脉血栓)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定与kindlin-3相互作用的蛋白
使用酵母双杂交筛选人cDNA文库,以kindlin-3为诱饵,发现Myl6为候选结合蛋白。
验证kindlin-3与Myl6的直接相互作用
纯化GST-Myl6和his-kindlin-3蛋白,进行pull-down实验,SDS-PAGE和Western blot检测。
研究Myl6在血小板中的生理功能
利用CRISPR/Cas9构建Myl6 floxed小鼠,与PF4-Cre交配获得巨核细胞系特异性敲除小鼠。
探究Myl6缺失导致血小板减少的机制
检测骨髓巨核细胞数量、倍性,以及胎肝来源巨核细胞的前血小板形成能力。
评估Myl6对整合素激活和血小板功能的影响
用多种激动剂刺激Myl6缺陷血小板,检测纤维蛋白原结合、整合素配体结合、血小板聚集和铺展。
评估Myl6在止血和血栓形成中的作用
进行尾出血时间测定和FeCl3诱导的颈动脉血栓模型,同时进行ROTEM分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白结合实验 | 谷胱甘肽-琼脂糖凝胶珠 | -- | -- |
| 蛋白纯化 | MBPTrap™ HP 层析柱 | GE Healthcare | 28918778 |
| 蛋白交联 | BS(PEG)5 | ThermoFisher | A35396 |
| 蛋白纯化 | Superdex200 分子排阻层析柱 | GE Lifesciences | -- |
| 荧光标记 | Alexa Fluor 647 | ThermoFisher | A20186 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 细胞因子 | IL-3 | -- | -- |
| TPO | -- | -- | |
| 血小板功能检测 | 纤维蛋白原 | Sigma-Aldrich | F3879 |
| Alexa Fluor 647偶联的纤维蛋白原 | ThermoFisher | F35200 | |
| 整合素配体 | 3FN10 | Shanghai Peptide Biological Technology | -- |
| 蛋白表达 | pMAL-c5X载体 | -- | -- |
| 大肠杆菌Rosetta 2(DE3) | Novagen | 71397 | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 血小板制备 | PGE1 | -- | -- |
| 血小板裂解 | CelLytic M缓冲液 | Sigma | -- |
| 蛋白酶抑制 | 蛋白酶抑制剂 | Roche | -- |
| 免疫印迹 | 抗NMMHCIIA抗体 | CST | 3403 |
| 抗CD41抗体 | BD Pharmingen | 558040 | |
| 抗GPIbα抗体 | Emfret | M042-1 | |
| 抗GPIbβ抗体 | Emfret | M050-1 | |
| 抗GPIX抗体 | Emfret | M051-1 | |
| 抗GPV抗体 | Emfret | M060-1 | |
| 抗GPVI抗体 | Emfret | M011-1 | |
| 抗CD61抗体 | Emfret | M030-0 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | 23949 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| 血小板铺展实验 | 抗αIIbβ3抗体 (Leo.F2) | Emfret | -- |
| 荧光显微镜 | 尼康Ti2-E | Nikon | -- |
| 图像分析 | NIS elements | Nikon | -- |
| 血小板聚集 | Born Lumi-聚集仪 | Chrono-log Corporation | -- |
| 动物实验 | Whatman滤纸 | Whatman | -- |
| 血栓检测 | Transonic流量计 (T402) | Transonic System Inc. | -- |
| 凝血分析 | ROTEM®delta | Instrumentation Laboratory | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 整合素αIIbβ3激活检测 | 激动剂类型和浓度(PAR4肽150 μM、CRP 10 μg/ml、ADP 50 μM);纤维蛋白原结合实验条件(室温25分钟) 阅读提示:Methods 中 Platelet preparation and functional tests 部分;Figure 3B 图注 |
| 血小板聚集实验 | 激动剂种类和浓度;搅拌速度(1200 rpm);温度(37°C) 阅读提示:Methods 中 Platelet preparation and functional tests 部分;Figure 3C 和 3D |
| 巨核细胞分化与前血小板形成 | 胎肝细胞培养条件(DMEM、10% FBS、10 ng/ml IL-3、25 U/mL TPO);分化时间(4.5天);BSA浓度(1.5%和3%);纤维蛋白原包被浓度(20 μg/ml) 阅读提示:Methods 中 Megakaryocyte differentiation, PPF, and polyploid examination 部分;Figure 2G 和 2H |
| 体内血栓与止血模型 | 尾出血模型:剪尾长度(3mm);FeCl3浓度(5%)和诱导时间(3分钟);血流监测标准(闭塞定义为<0.05 ml/min) 阅读提示:Methods 中 Tail bleeding assay, FeCl3-induced carotid artery thrombosis in mice 部分;Figure 4E 和 4F |
| 血块回缩与ROTEM分析 | 凝血酶浓度(0.75 U/ml);回缩时间(120 min);ROTEM加钙浓度(0.2 M CaCl2 21 μl);检测时间(1小时) 阅读提示:Methods 中 Clot retraction 和 Rotational thromboelastometry (ROTEM) analysis 部分;Figure 4A-D |