建立TM缺失细胞模型
研究TM缺失对内皮细胞表型的影响
通过CRISPR/Cas9技术生成TM−/−的EA.hy926细胞,并通过慢病毒转导回补野生型TM(TMmatch)或胞质域突变体。
Thrombomodulin Regulates PTEN/AKT Signaling Axis in Endothelial Cells
包含细胞模型(TM−/−细胞、TM过表达、回补突变体)和动物模型(TM-KO小鼠)两个层级,并进行了功能验证(增殖、迁移、通透性)和机制验证(PTEN/AKT/FOXO1信号通路)
EA.hy926内皮细胞系(TM−/−及回补细胞) TM-KO小鼠(他莫昔芬诱导的ERcre-TMf/f小鼠)
TM−/−细胞中PTEN磷酸化水平及膜/核定位的变化 TM−/−细胞中AKT(Ser473/Thr308)和FOXO1(Ser256)的磷酸化水平 TM不同胞质域突变体(TM-des-Cyto、TM-des-CytoRKK、TMAAA)对细胞表型恢复的作用 TM-KO小鼠肝脏中PTEN/AKT信号及血管密度变化 细胞通透性、VWF释放、增殖迁移等功能指标的检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究TM缺失对内皮细胞表型的影响
通过CRISPR/Cas9技术生成TM−/−的EA.hy926细胞,并通过慢病毒转导回补野生型TM(TMmatch)或胞质域突变体。
检测TM缺失是否影响PTEN/AKT/FOXO1信号通路
通过Western blot和免疫荧光检测PTEN、p-PTEN、AKT、p-AKT、FOXO1、p-FOXO1的表达和定位。
检测TM缺失对细胞增殖、迁移、通透性和VWF释放的影响
采用MTT实验、划痕实验、内皮细胞通透性实验和ELISA检测增殖、迁移、通透性和VWF释放。
验证TM缺失在体内对PTEN/AKT信号和血管表型的影响
利用他莫昔芬诱导的TM-KO小鼠,分析肝脏组织中PTEN/AKT信号、血管密度和器官重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| HAT补充剂 | Mediatech Inc. | 25-046 | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| Western blot | 蛋白酶-磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher | -- |
| 血栓调节蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271804 | |
| 增殖细胞核抗原抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-56 | |
| GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47724 | |
| 刺激处理 | 重组人血管生成素1 | R&D | 923-AN-025 |
| 重组人血管内皮生长因子-165 | R&D | 293-VE | |
| 流式细胞术 | 大鼠抗小鼠TM抗体 | R&D | MAB3894 |
| 免疫荧光 | 山羊抗人Tie-2抗体 | R&D | AF313 |
| 流式细胞术 | 小鼠抗人TM抗体 | R&D | MAB39471 |
| 山羊抗小鼠TM抗体 | R&D | AF3894 | |
| Western blot | 磷酸化PTEN (Ser380/Thr382/383)抗体 | Cell Signaling Technology | 9554 |
| PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9188 | |
| 磷酸化AKT (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 磷酸化AKT (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4685 | |
| 磷酸化FOXO1 (Ser256)抗体 | Cell Signaling Technology | 9461 | |
| FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 | |
| Na-K ATPase抗体 | Cell Signaling Technology | 3010 | |
| ELISA | 人VWF抗体 | Dako, Agilent Technologies | A0082 |
| 流式细胞术 | PE偶联TM抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-318 |
| PE偶联小鼠同型对照抗体 | Miltenyi Biotec | 130-113-762 | |
| 免疫组织化学 | 兔抗小鼠Ki67 IgG | -- | RM-9106-S0 |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 568偶联山羊抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11011 |
| Alexa Fluor 488偶联山羊抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11008 | |
| Alexa Fluor 555偶联山羊抗大鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-21434 | |
| Alexa Fluor 488偶联山羊抗大鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11006 | |
| Alexa Fluor 568偶联驴抗山羊IgG | Thermo Fisher Scientific | A-11057 | |
| Alexa Fluor 568偶联鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 血管生成实验 | 基质胶 | Corning | 356234 |
| Western blot | β-肌动蛋白抗体 | Sigma | A5316 |
| 免疫组织化学 | DyLight-649偶联番茄凝集素 | Vector Laboratories Inc. | DL-1178-1 |
| 通透性实验 | 伊文思蓝 | -- | -- |
| 细胞迁移 | ZOE荧光细胞成像仪 | BioRad Laboratories | -- |
| Western blot | Mem-PER Plus试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NE-PER核浆蛋白提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ELISA | VWF ELISA试剂盒 | Abcam | ab108918 |
| 免疫组织化学 | 组织冷冻介质 | -- | -- |
| OCT包埋剂 | Tissue-Tek | -- | |
| Leica CM3050冷冻切片机 | Leica | -- | |
| Nikon C2共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 统计分析 | Graph Pad Prism 8.3.0 | Graph Pad Prism | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞模型建立 | TM−/−细胞系来自EA.hy926,通过CRISPR/Cas9生成;回补构建体使用慢病毒,MOI=4,polybrene浓度,嘌呤霉素筛选 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and reagents / Generation of TM-deficient EA.hy926 cells |
| 信号通路分析 | 刺激条件:Ang1 (500 ng/ml)、VEGF (50 ng/ml)处理时间,细胞融合度,蛋白提取方法 阅读提示:Materials and methods, SDS-PAGE and western blotting / 图1-4图注 |
| 细胞功能实验 | MTT细胞数、血清饥饿时间;划痕实验的BSA浓度、刺激剂浓度和处理时间;通透性实验中Evans Blue浓度、thrombin浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods, MTT Assay / Scratch wound assay / Endothelial cell permeability assay |
| 动物实验 | 小鼠基因型、他莫昔芬剂量和给药方案、组织采集时间 阅读提示:Materials and methods, TM knockout mice |