验证VEGFA对CDC6表达的诱导
确定VEGFA是否调节CDC6表达及其时间依赖性
用VEGFA、VEGFB或VEGFC处理HRMVEC不同时间,Western blot检测CDC6和MCM蛋白水平。
Novel Role of Prereplication Complex Component Cell Division Cycle 6 in Retinal Neovascularization
包含体外细胞实验(HRMVEC/MRMVEC增殖、迁移、出芽、管形成)、体内OIR模型及基因敲除/敲低和回补实验等多层级验证。
人类视网膜微血管内皮细胞(HRMVECs) 小鼠视网膜微血管内皮细胞(MRMVECs) 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型 PLCβ3基因敲除小鼠 EC特异性NFATc1缺陷小鼠(NFATc1iΔEC)
VEGFA(40 ng/ml)处理HRMVEC的时间梯度 siRNA敲低CDC6、NFATc1、PLCβ3的浓度(100 nM) OIR模型:P7至P12暴露于75%氧气,P12回到室内空气 他莫昔芬注射(P9和P10,每只100 μg)诱导内皮特异性NFATc1敲除 CDC6过表达逆转录病毒注射剂量(40 moi/0.5 μl/眼)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定VEGFA是否调节CDC6表达及其时间依赖性
用VEGFA、VEGFB或VEGFC处理HRMVEC不同时间,Western blot检测CDC6和MCM蛋白水平。
确定CDC6是否影响VEGFA诱导的内皮细胞增殖、迁移、出芽、管形成和足体形成
使用siRNA敲低CDC6,然后进行DNA合成([3H]-胸苷掺入)、伤口愈合迁移、3D出芽、管形成和足体形成实验。
确定CDC6介导的足体形成是否依赖于cortactin的酪氨酸磷酸化
检测VEGFA诱导的cortactin酪氨酸磷酸化,确定磷酸化位点,并测试cortactin Y470F突变体对CDC6结合和足体形成的影响。
确定NFATc1是否介导VEGFA诱导的CDC6表达和血管生成事件
使用siRNA敲低NFATc1,检测CDC6表达和血管生成功能;使用EC特异性NFATc1敲除小鼠进行OIR实验。
确定CDC6过表达是否能够逆转NFATc1缺陷引起的血管生成抑制
从NFATc1iΔEC小鼠分离MRMVEC,用CDC6过表达逆转录病毒感染,进行血管生成功能实验;体内将CDC6逆转录病毒注射到OIR小鼠眼中,评估视网膜新生血管。
确定PLCβ3是否在VEGFA诱导的NFATc1激活和CDC6表达中发挥作用
检测VEGFA对PLCβ3活性的影响,敲低PLCβ3检测钙释放、NFATc1核转位和血管生成功能;使用PLCβ3敲除小鼠进行OIR实验。
确定CDC6过表达是否能够逆转PLCβ3缺陷引起的血管生成抑制
在PLCβ3敲低的HRMVEC或PLCβ3-/-小鼠中过表达CDC6,检测血管生成功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮生长培养基 | Lonza | CC-4133 |
| 内皮基础培养基 | Lonza | CC-3133 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 基因敲低 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | L-3000-015 |
| 靶向人CDC6的siRNA | Thermo Scientific | s2744 | |
| 靶向人NFATc1的siRNA | Thermo Scientific | s9470 | |
| 靶向人PLCβ3的siRNA | Thermo Scientific | s10619 | |
| 靶向小鼠Cdc6的siRNA | Dharmacon | L-043543-00-0020 | |
| 靶向小鼠Nfatc1的siRNA | Dharmacon | L-054700-00-0020 | |
| 靶向小鼠Plcβ3的siRNA | Dharmacon | L-040969-01-0020 | |
| 非靶向siRNA | Dharmacon | D-001810-10 | |
| 体内基因敲低 | Invivofectamine 3.0转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | IVF3001 |
| 细胞增殖检测 | ViaStain AOPI染色液 | Nexcelom Bioscience | CS2-0106 |
| SD100计数玻片 | Nexcelom Bioscience | CHT4-SD100-014 | |
| [3H]-胸苷 | Perkin Elmer | -- | |
| Western blot | 抗CDC6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9964 |
| 抗cortactin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-55579 | |
| 抗MCM2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9839 | |
| 抗MCM3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9850 | |
| 抗MCM4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-28317 | |
| 抗MCM5抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-165995 | |
| 抗MCM6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9843 | |
| 抗MCM7抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9966 | |
| 抗PLCβ1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5291 | |
| 抗PLCβ2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-9018 | |
| 抗PLCβ3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13323 | |
| 抗PLCβ4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-166131 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5274 | |
| 抗MEK1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6250 | |
| 抗p53抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-126 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 抗磷酸化丝氨酸/苏氨酸抗体 | Abcam | ab17464 | |
| 抗HIF1α抗体 | Cell Signaling Technology | 14179 | |
| 抗PLCγ1抗体 | Cell Signaling Technology | 2822 | |
| 抗磷酸化PLCγ1 (Y783)抗体 | Cell Signaling Technology | 2821 | |
| 抗VEGFR2抗体 | Cell Signaling Technology | 2479 | |
| 抗磷酸化酪氨酸抗体 (PY20) | EMD Millipore | 05-777 | |
| 抗纽蛋白抗体 | Sigma Aldrich | V9131 | |
| 抗NFATc1抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA3-024 | |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | BD Pharmingen | 550274 |
| 异凝集素B4-594 | Molecular Probes | I21413 | |
| 鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | A12380 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠二抗 | Molecular Probes | A11034 | |
| Alexa Fluor 568标记的山羊抗兔二抗 | Molecular Probes | A11077 | |
| Alexa Fluor 568标记的山羊抗大鼠二抗 | Molecular Probes | A11077 | |
| Hoechst 3342染料 | Molecular Probes | -- | |
| Prolong Gold防淬灭封片剂 | Molecular Probes | P36930 | |
| 细胞培养 | Cytodex微载体珠 | Sigma Aldrich | C3278 |
| 纤维蛋白原 | MP Biomedicals LCC | 820224 | |
| 基质胶 | BD Biosciences | 354230 | |
| Dynabeads磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 11035 | |
| I型胶原酶 | Worthington | LS004196 | |
| 庆大霉素 | -- | -- | |
| 两性霉素B | -- | -- | |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | Sigma Aldrich | T5648 |
| 细胞功能检测 | Fluo-8 AM钙离子荧光染料 | Abcam | ab142773 |
| Fluo-8钙流检测试剂盒 | Abcam | ab112129 | |
| 凝血酶 | Sigma Aldrich | T8885 | |
| 基因过表达 | CLXSN 5myc-CDC6-WT质粒 | Addgene | 109332 |
| pCLXSN质粒 | Addgene | 12343 | |
| pCL-Eco质粒 | Addgene | 12371 | |
| pMD2.G质粒 | Addgene | 12259 | |
| 细胞处理 | 重组人VEGF165a | R&D Systems | 293-VE-010/CF |
| 重组小鼠VEGF164a | R&D Systems | 493-MV-025/CF | |
| 显微成像 | 蔡司倒置显微镜 (Axiovision Observer.z1) | Carl Zeiss | -- |
| 蔡司AxioCam MRm相机 | Carl Zeiss | -- | |
| 尼康Eclipse TS100显微镜 | Nikon | -- | |
| 尼康Digital Sight DS-L1相机 | Nikon | -- | |
| 细胞计数 | Cellometer Auto 2000细胞计数仪 | Nexcelom Bioscience | -- |
| 荧光检测 | SpectraMax Gemini XPS荧光酶标仪 | Molecular Devices | -- |
| SpectraMax Gemini XS荧光分光光度计 | Molecular Devices | -- | |
| 放射性测量 | 液体闪烁计数器 | Beckman | LS 3801 |
| 蛋白质印迹 | 增强化学发光试剂 | Amersham Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HRMVEC传代数(5-10),同步化处理(无生长因子EBM中24小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture |
| 基因敲低 | siRNA浓度(100 nmol),转染试剂(Lipofectamine 3000),转染后恢复和同步化时间 阅读提示:Materials and Methods: Transfections and infections |
| 细胞增殖检测 | VEGFA浓度(40 ng/ml),[3H]-胸苷掺入时间(18小时) 阅读提示:Materials and Methods: DNA synthesis |
| 细胞迁移检测 | 细胞接种密度(2 x 10^5 cells/ml),VEGFA处理时间(24小时),羟基脲浓度(5 mM) 阅读提示:Materials and Methods: Cell migration |
| 3D出芽实验 | 细胞包被Cytodex珠时间(6小时),VEGFA浓度(40 ng/ml),成纤维细胞浓度(2 x 10^4 cells/well),培养时间(3天) 阅读提示:Materials and Methods: Three-dimensional (3D) sprouting assay |
| 管形成实验 | 基质胶(生长因子减少),VEGFA浓度(40 ng/ml),培养时间(6小时) 阅读提示:Materials and Methods: Tube formation |
| 细胞信号检测 | VEGFA处理时间(30分钟),钙检测试剂盒(Fluo-8 AM),PLC活性检测底物(PLCglow) 阅读提示:Materials and Methods: Calcium release assay, Calcium staining, PLCβ activity |
| 动物模型 | OIR模型:P7-P12暴露于75% O2,P12回到室内空气;他莫昔芬注射剂量(100 μg/只)和时间(P9, P10);siRNA注射剂量(1 μg/0.5 μl/眼)和时间(P11-P13);逆转录病毒注射剂量(40 moi/0.5 μl/眼)和时间 阅读提示:Materials and Methods: Oxygen-induced retinopathy (OIR), Animals |
| 蛋白质印迹 | 抗体稀释比例(如anti-CDC6 1:50,anti-Ki67 1:100,anti-NFATc1 1:100),封闭条件(5%脱脂牛奶或BSA) 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting, Immunofluorescence staining |