衰老相关动脉粥样硬化模型的建立
建立模拟人类衰老相关动脉粥样硬化的动物模型,并评估PPARγ去乙酰化对斑块形成的影响。
将WT:Ldlr-/-和2KR:Ldlr-/-小鼠在标准实验室饮食下饲养至18个月,评估主动脉弓和根部斑块面积、坏死核心、体重和血浆脂质水平。
PPARγ (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor γ) Deacetylation Suppresses Aging-Associated Atherosclerosis and Hypercholesterolemia
包含体内动物模型(2KR:Ldlr-/-和2KR:Ldlr+/-)、体外BMDM实验、转录组分析(RNA-seq)等多个独立证据层级,并进行了功能验证和机制验证。
Ldlr-/-小鼠(标准饮食喂养18个月) Ldlr+/-小鼠(西方型饮食喂养16周) 骨髓源性巨噬细胞(BMDM)
小鼠模型:2KR:Ldlr-/-、2KR:Ldlr+/-及其野生型对照,雄性,周龄和饮食(标准饮食18个月或西方型饮食16周) 血浆脂质谱:总胆固醇、非HDL胆固醇、甘油三酯、NEFA、FPLC脂蛋白分布 主动脉斑块评估:主动脉弓和根部病变面积、坏死核心,使用油红O和H&E染色 巨噬细胞极化:BMDM用LPS(M1)或IL-4(M2)处理,检测CD206、Arg1、IL-10等标志物 肝脏炎症:F4/80免疫组化、IL-6 ELISA、促炎和抗炎基因表达(Q-PCR)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟人类衰老相关动脉粥样硬化的动物模型,并评估PPARγ去乙酰化对斑块形成的影响。
将WT:Ldlr-/-和2KR:Ldlr-/-小鼠在标准实验室饮食下饲养至18个月,评估主动脉弓和根部斑块面积、坏死核心、体重和血浆脂质水平。
验证PPARγ去乙酰化的降胆固醇作用不依赖于饮食和LDLR的完全缺失。
给予WT:Ldlr+/-和2KR:Ldlr+/-小鼠西方型饮食(WTD)16周,检测血浆胆固醇、脂蛋白分布、斑块和肝脏表型。
揭示PPARγ去乙酰化对肝脏基因表达的影响,尤其是炎症和代谢通路。
对老年WT:Ldlr-/-和2KR:Ldlr-/-小鼠的肝脏进行RNA测序,进行PCA、差异表达基因(DEG)分析、功能富集和GSEA分析。
评估PPARγ去乙酰化对肝脏脂肪变性、巨噬细胞浸润和炎症状态的影响。
通过H&E染色评估肝脏脂肪变性,免疫组化检测F4/80,ELISA检测血清IL-6,Q-PCR检测促炎和抗炎及纤维化基因表达。
确证PPARγ去乙酰化在巨噬细胞中诱导M2抗炎表型。
从小鼠骨髓分离BMDM,用LPS(M1)或IL-4(M2)处理,检测CD206免疫荧光、Western blot、Q-PCR检测M1/M2标记物。
验证候选机制分子Bmal1在肝脏和巨噬细胞中的上调,并初步探讨其与昼夜节律的关系。
通过Q-PCR和Western blot检测肝脏和BMDM中Bmal1的表达,并检测其他核心昼夜节律基因。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | B6.129S7-Ldlrtm1Her/J小鼠 | JAX | 002207 |
| C57BL/6J小鼠 | JAX | 000664 | |
| 动物饲养 | PicoLab Rodent 5053标准实验室饮食 | -- | -- |
| 饮食诱导模型 | 西方型饮食 (TD.88137) | Envigo | TD.88137 |
| 血浆脂质谱分析 | Infinity甘油三酯液体稳定试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| HR系列游离脂肪酸检测试剂 | Fujifilm Wako | -- | |
| 总胆固醇E检测试剂 | Fujifilm Wako | -- | |
| HDL胆固醇E检测试剂 | Fujifilm Wako | -- | |
| 血浆IL-6检测 | IL-6 ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-7064-22 |
| 脂蛋白分离 | Superdex 200 Increase 10/300GL色谱柱 | GE Healthcare | 28990944 |
| 细胞培养 | DMEM培养基(1 g/L葡萄糖) | Corning | MT10014CM |
| 细胞分化 | 重组小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | PeproTech | -- |
| 细胞刺激 | 大肠杆菌脂多糖 | Sigma | L4524 |
| 重组小鼠白介素-4 | Biolegend | 574304 | |
| 免疫组化 | 抗F4/80抗体 | Cell Signaling Technology | 70076 |
| DAB底物试剂盒 | Vector Laboratories | SK-4103 | |
| 免疫荧光 | 抗CD206抗体 | abcam | ab64693 |
| AF488荧光二抗 | Thermo Fisher Scientific | A32790 | |
| DAPI | -- | -- | |
| RNA提取 | Tri-Isolate RNA纯化试剂盒 | IBI Scientific | IB47632 |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| AzuraView GreenFast qPCR蓝染试剂 | Azura | -- | |
| 蛋白质印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- |
| 增强化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 32106 | |
| 抗BMAL1抗体 | Proteintech | 14268-1-AP | |
| 抗HSP90抗体 | Proteintech | 13171-1-AP | |
| HRP偶联抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | HRP-60008 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 衰老模型建立 | 小鼠基因型(WT:Ldlr-/- 和 2KR:Ldlr-/-)、性别(雄性)、饮食(标准实验室饮食PicoLab Rodent 5053)及饲养至18个月。 阅读提示:见Methods中的Animal Studies,结果图1相关的图注。 |
| 饮食诱导模型 | 小鼠基因型(WT:Ldlr+/- 和 2KR:Ldlr+/-)、性别(雄性)、西方型饮食成分(42%脂肪、0.2%胆固醇)及喂养时间(16周)。 阅读提示:见Methods中的Animal Studies,以及图2图注。 |
| 血浆脂质分析 | 血浆样本采集(空腹和再饲喂状态)、检测试剂盒(Total Cholesterol E、HDL-Cholesterol E等)、FPLC条件(使用Superdex 200 Increase 10/300GL,流速0.3 mL/min)。 阅读提示:见Methods中的Animal Studies和Fast-Protein Liquid Chromatography。 |
| 主动脉病变评估 | 染色方法(Oil Red O和H&E)、切片厚度(6微米)、定量方法(ImageJ)、坏死核心面积评估。 阅读提示:见Methods中的Analysis of Mouse Aortic Arch and Root Lesions。 |
| BMDM极化 | BMDM分化条件(m-CSF 50 ng/mL处理6天)、极化刺激(LPS或IL-4浓度50 ng/mL,处理24小时)、检测指标(CD206、Arg1等)。 阅读提示:见Methods中的Isolation of Bone-Marrow Derived Macrophages及图5图注。 |
| 肝脏转录组分析 | RNA测序质量控制标准(低质量reads<0.1%,接头含量<0.1%)、差异表达基因标准(log2FC>0.75,FDR<0.1)、分析工具(STAR、featureCounts、limma)。 阅读提示:见Methods中的Liver RNA sequencing and analysis。 |