验证TYMP与Lyn结合
验证TYMP是否作为信号蛋白与Lyn直接结合,以及TPI是否影响该结合。
在COS-7细胞中共表达His标记的TYMP与GST标记的Lyn SH3或SH2结构域,或全长Lyn,进行GST pull-down或His pull-down,通过Western blot检测结合。
Targeting Thymidine Phosphorylase With Tipiracil Hydrochloride Attenuates Thrombosis Without Increasing Risk of Bleeding in Mice
包含体外分子结合、血小板功能、体内血栓模型、出血评估及药物对比等多层级实验,并进行了机制验证。
C57BL/6J小鼠 Tymp基因敲除小鼠 COS-7细胞 小鼠血小板
TPI浓度及处理时间:体外孵育50 μM TPI 2-5分钟 FeCl3诱导颈动脉血栓模型:7.5% FeCl3损伤1分钟 TPI给药途径及剂量:腹腔注射17 mg/kg,静脉注射1.7 mg/kg,灌胃60 μg/kg 出血时间测定:尾部切口1厘米,观察9分钟 高脂饮食条件:Western Diet TD.88137喂养3周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TYMP是否作为信号蛋白与Lyn直接结合,以及TPI是否影响该结合。
在COS-7细胞中共表达His标记的TYMP与GST标记的Lyn SH3或SH2结构域,或全长Lyn,进行GST pull-down或His pull-down,通过Western blot检测结合。
确定TYMP缺失或药理抑制对血小板在胶原表面粘附与聚集的影响。
使用Cellix流动腔,将Rhodamine 6G标记的全血以65 dyn/cm2剪切力灌注到胶原包被的通道,观察血小板聚集;比较WT与Tymp-/-血小板,以及TPI处理组。
检测TPI对多种激动剂诱导的血小板聚集、颗粒释放和信号通路的影响。
分离小鼠血小板,用不同浓度TPI预处理后,用CRP、胶原、ADP激活,用凝集仪测量聚集;用Western blot检测AKT磷酸化,用流式细胞术检测P-选择素暴露。
评估TYMP缺乏或TPI给药在不同条件下对颈动脉血栓形成的影响。
用7.5% FeCl3损伤小鼠颈动脉,实时监测血栓形成时间;测试TPI不同给药途径和剂量,包括腹腔注射、静脉注射、灌胃,以及在正常饮食和高脂饮食条件下;比较TPI与阿司匹林、氯吡格雷的效果。
评估TPI单独或联合用药对止血功能的影响,比较与标准抗血小板药物的出血风险。
在小鼠尾部切口测量出血时间,比较TPI、阿司匹林、氯吡格雷以及低剂量联合用药的出血时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血小板聚集实验 | Chrono-log聚集仪Model 700 | Chrono-log | -- |
| Western blot | 抗磷酸化AKT抗体 (4060S) | Cell Signaling Technology | 4060S |
| 抗总AKT抗体 (2920S) | Cell Signaling Technology | 2920S | |
| 抗TYMP抗体 (4307S) | Cell Signaling Technology | 4307S | |
| 抗GST抗体 (2624S) | Cell Signaling Technology | 2624S | |
| 抗TYMP抗体 (SC-56584) | Santa Cruz Biotechnology | SC-56584 | |
| 抗Lyn抗体 (SC-7274) | Santa Cruz Biotechnology | SC-7274 | |
| 抗肌动蛋白抗体 (sc-8432) | Santa Cruz Biotechnology | sc-8432 | |
| 抗TYMP抗体 (ab180783) | Abcam | ab180783 | |
| 流式细胞术 | FITC标记的P-selectin抗体 (Cat#553744) | BD Biosciences | 553744 |
| 药物处理 | 替吡嘧啶盐酸盐 (T2366) | TargetMol | T2366 |
| 动物实验 | 罗丹明6G | -- | 989-38-8 |
| 血小板聚集 | 腺苷二磷酸 | Chrono-log | -- |
| 胶原 | Chrono-log | -- | |
| 凝血酶 | Chrono-log | -- | |
| CHRONO-LUME | Chrono-log | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Plus Universal试剂盒 (Cat# 73404) | Qiagen | 73404 |
| cDNA合成 | SuperScript VILO cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | -- |
| PCR | Platinum SuperFi II PCR预混液 | Invitrogen | -- |
| 细胞转染 | X-tremeGENE 9 DNA转染试剂 | Roche | -- |
| 蛋白纯化 | 谷胱甘肽磁珠 | GenScript | -- |
| His Mag Sepharose镍磁珠 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| 细胞裂解 | Pierce IP裂解液 | ThermoFisher Scientific | -- |
| western blot | RIPA裂解液 | ThermoFisher | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoFisher | -- | |
| 动物实验 | 柠檬酸钠 | -- | 68-04-2 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 分子结合实验 | TPI浓度:50 μM;转染后处理时间:36小时 阅读提示:Materials and Methods - Generation of fusion proteins to determine that TYMP binds to LYN through the SH3 domain |
| 血小板聚集实验 | 血小板浓度:2.5×10^8/mL;TPI预处理浓度:50 μM;激动剂:CRP 0.5 μg/mL、胶原1 μg/mL、ADP 2.5 μM;孵育时间:TPI 2分钟 阅读提示:Materials and Methods - Platelet isolation and aggregation assay |
| 血栓形成实验(FeCl3模型) | FeCl3浓度:7.5%,损伤时间:1分钟;观察时间:30分钟;TPI给药剂量和途径:腹腔注射17 mg/kg、静脉注射1.7/0.17 mg/kg、灌胃60 μg/kg 阅读提示:Materials and Methods - Murine carotid artery thrombosis model and tail bleeding assay; Figure 5 |
| 出血时间实验 | 尾部切口位置:距尖端1 cm;观察时间:9分钟;TPI剂量:0.5和1 mg/kg 阅读提示:Materials and Methods - tail bleeding assay; Figure 6C |
| 高脂饮食实验 | Western Diet TD.88137喂养3周;TD.190501(含TPI 10.7 mg/kg)喂养1周;TPI剂量约1 mg/kg/天 阅读提示:Materials and Methods - Examine the effect of TYMP inhibition on thrombosis under hyperlipidemia; Figure 5D-E |