放化疗在血液系统恶性肿瘤中的致突变影响与进化影响

Mutagenic Impact and Evolutionary Influence of Chemoradiotherapy in Hematologic Malignancies

作者信息Benjamin Diamond, Dhanvantri Chahar, Michael D Jain, Alexandra M Poos, Michael A Durante, Bachisio Ziccheddu, Marcella Kaddoura, Marios Papadimitriou, Kylee H Maclachlan, Tomas Jelinek, Faith E Davies, Nicholas B Figura, Gareth J Morgan, Elias K Mai, Katja Weisel, Roland Fenk, Marc S Raab, Saad Usmani, Ola Landgren, Frederick L Locke, Hartmut Goldschmidt, Jonathan Harry Schatz, Niels Weinhold, Francesco Maura
PMID40402512
发布时间2025-09-03
DOI10.1158/2643-3230.BCD-24-0328

摘要

电离放射治疗(RT)是一种广泛用于恶性肿瘤的治疗策略。在实体瘤中,RT诱导的双链断裂导致插入-缺失(indels;ID)的积累,其通过非同源末端连接进行的修复与存活细胞中的ID8突变特征相关。然而,RT在血液恶性肿瘤中诱导的突变程度及其对突变谱的影响以及与常用化疗药物的相互作用尚未被探索。在本研究中,我们分析了来自大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤和髓系肿瘤患者的580个全基因组测序(WGS)样本,仅在复发疾病中检测到ID8特征。但ID8在暴露于RT和诱变化疗(即铂类和美法仑)后均被检测到。通过对经处理的淋巴瘤细胞来源的单细胞克隆进行WGS,我们揭示了RT和铂类与ID8之间的剂量-反应关系。最后,利用ID8作为基因组条形码,我们证明单个RT存活细胞可能引发远处复发。意义:RT与ID8插入-缺失特征相关,但它们对血液恶性肿瘤的基因组影响尚不明确。通过利用WGS,我们将ID8与RT和诱变化疗联系起来,并验证了铂类药物可诱导ID8。我们使用ID8作为基因组条形码,揭示了RT耐药细胞可能引发系统性复发。

实验方法

产品清单

名称品牌货号
人源 CD138 微珠Miltenyi BiotecRRID:AB_3665843
手动 MACS 细胞分选仪Miltenyi BiotecRRID:AB_3665843
AllPrep 试剂盒QIAGENRRID:SCR_008539
TruSeq Nano DNA 试剂盒IlluminaRRID:SCR_010233
Illumina NovaSeq 6000 测序仪IlluminaSCR_016387
AllPrep DNA/RNA 小量提取试剂盒QIAGEN80284
TruSeq DNA PCR-Free HT 样品制备试剂盒IlluminaRRID:SCR_010233
NovaSeq 6000 测序仪IlluminaSCR_016387
PureLink 基因组 DNA 小量提取试剂盒Invitrogen--
Illumina NovaSeq X 测序仪Illumina--
Qubit 荧光计Thermo Fisher Scientific--
TapeStation 分析仪Agilent--
Covaris LE220 聚焦声波剪切仪CovarisLE220
AMPure 磁珠Beckman Coulter--
罗氏 LightCycler 定量 PCR 仪Roche--
NovaSeq X 测序仪Illumina--