受试者接种疫苗并采集样本
评估健康成人对Hecolin®疫苗的免疫应答
4名健康成人按照0、1、6月方案接受三剂次Hecolin®疫苗,并在376天内多个时间点采集血清和外周血单个核细胞(PBMCs)。
Quantitative evaluation of protective antibody response induced by hepatitis E vaccine in humans
研究包含临床试验(4名受试者)、血清学检测、单细胞抗体克隆、体外中和实验、表位作图、NGS库分析及谱系追踪等多个独立证据层级,并进行功能验证。
健康成人供者(4名) HEV疫苗Hecolin®免疫人体模型 HepG2/C3A细胞系(用于中和实验)
受试者纳入标准:19-25岁,无HEV感染或疫苗接种史 疫苗剂量和程序:0、1、6月三剂次Hecolin® 单细胞分选时间点:第三剂后1个月 中和实验细胞:HepG2/C3A NGS测序平台:Ion GeneStudio S5和Ion PGM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估健康成人对Hecolin®疫苗的免疫应答
4名健康成人按照0、1、6月方案接受三剂次Hecolin®疫苗,并在376天内多个时间点采集血清和外周血单个核细胞(PBMCs)。
测定抗HEV IgG滴度、亲和力和中和活性
使用ELISA检测抗HEV IgG滴度和亲和力,使用中和实验检测血清中和活性(ID50)。
分离p239(1)特异性单克隆抗体并分析其遗传特征
从第三剂后1个月的PBMC中,通过流式分选p239(1)阳性的记忆B细胞,进行单细胞PCR扩增并表达重组抗体。
评估单克隆抗体的结合和中和活性
使用ELISA检测抗体对p239(1)和p239(4)的结合,使用中和实验检测抗体的病毒中和能力(IC50)。
确定单克隆抗体识别的抗原位点
通过竞争ELISA和丙氨酸扫描,将抗体分配到已知的六个抗原簇(C1-C6)中。
分析疫苗诱导的B细胞库动态并追踪抗体谱系发育
从七个时间点的PBMC中提取RNA,进行5'-RACE PCR建库,在Ion GeneStudio S5和PGM上进行NGS,并利用抗体组学管道分析库特征和谱系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血清学检测 | 万泰ELISA试剂盒 | Wantai | -- |
| RT-PCR | CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- |
| C1000热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| 流式细胞术 | Aqua死细胞染色试剂盒 | Invitrogen | L34957 |
| CD3-PE-Cy7抗体 | BD Biosciences | 557851 | |
| CD19-BV786抗体 | BD Biosciences | 563325 | |
| CD27-BV650抗体 | BD Biosciences | 563228 | |
| CD20-FITC抗体 | BD Biosciences | MHCD2001 | |
| CD38-PE抗体 | BD Biosciences | 555460 | |
| 抗人IgG-BV421抗体 | BD Biosciences | 562581 | |
| Aria III分选仪 | BD Biosciences | -- | |
| 单细胞PCR | 第一链缓冲液 | Invitrogen | -- |
| 二硫苏糖醇 | Invitrogen | -- | |
| RNase抑制剂 | Invitrogen | -- | |
| Igepal去垢剂 | Sigma | -- | |
| 抗体表达 | ExpiCHO细胞 | Life Technologies | -- |
| 抗体纯化 | 蛋白A亲和层析柱 | GE Healthcare | -- |
| RNA提取 | RNeasy小型提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| 5'-RACE | SMARTer-RACE cDNA扩增试剂盒 | Clontech | -- |
| PCR纯化 | NucleoSpin PCR纯化试剂盒 | Clontech | -- |
| PCR扩增 | Platinum Taq高保真DNA聚合酶 | Life Technologies | -- |
| NGS | Ion GeneStudio S5测序仪 | Life Technologies | -- |
| Ion个人基因组测序仪 | Life Technologies | -- | |
| Ion 530芯片 | Life Technologies | -- | |
| Ion Chef系统 | Life Technologies | -- | |
| Ion 530扩展试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| PGM Hi-Q 400试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| Western blot | HRP标记的抗人IgG抗体 | Sino Biological | SSA001 |
| SuperSignal West Femto最高灵敏度底物 | Pierce | -- | |
| ELISA | HRP标记的抗人IgG抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 受试者与接种 | 受试者年龄、性别、无HEV感染史;疫苗批号;接种程序:0、1、6月;样本采集时间点 阅读提示:Methods: Participants and vaccination; Fig. 1a |
| 血清学检测 | 抗HEV IgG定量方法(WHO单位);亲和力检测中尿素浓度;中和实验的病毒株和细胞系 阅读提示:Methods: Serology testing; Fig. 1b-d |
| 单细胞分选 | 流式抗体克隆号;分选时间点(3M1);分选阈值(p239(1)阳性);单细胞PCR引物 阅读提示:Methods: Flow cytometry and single B-cell sorting; Supplementary Fig. 2 |
| 抗体表达与功能实验 | 表达系统(ExpiCHO);纯化方法;ELISA抗原浓度;中和实验的细胞密度和病毒量 阅读提示:Methods: Antibody expression, Neutralization assays, Indirect ELISA |
| NGS与谱系分析 | RNA提取量(5-10M PBMC);扩增引物;测序平台和芯片;CDRH3 identity cutoff(90%);分析软件版本 阅读提示:Methods: Sample preparation using 5'-RACE PCR, Next-generation sequencing; Supplementary Table 3 |