评估奥希替尼对CD34+白血病细胞凋亡的诱导作用
验证奥希替尼是否选择性杀伤CD34+白血病干/祖细胞。
从AML和CML患者分选CD34+细胞,用不同浓度奥希替尼处理,Annexin V/PI染色检测凋亡。
Osimertinib Covalently Binds to CD34 and Eliminates Myeloid Leukemia Stem/Progenitor Cells
包含体外原代细胞和细胞系凋亡检测、CRISPR敲除和突变回补验证、蛋白质组学、PDX模型及临床初步观察等多层级证据,并明确机制验证。
AML患者原代CD34+细胞 CML患者原代CD34+细胞 AML细胞系KG-1和Kasumi-1 AML/CML患者来源异种移植(PDX)小鼠模型
CD34+细胞分选纯度及来源 奥希替尼处理浓度和时间 CRISPR-Cas9敲除CD34及突变回补 CD34表达水平高低分组标准 患者临床反应评估指标
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证奥希替尼是否选择性杀伤CD34+白血病干/祖细胞。
从AML和CML患者分选CD34+细胞,用不同浓度奥希替尼处理,Annexin V/PI染色检测凋亡。
确定奥希替尼是否直接结合CD34及结合位点。
使用生物素标记奥希替尼与重组CD34和细胞裂解液进行pulldown;MS鉴定结合位点;分子对接模拟。
确认CD34及其半胱氨酸位点是奥希替尼功能所必需。
用CRISPR-Cas9敲除CD34,再回补WT或C199S/C177S突变体,检测奥希替尼诱导的凋亡。
探讨奥希替尼共价结合CD34后如何影响细胞内信号。
通过IP-MS鉴定CD34互作蛋白,体外激酶实验验证Src和Lyn对Y329的磷酸化,检测SFK/STAT3活性。
验证奥希替尼在体内的抗白血病效果及临床可行性。
PDX小鼠移植后给予奥希替尼,检测植入和生存;两名CD34高表达AML患者接受奥希替尼治疗。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 奥希替尼 | MedChemExpress | HY-15772 |
| 厄洛替尼 | MedChemExpress | HY-50896 | |
| 伊布替尼 | MedChemExpress | HY-10997 | |
| 柔红霉素 | MedChemExpress | HY-13062A | |
| 萨拉卡替尼 | MedChemExpress | HY-10234 | |
| Stattic | MedChemExpress | HY-13818 | |
| 坏死抑素-1 | MedChemExpress | HY-15760 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Merck/Millipore | -- |
| Western blot/流式/免疫荧光 | CD34抗体 | Abcam | ab81289 |
| Western blot | cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | #9661 |
| RIPK1抗体 | Cell Signaling Technology | #3493 | |
| p-S166-RIPK1抗体 | Cell Signaling Technology | #65746 | |
| MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | #14993 | |
| phospho-MLKL抗体 | Cell Signaling Technology | #91689 | |
| EGFR抗体 | Abcam | ab52894 | |
| 磷酸化Y1068-EGFR抗体 | Abcam | ab40815 | |
| Src抗体 | Proteintech | 60315 | |
| 磷酸化Src抗体 | Cell Signaling Technology | #6943 | |
| STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | #9139 | |
| 磷酸化STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | #9145 | |
| AKT抗体 | Proteintech | 10176 | |
| 磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4056 | |
| ERK抗体 | Proteintech | 11257 | |
| 磷酸化MAPK抗体 | Cell Signaling Technology | #4370 | |
| Lyn抗体 | Proteintech | 60211 | |
| Flag抗体 | Cell Signaling Technology | #14793 | |
| HRP标记链霉亲和素 | Beyotime | A0303 | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | #4970 | |
| 免疫荧光染色 | Alexa Fluor 488二抗 | Invitrogen Molecular Probes | A11008 |
| Alexa Fluor 555二抗 | Invitrogen Molecular Probes | A31572 | |
| 体外结合实验 | 重组人CD34蛋白 | Abcam | ab182830 |
| 重组人CD34蛋白 | Sino Biological | 10103 | |
| pulldown实验 | BeyoMag链霉亲和素磁珠 | Beyotime | P2151 |
| 坏死性凋亡阳性对照 | 坏死性凋亡诱导试剂盒TSZ | Beyotime | C1058 |
| 凋亡抑制 | Caspase抑制剂Z-VAD-FMK | Beyotime | C1202 |
| 流式分析 | 抗人CD45抗体 | Invitrogen | 11045942 |
| 抗鼠CD45抗体 | Invitrogen | 12045182 | |
| 抗人CD34抗体 | Invitrogen | 17034942 | |
| 抗人CD33抗体 | Invitrogen | 48033742 | |
| 动物实验 | NSG小鼠 | The Jackson Laboratory | RRID:BCBC_4142 |
| 测序建库 | TruSeq RNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- |
| TruSeq DNA样本制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| 测序平台 | NovaSeq平台 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 原代细胞凋亡实验 | CD34+细胞分选方法、纯度、培养条件;奥希替尼浓度梯度0.1-2 μmol/L;处理时间72小时;凋亡检测方法。 阅读提示:Materials and Methods: Patient samples and cells; Results: Figure 1 legend |
| 结合实验 | 生物素标记奥希替尼的制备方法;重组CD34蛋白来源;孵育时间、温度;竞争实验使用的未标记奥希替尼浓度。 阅读提示:Materials and Methods: Reagents and antibodies; Results: Figure 4 legend |
| 基因编辑 | CRISPR-Cas9敲除效率;回补质粒的构建;WT和突变体CD34的表达水平;处理浓度和时间。 阅读提示:Materials and Methods: Reagents and antibodies; Results: Figure 4 legend |
| 蛋白质组学 | 细胞处理浓度和时间;磷酸化肽段富集方法;质谱平台;数据分析软件。 阅读提示:Materials and Methods: Whole transcriptome RNA and target DNA sequencing and analysis; Results: Figure 3 legend |
| PDX模型 | 小鼠品系、亚致死照射剂量;植入细胞数量;处理方案;植入评估时间点。 阅读提示:Materials and Methods: AML and chronic myeloid leukemia patient-derived xenograft models; Results: Figure 7 legend |