临床关联分析
评估CaMKK2表达与乳腺癌患者预后及侵袭性基因标签的关联。
使用KM plotter分析不同亚型乳腺癌患者总体生存,利用TCGA数据分析基因标签评分。
Targeting CaMKK2 Inhibits Actin Cytoskeletal Assembly to Suppress Cancer Metastasis
包含体外细胞实验(迁移、侵袭、细胞骨架染色、机制抑制剂)和体内动物模型(两种TNBC异种移植模型及HGSOC模型)的独立证据,并进行功能缺失/恢复及药物抑制验证。
MDA-MB-231-4175细胞系 BT-20细胞系 4T1小鼠乳腺癌细胞系 SKOV3ip1卵巢癌细胞系
细胞系MDA-MB-231-4175、BT-20、HCC1954及卵巢癌细胞HOC7的CaMKK2敲低/敲除 CaMKK2抑制剂STO-609(10 μmol/L)和GSKi(1 μmol/L)处理 CaMKK2敲除后稳定回补CaMKK2或PDE1A 体内治疗剂量:STO-609(30 mg/kg)和GSKi(10 mg/kg)腹腔注射,每三天一次 异种移植模型:MDA-MB-231-4175和4T1原位接种,SKOV3ip1腹腔接种
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估CaMKK2表达与乳腺癌患者预后及侵袭性基因标签的关联。
使用KM plotter分析不同亚型乳腺癌患者总体生存,利用TCGA数据分析基因标签评分。
验证CaMKK2在癌细胞迁移和侵袭中的作用。
在多种乳腺癌和卵巢癌细胞系中进行siRNA敲低、抑制剂处理或CRISPR敲除,然后进行transwell迁移和侵袭实验。
验证CaMKK2对原发肿瘤自发转移的影响。
将MDA-MB-231-4175和4T1细胞原位接种于裸鼠乳腺脂肪垫,定期给予抑制剂,监测肿瘤生长和转移。
验证CaMKK2在卵巢癌转移中的作用。
将SKOV3ip1细胞腹腔注射裸鼠,给予STO-609治疗,评估转移负荷。
验证CaMKK2调控PDE1A-PKG1-VASP信号通路影响细胞骨架。
通过免疫印迹检测VASP磷酸化,使用PDE抑制剂、PKG抑制剂、NOS抑制剂等处理细胞,观察迁移变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| 药物处理 | STO-609 | Duke University Small Molecule Synthesis Facility | -- |
| GSK1901320 | Duke University Small Molecule Synthesis Facility | -- | |
| 离子霉素 | Cayman Chemicals | 10004974 | |
| IBMX | Enzo Life Sciences | BML-PD140 | |
| 长春西汀 | Enzo Life Sciences | BML-PD185 | |
| 西地那非 | Cayman Chemicals | 10008671 | |
| L-NNA | Millipore Sigma | N5501 | |
| L-NAME | Millipore Sigma | N5751 | |
| 细胞骨架染色 | 罗丹明-鬼笔环肽 | Thermo Fisher Scientific | R415 |
| 药物处理 | RKRARKE | Millipore Sigma | 370654 |
| KT5823 | Millipore Sigma | K1388 | |
| 基因编辑 | Lipofectamine CRISPRMAX转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | CMAX00008 |
| Cas9 2NLS核酸酶 | Synthego | -- | |
| siRNA转染 | DharmaFECT 1转染试剂 | Dharmacon | T-2001-03 |
| 细胞增殖 | Hoechst 33258 | Sigma | -- |
| 迁移实验 | Transwell小室 | Corning | 3422 |
| 侵袭实验 | Biocoat侵袭小室 | Corning | 354480 |
| 3D细胞运动 | Cell Brite Green染料 | -- | -- |
| 蛋白印迹 | Odyssey硝酸纤维素膜 | LI-COR Biosciences | 926-31092 |
| 抗CaMKK2抗体 | Abnova | H00010645-M01 | |
| 抗磷酸化AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2531 | |
| 抗AMPKα抗体 | Cell Signaling Technology | 2532 | |
| 抗磷酸化VASP (S239)抗体 | Millipore Sigma | 05-611 | |
| 抗磷酸化VASP (S157)抗体 | Cell Signaling Technology | 3111 | |
| 抗VASP抗体 | Atlas Antibodies | HPA005724 | |
| 抗PDE1A抗体 | FabGennix | PD1A-101AP | |
| 抗PDE5抗体 | Cell Signaling Technology | 2395 | |
| 抗PDE1C抗体 | Abcam | ab14602 | |
| 抗Actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| HRP标记抗小鼠IgG | Bio-Rad | 1706516 | |
| HRP标记抗兔IgG | Bio-Rad | 1706515 | |
| Western Lightning Plus ECL系统 | PerkinElmer | ORT2655 | |
| RNA提取 | RNA Aqueous Micro试剂盒 | Ambion | 1931 |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 170-7691 |
| qPCR | SYBR Green | Bio-Rad | 1725124 |
| CFX-384实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 体内实验 | D-荧光素 | -- | -- |
| IVIS Lumina XR小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗CaMKK2抗体 (HPA017389) | Sigma | HPA017389 |
| 4 Plus通用检测系统 | Biocare Medical | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源,培养基类型(DMEM或RPMI1640),FBS浓度(8%),培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods: Cells and cell culture conditions |
| 基因敲除 | sgRNA序列,Cas9与sgRNA比例(6:1),转染试剂,单克隆筛选方法 阅读提示:Materials and Methods: Generation of CaMKK2 knockout cell lines |
| siRNA敲低 | siRNA浓度(50 nmol/L),转染试剂,处理时间(48或72小时) 阅读提示:Materials and Methods: siRNA transfection |
| 迁移和侵袭实验 | 细胞数量,血清饥饿时间,transwell孔径(8 μm),迁移时间(8小时),抑制剂处理浓度和时间 阅读提示:Materials and Methods: Migration/invasion assays |
| 体内转移实验 | 小鼠品系(Athymic nude),细胞接种数量,接种部位,给药剂量和频率,肿瘤体积阈值 阅读提示:Materials and Methods: Animal studies |
| HGSOC模型 | SKOV3ip1细胞数量,接种途径,STO-609剂量和频率 阅读提示:Materials and Methods: Animal studies (HGSOC model) |
| 机制通路实验 | 抑制剂处理浓度和时间(RKRARKE 100 μmol, KT5823 5 μmol等),离子霉素浓度和处理时间 阅读提示:Materials and Methods: Reagents and Results sections for mechanism |