建立原位和自发PDAC小鼠模型
模拟PDAC原发肿瘤和转移的体内环境,评估EC-FAK缺失对肿瘤生长和转移的影响
将8661或TB32048细胞原位注射至Pdgfb-iCreERT;Fakfl/fl小鼠胰腺,或使用KPF自发模型,并通过他莫昔芬诱导EC-FAK缺失。
Suppression of Endothelial Cell FAK Expression Reduces Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Metastasis after Gemcitabine Treatment
包含多个独立证据层级:原位和自发小鼠模型、细胞系实验、磷酸化蛋白质组学、患者样本分析,并包含功能验证和机制验证。
8661小鼠胰腺癌细胞原位移植模型 TB32048小鼠胰腺癌细胞原位移植模型 KPF自发胰腺癌小鼠模型 小鼠原代肺内皮细胞 人胰腺癌患者样本
EC-FAK敲除诱导方案:他莫昔芬处理(10 mg/mL,100 μL,腹腔注射,连续两天) 吉西他滨治疗方案:75 mg/kg,腹腔注射,隔天一次,共三次 细胞系:8661和TB32048 转染或注射细胞数:原位注射1×10^3,脾内注射4×10^5 统计方法:Kaplan-Meier生存分析,Gehan-Breslow-Wilcoxon检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟PDAC原发肿瘤和转移的体内环境,评估EC-FAK缺失对肿瘤生长和转移的影响
将8661或TB32048细胞原位注射至Pdgfb-iCreERT;Fakfl/fl小鼠胰腺,或使用KPF自发模型,并通过他莫昔芬诱导EC-FAK缺失。
比较EC-FAK缺失在化疗条件下对肿瘤生长和转移的影响
对荷瘤小鼠进行吉西他滨(75 mg/kg)或生理盐水腹腔注射,隔天一次,共三次。
测定EC-FAK缺失对原发肿瘤生长、转移结节数量和大小的影响
通过MRI监测肿瘤生长,终点测量肿瘤体积和重量;通过H&E染色评估肝和肺转移结节数量和面积。
排除EC-FAK缺失通过影响血管密度、渗漏或药物递送来改变转移的可能性
通过免疫组化检测内皮黏蛋白评估血管密度;通过Hoechst染料渗漏评估血管通透性;通过LC-MS/MS检测吉西他滨及其代谢物在肿瘤和肝脏中的含量。
确定EC-FAK缺失是否影响转移的早期步骤
通过流式细胞术检测血液中CD45-Pdx1+细胞(CTC);通过脾内注射GFP标记的肿瘤细胞检测2小时归巢;通过Pdx1染色检测48小时种植和7天克隆。
鉴定EC-FAK缺失在吉西他滨处理下影响转移的信号通路
对FAK野生型和敲除的内皮细胞在不同氧条件下(常氧/低氧)和吉西他滨处理下进行磷酸化蛋白质组学分析,并验证PAK1和β-catenin磷酸化水平。
验证EC-FAK缺失通过改变血管分泌因子影响肿瘤细胞增殖
用吉西他滨处理FAKWT和FAKKO内皮细胞,收集条件培养基,添加到8661肿瘤细胞中,通过MTT实验检测增殖。
评估EC-FAK表达水平与吉西他滨治疗患者预后之间的相关性
对人PDAC肿瘤组织切片进行CD34和FAK免疫荧光共染,计算FAK阴性血管百分比,并与生存率和复发率关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 他莫昔芬 | Sigma | T5648 |
| 吉西他滨 | Gemzar | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | D6429 |
| 胎牛血清 | Sigma | F9665 | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | P4333 | |
| 免疫染色 | 抗FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 |
| 抗磷酸化PAK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 2601 | |
| 抗PAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 2602 | |
| 抗磷酸化β-连环蛋白(Ser675)抗体 | Cell Signaling Technology | 4176 | |
| 抗HSC70抗体 | Santa Cruz Biotechnology | V7C7 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Sigma | T5168 | |
| 流式细胞术 | 抗Pdx-1抗体 | Abcam | ab47383 |
| CD45-Pacific Blue偶联抗体 | BioLegend | 103125 | |
| 抗山羊Alexa Fluor 647二抗 | Invitrogen | -- | |
| Zombie Green可固定活力检测试剂盒 | BioLegend | -- | |
| 细胞标记 | CellTracker Green CMFDA | Invitrogen | C7025 |
| 组织消化 | 胶原酶P | Roche | 11213865001 |
| 裂解液 | ACK裂解液 | Gibco | A10492-01 |
| 染色 | Hoechst染料 | Thermo Fisher Scientific | 33342 |
| 免疫染色 | 抗CD31抗体 | BioLegend | 102498 |
| 抗内膜黏蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc65495 | |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | 16667 | |
| 抗Glut-1抗体 | Thermo Fisher Scientific | 37783 | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗PECAM抗体 | Agilent Dako | 76539 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 5741 | |
| 抗CD34抗体 | ZSGB-BIO | ZM-0046 | |
| 染色 | Vectashield抗淬灭封片剂 | Vector Laboratories | -- |
| Vectastain ABC试剂盒 | Vector Laboratories | PK-6200 | |
| Vectastain ABC HRP Elite试剂盒 | Vector Laboratories | PK-6100 | |
| 抗原修复液,柠檬酸基 | Vector Laboratories | H-3300 | |
| 亲和素/生物素封闭试剂盒 | Vector Laboratories | SP2001 | |
| Dako洗涤缓冲液 | Dako | S3006 | |
| 抗体稀释液 | Invitrogen/Thermo Fisher Scientific | 003218 | |
| DPX封片剂 | Sigma | 06522-500ML | |
| Prolong Gold抗淬灭封片剂 | Molecular Probes | -- | |
| 蛋白质定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质组学 | 胰酶珠(TLCK-胰酶) | Thermo Fisher Scientific | 20230 |
| OASIS-HLB固相萃取柱 | Waters | -- | |
| TiO2微珠 | Hichrom | -- | |
| 细胞增殖检测 | MTT粉末 | Invitrogen | M6494 |
| 仪器 | MRI系统(Bruker ICON 1T) | Bruker | -- |
| 超声系统(Vevo 2100) | VisualSonics | -- | |
| 流式细胞仪(BD LSRFortessa) | BD Biosciences | -- | |
| 切片扫描仪(NanoZoomer S210) | Hamamatsu | -- | |
| Pannoramic 250 Flash扫描仪 | 3D HISTECH | -- | |
| Q-Exactive plus质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| nano flow ultimate 3000 RSL纳升仪器 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Omega酶标仪 | BMG Labtech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与基因型 | 小鼠品系:Pdgfb-iCreERT;Fakfl/fl(EC-FAKKO)和对照;KPF自发模型基因型;他莫昔芬诱导方案 阅读提示:见Materials and Methods中'Genetic modified mouse models'和'In vivo treatment strategy' |
| 细胞系与培养 | 细胞系8661和TB32048的来源及培养条件(DMEM+10% FBS+1%青霉素-链霉素) 阅读提示:见Materials and Methods中'8661 and TB32048 pancreatic cancer cell lines'和'Cell culture' |
| 肿瘤接种 | 原位注射细胞数(1×10^3)和体积(10 μL Matrigel/PBS);脾内注射细胞数(4×10^5)和体积(30 μL PBS) 阅读提示:见Materials and Methods中'Pancreatic orthotopic injections'和'Intrasplenic injections' |
| 药物处理 | 他莫昔芬剂量和给药方式(10 mg/mL,100 μL,腹腔注射,连续两天);吉西他滨剂量(75 mg/kg)和给药方案(隔天一次,共三次) 阅读提示:见Materials and Methods中'In vivo treatment strategy' |
| 转移评估 | 转移结节计数和面积量化方法(H&E染色,使用Pannoramic Viewer软件) 阅读提示:见Materials and Methods中'Tumor progression and metastasis assessment' |
| 血管功能检测 | 血管密度(endomucin染色)、渗漏(Hoechst)和药物递送(LC-MS/MS)方法 阅读提示:见Materials and Methods中'Hoechst leakage'和'Gemcitabine delivery' |
| 转移早期事件检测 | CTC检测(CD45-Pdx1+)、归巢(2小时)和种植(48小时)和克隆(7天)实验方法 阅读提示:见Materials and Methods中'Circulating tumor cells'、'Homing experiment'和'Seeding and colonization experiment' |
| 磷酸化蛋白质组学 | 内皮细胞处理条件(60 nM吉西他滨,常氧或缺氧)、LC-MS/MS参数和数据检索方法 阅读提示:见Materials and Methods中'Phosphoproteomics analysis'和'Peptide identification and quantification' |
| 临床样本分析 | 患者样本处理、免疫荧光染色和FAK阴性血管定量方法 阅读提示:见Materials and Methods中'Immunostaining of human tissue'和Results'Low EC-FAK expression correlates with...' |