细胞内乙酰辅酶A增强抗肿瘤CD8+ T细胞的治疗功效

Intracellular Acetyl CoA Potentiates the Therapeutic Efficacy of Antitumor CD8+ T Cells

作者信息Snehanshu Chowdhury, Anwesha Kar, Debaleena Bhowmik, Anupam Gautam, Debashree Basak, Ishita Sarkar, Puspendu Ghosh, Deborpita Sarkar, Alvina Deka, Paramita Chakraborty, Asima Mukhopadhyay, Shikhar Mehrotra, Soumen Basak, Sandip Paul, Shilpak Chatterjee
PMID35648389
发布时间2022-07-18
DOI10.1158/0008-5472.CAN-21-4052

实验完整度

包含体外细胞培养、代谢分析(Seahorse、代谢组学)、RNA-seq、功能验证(IFNγ产生、细胞毒性)、体内肿瘤模型(EL4-OVA和B16-F10)及ACLY抑制/敲低验证,多层级证据支撑核心结论。

主要模型

小鼠CD8+ T细胞(C57BL/6) 人类CD8+ T细胞(来自健康供者) EL4-OVA淋巴瘤模型(C57BL/6小鼠) B16-F10黑色素瘤模型(C57BL/6小鼠)

重点核对

IL2或IL12(10 ng/mL)刺激CD8+ T细胞3天 TCM(80%)或卵巢癌腹水(80%)处理过夜 ACLY抑制剂BMS303141(20 μmol/L)处理 高丙酮酸(5 mmol/L)无糖培养基培养 过继转移OT-1或Pmel-1 T细胞(0.5×10^6细胞/只)至荷瘤小鼠

摘要

效应CD8+ T细胞主要依赖葡萄糖代谢来满足其生物合成和功能需求。然而,肿瘤微环境中的营养限制可导致T细胞反应低下。因此,T细胞必须获得代谢特性,使其能够在肿瘤部位维持效应功能,从而引发强烈的抗肿瘤免疫应答。在此,我们报道IL12刺激的CD8+ T细胞具有升高的细胞内乙酰辅酶A水平,并能在营养缺乏的肿瘤条件培养基(TCM)中维持IFNγ水平。药理学和代谢分析表明,IL12刺激的CD8+ T细胞中存在一个活跃的葡萄糖-柠檬酸-乙酰辅酶A循环,以ATP-柠檬酸裂解酶(ACLY)依赖的方式支持细胞内乙酰辅酶A池。细胞内乙酰辅酶A水平增强组蛋白乙酰化、脂质合成和IFNγ产生,改善了CD8+ T细胞在肿瘤中的代谢和功能适应性。ACLY的药理学抑制或基因敲低严重损害了营养受限条件下CD8+ T细胞的IFNγ产生和活力。此外,在体外高丙酮酸培养基中培养的CD8+ T细胞获得了IL12刺激的CD8+ T细胞的关键代谢特征,并在过继转移至小鼠淋巴瘤和黑色素瘤模型后表现出改善的抗肿瘤潜力。总之,本研究描绘了CD8+ T细胞在肿瘤中稳定效应功能所需的代谢配置,并提出了一种提高CD8+ T细胞过继性T细胞疗法功效的经济实惠的方法。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
IL12刺激如何赋予CD8+ T细胞在营养缺乏的肿瘤微环境中维持效应功能(IFNγ产生和抗肿瘤能力)的代谢特性?
核心机制
IL12通过上调ACLY增强葡萄糖-柠檬酸-乙酰辅酶A循环,提高细胞内乙酰辅酶A水平,进而促进组蛋白乙酰化(H3K9Ac/H3K27Ac)和脂质合成,维持IFNγ产生和细胞活力。
主要证据
IL12刺激的CD8+ T细胞在TCM中维持IFNγ产生;ACLY抑制或敲低降低乙酰辅酶A、组蛋白乙酰化和IFNγ产生;高丙酮酸培养的细胞获得类似表型;过继转移实验显示抗肿瘤效果增强。
研究意义
该研究提出通过增强线粒体丙酮酸氧化来提高细胞内乙酰辅酶A池的策略,为制备用于过继性T细胞疗法的抗肿瘤T细胞提供了一种经济实惠的方法。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

T细胞激活与分化

比较IL2和IL12刺激对CD8+ T细胞效应功能的影响

纯化小鼠或人类CD8+ T细胞,用anti-CD3/CD28和IL2或IL12激活3天,随后暴露于TCM或腹水。

2

代谢表型分析

评估IL12刺激对CD8+ T细胞糖酵解和氧化磷酸化的影响

通过Seahorse分析ECAR和OCR,使用2NBDG测量葡萄糖摄取,并进行代谢组学和稳定同位素示踪分析。

3

机制验证

验证ACLY和细胞内乙酰辅酶A在维持IFNγ产生和活力中的作用

使用ACLY抑制剂BMS303141或shRNA敲低Acly,检测乙酰辅酶A水平、组蛋白乙酰化、IFNγ产生和细胞活力。

4

脂质代谢分析

探讨乙酰辅酶A促进脂质合成和脂解在维持细胞活力和能量供应中的作用

检测脂质合成相关基因表达(Srebp1, Fasn, Acaca),BODIPY染色评估中性脂质含量,使用orlistat抑制脂解,评估细胞活力和ATP水平。

5

体内抗肿瘤效果验证

评估IL12或高丙酮酸培养的CD8+ T细胞过继转移的抗肿瘤效果

在EL4-OVA和B16-F10肿瘤模型中,过继转移OT-1或Pmel-1 T细胞,监测肿瘤生长和生存期,分析肿瘤浸润T细胞频率和IFNγ产生。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
抗小鼠CD3抗体BioXcellBE001-1
抗小鼠CD28抗体BioXcellBE0015-1
人IL-2----
重组小鼠IL-12----
RPMI-1640培养基----
胎牛血清Invitrogen--
Dynabeads未接触小鼠CD8+ T细胞分离试剂盒Invitrogen--
MycoAlert支原体检测试剂盒Lonza--
2-脱氧葡萄糖----
草酸盐----
BMS-303141----
UK5099----
奥利司他----
鱼藤酮----
寡霉素----
BD Cytofix/Cytoperm试剂盒BD Biosciences--
FoxP3染色缓冲液套装eBioscience--
BODIPY荧光染料Invitrogen--
抗小鼠CD8-AF700抗体Thermo Fisher Scientific56-0081-82
抗小鼠IFNγ-eF660抗体Thermo Fisher Scientific50-7311-82
抗人CD8-AF700抗体BD Biosciences557945
抗人IFNγ-APC抗体Invitrogen17-7319-82
乙酰化组蛋白H3 (Lys9)-Alexa Fluor 647抗体Cell Signaling Technology4481
乙酰化组蛋白H3 (Lys27)-Alexa Fluor 488抗体Cell Signaling Technology15485
TRIzol试剂Invitrogen--
iScript cDNA合成试剂盒Bio-Rad--
iTaq Universal SYBR Green SupermixBio-Rad--
CFX96实时荧光定量PCR仪Bio-Rad--
Seahorse XFe24分析仪Agilent Technologies--
2-NBDG荧光葡萄糖类似物Cayman Chemicals--
乙酰辅酶A检测试剂盒Sigma-Aldrich--
ATP生物发光检测试剂盒Sigma-Aldrich--
葡萄糖-Glo检测试剂盒Promega--
谷氨酰胺/谷氨酸-Glo检测试剂盒Promega--
乳酸-Glo检测试剂盒Promega--
Clarity Western ECL底物Bio-Rad--
SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒Cell Signaling Technology9003s
IFNγ小鼠未包被ELISA试剂盒Invitrogen--
13C6葡萄糖Cambridge Isotope Laboratories--
岛津Prominence-I高效液相色谱仪Shimadzu Corporation--
岛津三重四极杆LCMS-8045质谱仪Shimadzu Corporation--
Epigenase HDAC活性/抑制直接检测试剂盒EPIGENTEK--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen74104
Qubit HS RNA检测试剂盒InvitrogenQ32855
TapeStation RNA HS Screen胶带Agilent5067-5579
NEB Ultra II定向RNA-seq文库制备试剂盒NEBE7760L
Agencourt AMPure磁珠Beckman CoulterA63882
HS NGS片段分析试剂盒AgilentDNF-474-1000
Illumina HiSeq X测序仪Illumina--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
T细胞激活
激活用抗体浓度:anti-CD3 (5 μg/mL)、anti-CD28 (2 μg/mL);细胞因子:IL2 (100 U/mL) 或IL12 (10 ng/mL);激活时间:3天。
阅读提示:Materials and Methods中'T-cell culture condition'
TCM准备
EL-4肿瘤细胞接种量 (1×10^6) 和肿瘤收获大小 (300-400 mm^2);TCM制备:单细胞悬液1×10^7 cells/mL在完全RPMI-1640中过夜。
阅读提示:Materials and Methods中'Preparation of TCM'
体外处理
TCM浓度 (80%) 和处理时间 (过夜);抑制剂浓度:BMS303141 (20 μmol/L)、2DG (1 mmol/L)、IAA (5 μmol/L)、oxalate (20 μmol/L)、UK5099 (20 μmol/L)、orlistat (100 μmol/L) 等。
阅读提示:Materials and Methods中'T-cell culture condition'和图例
过继T细胞治疗
肿瘤细胞接种量:EL4-OVA (1×10^6) 和B16-F10 (0.5×10^6);肿瘤建立时间 (9天);T细胞转移数量 (0.5×10^6细胞/只) 和途径 (静脉注射)。
阅读提示:Materials and Methods中'Adoptive T-cell therapy protocol'
代谢通量分析
Seahorse检测细胞数量 (0.5×10^6细胞/孔);OCR和ECAR响应药物浓度:葡萄糖 (10 mmol/L)、oligomycin (1 μmol/L)、FCCP (1 μmol/L)、rotenone/antimycin A (2 μmol/L + 100 nmol/L) 等。
阅读提示:Materials and Methods中'Glucose uptake and metabolic flux assay'
乙酰辅酶A和ATP测定
细胞数量 (1×10^6细胞/组);裂解方法 (1% NP40);试剂盒:Acetyl-CoA Assay Kit (Sigma) 和ATP Bioluminescent Assay Kit (Sigma)。
阅读提示:Materials and Methods中'Acetyl CoA assay'和'ATP assay'