患者组织样本的免疫组化分析
评估不同组织学亚型子宫内膜癌中免疫细胞浸润和抗体分布。
对107例患者组织微阵列进行多重免疫荧光染色,检测CD3、CD4、CD8、CD19、CD138、pIgR、IgA、IgG等标志物,并进行空间分析。
IgA-Dominated Humoral Immune Responses Govern Patients' Outcome in Endometrial Cancer
研究主要为组织样本的免疫组化分析和细胞系RNA-seq验证,缺乏动物模型等功能验证,实验细节不足。
子宫内膜癌患者组织样本 KLE和HEC-1-A子宫内膜癌细胞系
子宫内膜癌组织样本包含四种组织学亚型,共107例 细胞系KLE和HEC-1-A IgA和IgG处理浓度0.5 μg/ml,处理时间72小时 MMR蛋白表达状态
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估不同组织学亚型子宫内膜癌中免疫细胞浸润和抗体分布。
对107例患者组织微阵列进行多重免疫荧光染色,检测CD3、CD4、CD8、CD19、CD138、pIgR、IgA、IgG等标志物,并进行空间分析。
验证IgA与pIgR结合对肿瘤细胞转录组的影响。
使用pIgR阳性HEC-1-A和pIgR阴性KLE细胞(转染pIgR)进行RNA-seq,比较IgA或IgG处理与未处理的差异。
验证关键标志物在独立队列中的预后价值。
分析TCGA UCEC数据集中PIGR、CD19、CD3表达与患者生存的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 多重免疫荧光 | OPAL 7色自动化IHC试剂盒 | PerkinElmer | -- |
| BOND RX自动染色仪 | Leica Biosystems | -- | |
| Vectra 3自动定量病理成像系统 | PerkinElmer | -- | |
| 免疫组化 | Ventana Discovery XT系统 | Ventana Medical Systems | -- |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma | -- |
| DMEM/F12培养基 | Gibco | -- | |
| McCoy's 5A培养基 | Thermo | -- | |
| 转染 | Lipofectamine-3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | ThermoScientific | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | SigmaAldrich | -- | |
| 抗pIgR抗体 | Abcam | ab96196 | |
| 抗CHOP抗体 | CST | 2895 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | CST | 5125 | |
| 流式细胞术 | DAPI活细胞染料 | ThermoScientific | -- |
| 抗CD16/32抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗人pIgR抗体 | ThermoScientific | PA5-35340 | |
| Alexa Fluor-647偶联二抗 | CST | -- | |
| BD FACS ARIA分选仪 | BD | -- | |
| RNA-seq | RNA提取试剂盒 | Qiagen | -- |
| RT-qPCR | SuperScript IV逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫组化 | 抗MLH1抗体 | Ventana | 790-5091 |
| 抗MSH2抗体 | Ventana | 790-5093 | |
| 抗MSH6抗体 | Biocare | CM265A | |
| 抗PMS2抗体 | Abcam | ab110638 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者组织分析 | 组织微阵列中每种组织学亚型的样本数,染色抗体稀释度 阅读提示:Methods: Human endometrial cancer tissue microarrays; Multiplex Immunofluorescence and Immunohistochemistry Staining Procedure |
| 细胞系处理 | KLE和HEC-1-A细胞系的培养条件,IgA和IgG处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell line, culture and transduction; RNA sequencing |
| RNA-seq分析 | 差异表达分析的阈值,GSEA使用的基因集 阅读提示:Methods: RNA sequencing; Statistical analyses |
| TCGA数据验证 | TCGA数据版本、患者数量、生存分析阈值 阅读提示:Methods: Analysis of TCGA data |