评估ceritinib单药活性
验证在具有ALK改变的HGSOC PDX模型中,ceritinib单药是否具有抗肿瘤活性。
利用具有ALK扩增、重排、突变或高表达的HGSOC PDX模型,给予ceritinib (100 mg/kg) 或对照治疗,监测肿瘤生长。
Repurposing Ceritinib Induces DNA Damage and Enhances PARP Inhibitor Responses in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
包含体外细胞实验(克隆形成、Seahorse、ROS检测)、功能验证(siRNA敲低)、机制验证(复合体I活性、DNA损伤标志物)以及体内PDX模型验证。
OVCAR-8和COV362卵巢癌细胞系 HGSOC患者来源异种移植(PDX)小鼠模型 PC3前列腺癌细胞系 MDA-MB-231乳腺癌细胞系
细胞系:OVCAR-8、COV362、PC3、MDA-MB-231 处理药物及浓度:ceritinib (1.5 μmol/L)、olaparib、veliparib、IACS-010759等 PDX模型:PH345、PH038、PH039、PH115、PH048,及其HRD状态 体内给药方案:ceritinib 100 mg/kg、olaparib 50 mg/kg,每日口服灌胃,最长9周 检测终点:OCR、ROS水平、8-oxo-dG、γH2AX、PARP trapping、肿瘤面积
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证在具有ALK改变的HGSOC PDX模型中,ceritinib单药是否具有抗肿瘤活性。
利用具有ALK扩增、重排、突变或高表达的HGSOC PDX模型,给予ceritinib (100 mg/kg) 或对照治疗,监测肿瘤生长。
在HR-proficient和HR-deficient的卵巢癌细胞系中,检测ceritinib与PARPi(olaparib、veliparib)联合是否产生协同效应。
在OVCAR-8、COV362细胞系及RAD51C敲低的OVCAR-8细胞中进行克隆形成实验,计算联合指数。
明确ceritinib通过何种机制增强PARPi的细胞毒性。
通过一系列实验排除了HR抑制和已知激酶靶点抑制,发现ceritinib抑制线粒体呼吸链复合体I,增加ROS产生,诱导氧化性DNA损伤,并证实该损伤由PARP依赖的BER途径修复。
在HGSOC PDX模型中,评估ceritinib联合olaparib的抗肿瘤效果和耐受性。
在多个具有不同HR状态的HGSOC PDX模型中,比较单独给药和联合给药的肿瘤消退情况,并检测肿瘤组织中的氧化性DNA损伤。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Millipore | -- | |
| MycoAlert支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-118 | |
| 药物处理 | 色瑞替尼 | Selleck Chemicals | -- |
| 奥拉帕尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| 维利帕尼 | Selleck Chemicals | -- | |
| IACS-010759 | Selleck Chemicals | -- | |
| Linsitinib | Selleck Chemicals | -- | |
| 顺铂 | Teva Pharmaceutical Industries | -- | |
| SL0101 | Millipore | -- | |
| siRNA转染 | siGENOME SMARTpool siRNA | Dharmacon/Horizon Discovery | -- |
| BTX ECM 830电穿孔仪 | -- | -- | |
| Seahorse分析 | Seahorse XFp细胞外流量分析仪 | Seahorse Bioscience, Agilent Technologies | -- |
| XF质膜通透剂 | Agilent Technologies | 102504 | |
| 复合体V活性检测 | ATP合酶活性微孔板检测试剂盒 | Abcam | ab109714 |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Abcam | ab83355 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Abcam | ab139476 |
| qRT-PCR | miRNeasy小提试剂盒 | Qiagen | 217004 |
| SuperScript III逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | 18080-044 | |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | 1725120 | |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| PARP捕获实验 | 亚细胞蛋白分级试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78840 |
| Western blotting | RAD51C抗体 | Novus Biologicals | NB100-177 |
| XRCC1抗体 | Epitomics | 3631-1 | |
| IRS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3407T | |
| 磷酸化IRS1 (Tyr612)抗体 | Thermo Fisher Scientific | 44-816G | |
| PARP1抗体 | Abcam | ab32138 | |
| 组蛋白H3抗体 | Cell Signaling Technology | 4499 | |
| HSP90抗体 | -- | H9010 | |
| 间接免疫荧光 | 8-oxo-dG抗体 | Trevigen | 4354-MC-050 |
| γH2AX抗体 | Millipore | 05-636 | |
| PARP抗体 | Trevigen | 4335-MC-100 | |
| Hoechst-33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 | |
| Prolong Gold抗淬灭封片剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Zeiss LSM780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| PDX研究 | SCID beige小鼠 | ENVIGO | -- |
| 利妥昔单抗 | Genentech, Inc. | -- | |
| 数据分析 | CalcuSyn软件 | Biosoft | -- |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| SAS软件 | SAS Institute Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基(RPMI-1640)、血清(8% FBS)、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Cell lines, cell culture, and drugs |
| 体外药物处理与克隆形成实验 | 细胞接种密度(OVCAR-8: 300细胞/孔;COV362: 300细胞/孔;PC3: 750细胞/孔;MDA-MB-231: 700细胞/孔)、药物浓度、处理时间(8-10天) 阅读提示:Materials and Methods, Colony formation assays; Figure 1 legend |
| 线粒体功能检测 | 细胞接种密度(Seahorse实验:OVCAR-8 6000细胞/孔,COV362 4000细胞/孔)、ceritinib浓度(1.5 μmol/L)、处理时间(12小时) 阅读提示:Materials and Methods, Seahorse assay; Figure 2 legend |
| 活性氧与DNA损伤检测 | ceritinib处理浓度和时间(ROS:12-18小时;8-oxo-dG/γH2AX/PAR:48小时)、抗体稀释比例 阅读提示:Materials and Methods, ROS assay, Indirect immunofluorescence; Figures 3 and 4 legends |
| PDX体内药效实验 | PDX模型类型(PH345, PH038, PH039, PH115, PH048)、给药剂量(ceritinib 100 mg/kg, olaparib 50 mg/kg)、给药方式(每日口服灌胃)、治疗周期(最长9周)、肿瘤测量方法(超声) 阅读提示:Materials and Methods, PDX studies; Figure 5 legend |
| 统计分析 | 统计学方法(重复测量分析、线性混合效应模型)、多重比较校正 阅读提示:Materials and Methods, PDX studies (Statistical analysis); Supplementary Table S3 |