转基因小鼠的构建与表型分析
验证SOX11和CCND1共过表达是否足以驱动MCL样淋巴瘤的发生。
将Eμ-SOX11小鼠与Eμ-CCND1小鼠杂交,生成双转基因Eμ-SOX11CCND1小鼠,通过流式细胞术、IVIS成像和组织病理学分析评估疾病发展。
The Novel Immunocompetent Eµ-SOX11CCND1 Mouse Model Phenotypically and Molecularly Resembles Human Mantle Cell Lymphoma
该研究包含转基因小鼠模型、过继转移模型、细胞系/原代细胞实验、免疫表型分析、RNA-seq和靶向测序等多个独立证据层级,并进行了功能验证(药物处理)和机制验证(信号通路分析)。
Eμ-SOX11CCND1转基因小鼠(C57BL/6背景) 过继转移小鼠模型(WT C57BL/6受体)
Eμ-SOX11和Eμ-CCND1转基因的共表达 过继转移的细胞来源和数量(第4代,100,000个细胞) 药物处理剂量(PRT382 5或10mg/kg,ibrutinib 0.21mg/mL,venetoclax 12.5mg/kg)及给药方式 免疫表型分析(CD19、CD5、CD23、PD1、PDL1等) RNA-seq分析(差异表达基因和通路)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证SOX11和CCND1共过表达是否足以驱动MCL样淋巴瘤的发生。
将Eμ-SOX11小鼠与Eμ-CCND1小鼠杂交,生成双转基因Eμ-SOX11CCND1小鼠,通过流式细胞术、IVIS成像和组织病理学分析评估疾病发展。
建立可重复的、快速发病的MCL小鼠模型,以便于治疗研究。
从Eμ-SOX11CCND1小鼠的脾脏或淋巴结分离肿瘤细胞,通过尾静脉注射或皮下注射移植到野生型受体中,连续传代以缩短发病时间。
表征MCL小鼠模型中的免疫细胞组成和免疫抑制状态。
通过光谱流式细胞术分析脾脏、外周血和肿瘤中的免疫细胞亚群,检测PD1/PDL1表达。
评估Eμ-SOX11CCND1淋巴瘤的分子特征与人类MCL的相似性。
对过继转移肿瘤细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因、通路和克隆性。
验证模型对已知MCL治疗药物的反应性。
对过继转移小鼠使用PRT382、ibrutinib和venetoclax治疗,评估生存获益。
建立获得性ibrutinib耐药的小鼠模型以研究耐药机制。
将对ibrutinib中等敏感的小鼠肿瘤细胞传代,并持续ibrutinib暴露,直至产生耐药。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体内成像 | 转铁蛋白-Vivo 750 | PerkinElmer | NEV10091 |
| 细胞冻存 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | 22G096 |
| 流式分析 | Fc受体阻断剂 | Biolegend | 101319 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | ThermoFisher | 15596026 |
| RNA测序文库制备 | NEBNext超方向RNA文库制备试剂盒(Illumina) | NEB | E7420 |
| RNA测序 | NovaSeq X Plus测序仪 | Illumina | -- |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶/磷酸酶抑制剂 | Fisher Scientific | PI78441 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | A55864 | |
| 丽春红S | Thermo Scientific | A40000279 | |
| SOX11抗体 | Abcam | 234996 | |
| CyclinD1抗体 | Cell Signaling Technologies | 2978 | |
| Vinculin抗体 | Cell Signaling Technologies | 4650 | |
| ECL化学发光底物 | Pierce | -- | |
| 细胞分选 | EasySep小鼠B细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19854 |
| 药物处理 | 伊布替尼 | MedChem Express | HY-10997 |
| 维奈克拉 | MedChem Express | HY-15531 | |
| PRT382 | Prelude Therapeutics | -- | |
| 甲基纤维素 | MP BioMedicals | 155492 | |
| 吐温80 | Fisher | T164-500 | |
| 乙醇 | Sigma Aldrich | E7023 | |
| 聚乙二醇400 | Fisher | P167-1 | |
| Phosal 50 PG | MedChemExpress | HY-Y1903 | |
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 抗小鼠IgM | Jackson ImmunoResearch | 115-006-075 | |
| 免疫印迹 | BTK抗体 | Cell Signaling Technology | 56044S |
| 磷酸化BTK (Y223)抗体 | Cell Signaling Technology | 8757S | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 2920S | |
| 磷酸化AKT (S373)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| MTAP抗体 | Cell Signaling Technology | 62765 | |
| BCL-XL抗体 | Cell Signaling Technology | 2764T | |
| α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 3873S | |
| 靶向测序 | Ion AmpliSeq文库制备试剂盒 | Life Technologies | 4475345 |
| Ion Express条形码接头 | Life Technologies | 4471250 | |
| Agencourt AMPure XP纯化试剂盒 | Beckman Coulter | A63881 | |
| Ion文库TaqMan定量试剂盒 | Applied Biosystems | 44688022 | |
| Ion 540 Chef试剂盒 | Life Technologies | A30011 | |
| 540芯片试剂盒 | Life Technologies | A27766 | |
| Sanger测序 | Phusion高保真DNA聚合酶 | -- | -- |
| QIAquick PCR纯化试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 细胞分选 | 死细胞去除试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-090-101 |
| 组织处理 | Leica Peloris组织脱水机 | Leica Biosystems | -- |
| Leica ST5020自动染色机 | Leica Biosystems | -- | |
| 免疫组织化学 | intelliPATH FLX自动染色仪 | BioCare Medical | -- |
| 显微镜 | Olympus BX53显微镜 | Olympus | -- |
| 成像 | Caliper IVIS 200成像系统 | Caliper Life Sciences | -- |
| 流式细胞术 | Fortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Cytek Aurora光谱流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| 定量PCR | QuantStudio 7实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| RNA质控 | Qubit 4荧光计 | ThermoFisher | Q33238 |
| Agilent TapeStation HS DNA分析系统 | Agilent | 5067-5585 | |
| 蛋白电泳 | Mini-Protean TGX预制胶 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白转印 | 硝酸纤维素膜 | Roche | -- |
| 蛋白检测 | ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad | -- |
| 细胞冻存 | 冻存液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 转基因小鼠模型构建 | Eμ-SOX11和Eμ-CCND1转基因的构建方法,遗传背景(C57BL/6J) 阅读提示:Materials and Methods: Transgenic Mouse Model |
| 过继转移模型 | 供体细胞来源(脾脏或淋巴结)、细胞数量(初始10^6,后续100,000)、受体照射(200cGy,仅前两代)、注射途径(尾静脉或皮下) 阅读提示:Materials and Methods: Adoptive Transfer |
| 药物处理 | 药物剂量、给药途径、给药时间(具体见结果部分) 阅读提示:Materials and Methods: Small Molecule Dosing and Conditioning; Results: Targeted therapies |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号、荧光标记、染色条件、仪器设置 阅读提示:Materials and Methods: Flow Cytometry; Supplemental Tables 1-2 |
| RNA-seq分析 | 测序平台、文库制备方法、比对和差异表达分析的参数 阅读提示:Materials and Methods: RNA sequencing and analysis |