建立HNO-ALI模型
从婴儿和成人鼻腔样本建立分化后的假复层纤毛上皮模型。
从4名婴儿和4名成人的鼻洗液和拭子中分离细胞,经3D扩增后播种于Transwell,分化21天形成HNO-ALI。
Infant-derived human nasal organoids exhibit relatively increased susceptibility, epithelial responses, and cytotoxicity during RSV infection
包含离体鼻类器官模型(4婴儿vs4成人),多时间点病毒动力学、细胞因子、细胞损伤、细胞组成及统计建模,验证了感染易感性、免疫反应和损伤机制。
人鼻类器官-气液界面(HNO-ALI)培养(婴儿和成人来源)
婴儿4例和成人4例HNO-ALI系 感染RSV/A/ON和RSV/B/BA,MOI 0.01 时间点1、2、5、8天(HNO-ALI 2额外10天) 检测病毒RNA、PFU、24种细胞因子、LDH、caspase 3/7、细胞组成 统计模型调整年龄、时间、病毒、细胞表面
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从婴儿和成人鼻腔样本建立分化后的假复层纤毛上皮模型。
从4名婴儿和4名成人的鼻洗液和拭子中分离细胞,经3D扩增后播种于Transwell,分化21天形成HNO-ALI。
检测婴儿和成人上皮对RSV的易感性和复制动力学。
以MOI 0.01的RSV/A/ON和RSV/B/BA感染HNO-ALI顶端,并在1、2、5、8天采集样本。
比较婴儿和成人HNO-ALI中病毒RNA和感染性病毒颗粒的动力学。
通过RT-PCR检测病毒RNA拷贝数,并通过噬斑实验测定PFU。
分析感染后上皮分泌的细胞因子和趋化因子谱。
使用Luminex面板测量24种细胞因子/趋化因子,并基于功能分组比较。
比较婴儿和成人上皮在RSV感染后的细胞损伤和凋亡。
测量LDH(细胞损伤)和caspase 3/7活性(凋亡)。
评估RSV感染对不同上皮细胞类型和结构的影响。
通过免疫荧光染色并定量纤毛、杯状细胞、棒状细胞、基底细胞和黏液面积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞消化 | 胶原酶 | Sigma | C9407 |
| 细胞培养 | 基质胶 | Corning | -- |
| Transwell小室 | Corning | -- | |
| 表皮生长因子 | Peprotech | AF-100-15 | |
| Y-27632 | -- | -- | |
| PneumaCult-ALI培养基 | STEMCELL Technologies | -- | |
| 病毒RNA提取 | QIAcube自动化平台 | Qiagen | -- |
| 细胞因子检测 | Milliplex细胞因子/趋化因子磁珠面板 | Millipore | -- |
| Luminex xPONENT软件 | -- | -- | |
| MAGPIX仪 | -- | -- | |
| LDH检测 | 细胞毒性检测试剂盒 | Roche Applied Science | -- |
| LDH标准品 | L-乳酸脱氢酶 | Roche Applied Science | -- |
| Caspase检测 | Caspase-Glo-3/7试剂盒 | Promega | -- |
| Synergy H1酶标仪 | Agilent Technologies | -- | |
| 固定 | image-iT固定液 | -- | FB002 |
| 免疫荧光 | 抗KRT5抗体 | BioLegend | 905503 |
| 抗SCGB1A1抗体 | Santa Cruz | sc-9773 | |
| 抗乙酰化α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-23950 | |
| 抗黏蛋白5AC抗体 | Invitrogen | 45M1 | |
| 抗RSV抗体 | Abcam | ab20745 | |
| 驴抗小鼠488 | Invitrogen | A-21202 | |
| 驴抗兔568 | Invitrogen | A-10042 | |
| 驴抗山羊647 | Invitrogen | A-21447 | |
| Vectashield Plus封片剂 | Vector Laboratories | H-1900 | |
| 显微镜 | Cytiva DVLive显微镜 | Cytiva | -- |
| 奥林巴斯IX83显微镜 | Olympus | -- | |
| 尼康CiL明场显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HNO-ALI建立 | 细胞系数量(4婴儿、4成人)、供体年龄(婴儿<2岁,成人39-65岁)、消化液成分(胶原酶等)、Matrigel包被、细胞密度、分化时间(21天) 阅读提示:Methods: HNO-ALI cell lines |
| 病毒感染 | RSV株(RSV/A/ON、RSV/B/BA)、MOI(0.01)、感染时间(1.5小时)、体积(30μl/孔) 阅读提示:Methods: Viral infection |
| 病毒动力学 | 时间点(1、2、5、8天)、采样方法(顶端和基底外侧)、PCR靶标、噬斑实验、检测限 阅读提示:Methods: PCR and plaque assays; Figure 1 legends |
| 细胞因子检测 | 24种细胞因子、Luminex面板(Milliplex)、时间点、标准化方法(Z-score) 阅读提示:Methods: Cytokine and chemokine assay; Figure 2 legends |
| 细胞损伤和死亡 | LDH检测方法(Cytotoxic Detection Kit)、caspase 3/7检测(Caspase-Glo-3/7)、时间点 阅读提示:Methods: Lactate dehydrogenase (LDH) and cleaved caspase assays; Figure 3 legends |
| 细胞组成分析 | 免疫荧光抗体(KRT5、SCGB1A1、Muc5AC、乙酰化微管蛋白、RSV)、定量方法(Fiji)、时间点 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry (IHC) and Immunofluorescence staining; Immunofluorescence image quantification and analysis |
| 统计分析 | 模型(线性、分数logit、泊松)、调整因素(年龄、时间、病毒、细胞表面)、显著性阈值(p<0.05) 阅读提示:Methods: Statistical Analysis |