患者样本GCSF及GCSFR表达分析
评估结肠癌组织中GCSF和GCSFR的表达水平及其与正常组织的差异。
用免疫组化和数字图像分析分别定量UNM队列(n=206)和OUHSC队列(n=119)中GCSF、GCSFR、CD4、CD8的表达。
G-CSF Is a Novel Mediator of T-Cell Suppression and an Immunotherapeutic Target for Women with Colon Cancer
包含患者样本IHC、血清分析、PBMC功能实验、小鼠存活及CyTOF免疫分型等多个独立验证层级。
MC38小鼠腹膜转移癌模型(C57Bl/6J) 人结肠癌患者样本(UNM和OUHSC队列) 人原代PBMC来源的CD8+ T细胞
患者队列(UNM n=206,OUHSC n=119)的组织和血清样本 MC38腹腔注射剂量(1×10^5)和αGCSF处理剂量(25 μg/鼠) αGCSF处理时间(Day 3起隔日一次共5次;Day 9起每周3次) T细胞离体GCSF处理浓度(10 ng/ml)和IFNγ刺激条件(PMA/离子霉素) CyTOF分析中CD45+单细胞和CD3+门控
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估结肠癌组织中GCSF和GCSFR的表达水平及其与正常组织的差异。
用免疫组化和数字图像分析分别定量UNM队列(n=206)和OUHSC队列(n=119)中GCSF、GCSFR、CD4、CD8的表达。
探讨血清GCSF水平与不良预后标志物及T细胞浸润的关系。
用多重微球阵列检测OUHSC队列(n=119)术前血清中GCSF及VEGF、IL4、IL10、IL6、IL8水平,并分析与肿瘤浸润T细胞的相关性。
验证慢性GCSF暴露对T细胞IFNγ产生的影响。
从健康供体和患者PBMC中分离CD8+ T细胞,在GCSF(10 ng/ml)存在下培养7天,用PMA/离子霉素刺激后流式检测IFNγ。
评估αGCSF治疗对晚期腹膜转移结肠癌生存的影响。
C57Bl/6J小鼠腹腔注射MC38细胞(1×10^5),Day 9开始每周3次给予αGCSF或同型对照(25 μg/鼠),监测生存至临床终点。
揭示αGCSF治疗对TME中免疫细胞组成和功能的影响。
在Day 14(治疗5次后)取肿瘤,通过CyTOF和流式分析CD45+细胞中CD3、CD4、CD8、NK、巨噬细胞等亚群,并检测IFNγ反应。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | GCSF抗体 | Abcam | ab9691 |
| GCSFR抗体 | Atlas Antibodies | HPA048086 | |
| CD8抗体 | Abcam | ab75129 | |
| CD4抗体 | Abcam | ab133616 | |
| 血清分析 | 人多重磁珠阵列 | Millipore Sigma | HCYTMAG-60K-PX30 |
| 小鼠多重磁珠阵列 | Millipore Sigma | MCYTMAG-70K-PX32 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | PurMa Biologics | P3S10109-500 |
| 胎牛血清 | PurMa Biologics | P3302 | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| L-谷氨酰胺 | Corning | 25-005-CI | |
| 动物实验 | αGCSF抗体 | R&D | MAB414 |
| IgG1同型对照 | R&D | MAB005 | |
| 组织处理 | gentleMACS组织解离器 | Miltenyi Biotec | 130-093-235 |
| Liberase TM | Roche | 05401135001 | |
| DNase I | Quantabio | 95150-100 | |
| 流式细胞术 | 人T细胞阴性选择试剂盒 | STEMCELL | 17951 |
| T细胞扩增培养基 | Gibco | A1048501 | |
| PMA | -- | -- | |
| 离子霉素 | -- | -- | |
| CD4-BV650 | BDBiosciences | 9122894 | |
| CD8-APC-Cy7 | Biolegend | B283110 | |
| IFNy-BV421 | BDBiosciences | 8144795 | |
| Stratedigm S1400Exi流式细胞仪 | Stratedigm | -- | |
| CyTOF | EasySep小鼠TIL阳性选择试剂盒 | STEMCELL | 100-0350 |
| 顺铂 | Fludigim | 201064 | |
| Human TruStrain FcX | Biolegend | 422301 | |
| Maxpar细胞染色缓冲液 | Fluidigm | 201066 | |
| 核抗原染色缓冲液 | Fluidigm | 201063 | |
| Intercalator-Ir | Fluidigm | 201192A | |
| Maxpar固定和通透缓冲液 | Fluidigm | 201067 | |
| EQ微球 | Fluidigm | 201078 | |
| Helios质谱流式细胞仪 | Fluidigm | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 免疫组织化学 | 抗体克隆和稀释度、抗原修复条件、染色平台(Ventana Discovery) 阅读提示:Materials and Methods 中的 Immunohistochemistry 部分 |
| 血清分析 | 多重磁珠阵列试剂盒(Millipore Sigma)型号和样本处理 阅读提示:Materials and Methods 中的 Multiplex profiling 部分 |
| PBMC培养与T细胞功能 | GCSF浓度(10 ng/ml)、培养时间(7天)、PMA/离子霉素浓度(50 ng/ml和1 μg/ml) 阅读提示:Materials and Methods 中的 Flow cytometry and antibodies 部分 |
| 小鼠模型(生存) | MC38细胞剂量(1×10^5)、起始时间(Day 9)、给药剂量(25 μg/鼠)、每周3次 阅读提示:Materials and Methods 中的 Survival model 部分 |
| 小鼠模型(CyTOF) | MC38剂量(1×10^5)、处理方案(Day 3开始隔日一次共5次)、CyTOF抗体panel 阅读提示:Materials and Methods 中的 Defined endpoint model 和 CyTOF 部分 |