评估疗效和患者分组
确定抗PD-1联合抗血管生成治疗在恶性胸膜间皮瘤中的疗效,并根据6个月持久临床获益(DCB)对患者分组。
30例患者接受帕博利珠单抗200 mg Q3W和尼达尼布150 mg b.i.d.治疗,通过RECIST 1.1评估肿瘤反应,根据6个月时PR或SD定义DCB。
Genomic Instability and Protumoral Inflammation Are Associated with Primary Resistance to Anti-PD-1 + Antiangiogenesis in Malignant Pleural Mesothelioma
该研究包含患者临床试验、新鲜肿瘤活检的流式细胞术、RNA-seq、WES和FISH等多层级验证,并进行了功能验证和机制探索。
恶性胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 血液样本 新鲜肿瘤活检组织
使用帕博利珠单抗200 mg Q3W和尼达尼布150 mg b.i.d.治疗 在D -7开始尼达尼布单药导入期,7天后加用帕博利珠单抗 在基线和治疗期间收集血液和肿瘤活检样本 根据RECIST 1.1评估6个月时的持久临床获益(DCB) 通过流式细胞术分析新鲜肿瘤组织中的免疫细胞浸润
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定抗PD-1联合抗血管生成治疗在恶性胸膜间皮瘤中的疗效,并根据6个月持久临床获益(DCB)对患者分组。
30例患者接受帕博利珠单抗200 mg Q3W和尼达尼布150 mg b.i.d.治疗,通过RECIST 1.1评估肿瘤反应,根据6个月时PR或SD定义DCB。
比较有DCB和无DCB患者在治疗前肿瘤和血液中免疫细胞和细胞因子的差异。
通过流式细胞术分析新鲜肿瘤活检和血液样本,检测T细胞亚群、细胞因子分泌;通过RNA-seq分析肿瘤转录组。
探索原发性耐药的肿瘤体细胞基因组特征。
对肿瘤活检样本进行全外显子测序和FISH分析,评估体细胞拷贝数改变(SCNA)和染色体9改变。
评估基因组不稳定性与IL6等炎症标志物的相关性。
将SCNA评分与血浆IL6水平进行线性相关分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫表型分析 | 抗CD3/BUV395抗体 | BD Biosciences | 563546 |
| 抗CD4/BUV496抗体 | BD Biosciences | 564651 | |
| 抗CD45/BUV805抗体 | BD Biosciences | 612891 | |
| 抗PD-1/BV421抗体 | BD Biosciences | 564323 | |
| 抗OX40/BV650抗体 | BD Biosciences | 563658 | |
| 抗CD39/FITC抗体 | BD Biosciences | 561444 | |
| 抗HLA-DR/PerCP5.5抗体 | BD Biosciences | 551764 | |
| 抗CTLA4/PE抗体 | BD Biosciences | 555853 | |
| 抗41BB/PECF594抗体 | BD Biosciences | 309826 | |
| 抗CD25/PECy7抗体 | Beckmann Coulter | A52882 | |
| 抗TIGIT/APC抗体 | BioLegend | 17-9500-41 | |
| 抗HLA-ABC/AF700抗体 | BioLegend | 311438 | |
| 抗CD8/APC-H7抗体 | BD Biosciences | 560179 | |
| Zombie Aqua固定活力试剂盒 | BioLegend | 423101 | |
| 细胞因子检测 | Bio-Plex Pro人趋化因子检测试剂盒(40重) | Bio-Rad | 171AK99MR2 |
| 血管生成因子检测试剂盒1(人) | Meso Scale Discovery | K151P3S-1 | |
| 人PD-1和PD-L1抗体套装 | Meso Scale Discovery | F214A-3, F214C-3 | |
| Atellica IM白细胞介素6检测试剂盒 | Siemens Healthineers | -- | |
| 免疫组化 | Ventana Benchmark Ultra平台 | Ventana | -- |
| Ventana Discovery Ultra平台 | Ventana | -- | |
| FISH | ZytoLight SPEC CDKN2A/CEN 9双色探针 | ZytoVision | -- |
| RNA提取与质控 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA建库 | SureSelect自动化链特异性RNA文库制备试剂盒 | Agilent | -- |
| Bravo自动化液体处理平台 | Agilent | -- | |
| RNA测序 | NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 全外显子测序 | Covaris E220超声波破碎仪 | Covaris | -- |
| SureSelect临床研究2外显子捕获试剂盒 | Agilent | -- | |
| 流式分析 | BD Fortessa X20流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Gallios流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床试验设计 | 尼达尼布150 mg b.i.d.,帕博利珠单抗200 mg Q3W,尼达尼布单药导入7天后联合治疗;患者须为晚期胸膜间皮瘤,既往至少一线铂类化疗,未接受过免疫检查点阻断和尼达尼布。 阅读提示:Methods: Study Design, Patients |
| 疗效评估 | 采用RECIST 1.1评估肿瘤反应,每6周一次;DCB定义为6个月时CR、PR或SD。 阅读提示:Methods: Outcomes, 图1C-E |
| 新鲜肿瘤活检处理 | 肿瘤活检置于生理盐水中,孵育至少30分钟后收集分泌组;机械解离后用于流式细胞术。 阅读提示:Methods: Analyses of Tumor-Infiltrating Immune Cells from Biopsies by Flow Cytometry |
| 细胞因子检测 | 使用Bio-Plex 200系统进行多重检测,IL6用Siemens Atellica IM1600确认,样本检测双份取均值。 阅读提示:Methods: Cytokine, Chemokine, and Soluble Angiogenic Factor Measurements |
| 基因组分析 | WES和FISH检测SCNA和9p21改变;SCNA评分计算基于ASCAT的绝对拷贝数。 阅读提示:Methods: Whole-Transcriptome RNA-seq, Somatic and Germline WES, WES Analyses |