基因组不稳定性与促肿瘤炎症与恶性胸膜间皮瘤对抗PD-1+抗血管生成治疗的原发性耐药相关

Genomic Instability and Protumoral Inflammation Are Associated with Primary Resistance to Anti-PD-1 + Antiangiogenesis in Malignant Pleural Mesothelioma

作者信息François-Xavier Danlos, Matthieu Texier, Bastien Job, Severine Mouraud, Lydie Cassard, Capucine Baldini, Andrea Varga, Andrey A Yurchenko, Audrey Rabeau, Stéphane Champiat, Diane Letourneur, Delphine Bredel, Sandrine Susini, Yuna Blum, Aurelien Parpaleix, Cedric Parlavecchio, Lambros Tselikas, Jean-Eudes Fahrner, Anne-Gaelle Goubet, Mathieu Rouanne, Saloomeh Rafie, Alae Abbassi, Ines Kasraoui, Marie Breckler, Siham Farhane, Samy Ammari, Salim Laghouati, Anas Gazzah, Ludovic Lacroix, Benjamin Besse, Nathalie Droin, Marc Deloger, Sophie Cotteret, Julien Adam, Laurence Zitvogel, Sergey I Nikolaev, Nathalie Chaput, Christophe Massard, Jean-Charles Soria, Carlos Gomez-Roca, Gerard Zalcman, David Planchard, Aurelien Marabelle
PMID36669143
发布时间2023-04
DOI10.1158/2159-8290.CD-22-0886

实验完整度

该研究包含患者临床试验、新鲜肿瘤活检的流式细胞术、RNA-seq、WES和FISH等多层级验证,并进行了功能验证和机制探索。

主要模型

恶性胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 血液样本 新鲜肿瘤活检组织

重点核对

使用帕博利珠单抗200 mg Q3W和尼达尼布150 mg b.i.d.治疗 在D -7开始尼达尼布单药导入期,7天后加用帕博利珠单抗 在基线和治疗期间收集血液和肿瘤活检样本 根据RECIST 1.1评估6个月时的持久临床获益(DCB) 通过流式细胞术分析新鲜肿瘤组织中的免疫细胞浸润

摘要

癌症免疫治疗联合疗法最近已被证明能改善晚期间皮瘤的总生存期,尤其是对治疗有应答的患者。我们旨在通过在多中心PEMBIB试验(NCT02856425)中测试帕博利珠单抗(一种抗PD-1抗体)和尼达尼布(一种泛抗血管生成酪氨酸激酶抑制剂)的组合,来表征恶性胸膜间皮瘤对免疫治疗和抗血管生成治疗原发性耐药的生物学相关因素。30例晚期恶性胸膜间皮瘤患者接受了治疗和探索。意外的是,我们发现在治疗期间,难治性患者通过肿瘤释放的CXCL9在肿瘤中积极招募CD3+CD8+细胞毒性T细胞。然而,这些患者的肿瘤显示高水平的体细胞拷贝数改变,这些改变与血液和肿瘤中高水平的IL6和CXCL8相关。这些促炎细胞因子导致肿瘤分泌更高水平的VEGF和肿瘤中调节性T细胞的富集。晚期间皮瘤应进一步受益于适应其肿瘤生物学的分层联合治疗。 意义: 对新鲜肿瘤活检的序贯探索表明,间皮瘤对抗PD-1+抗血管生成治疗的耐药并非由于肿瘤缺乏T细胞浸润,而是由于肿瘤的适应性免疫抑制通路,涉及可被靶向治疗的分子(如IL6、CXCL8、VEGF和CTLA4)。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
恶性胸膜间皮瘤对抗PD-1联合抗血管生成治疗的原发性耐药的生物学相关因素是什么?
核心机制
原发性耐药与肿瘤基因组不稳定性(以高SCNA为特征)相关,导致IL6和CXCL8高表达,进而促进VEGF分泌和调节性T细胞肿瘤浸润,形成免疫抑制微环境,尽管存在CD8+ T细胞浸润。
主要证据
基于PEMBIB试验中30例患者的血液和肿瘤样本分析,发现SCNA评分与血浆IL6水平相关,且IL6/CXCL8/VEGF水平在无DCB患者中升高,伴随肿瘤中Treg细胞增多。
研究意义
研究表明间皮瘤的耐药并非由于缺乏T细胞浸润,而是由肿瘤的适应性免疫抑制通路驱动,涉及可靶向治疗的分子(如IL6、CXCL8、VEGF和CTLA4),为分层联合治疗提供了依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

评估疗效和患者分组

确定抗PD-1联合抗血管生成治疗在恶性胸膜间皮瘤中的疗效,并根据6个月持久临床获益(DCB)对患者分组。

30例患者接受帕博利珠单抗200 mg Q3W和尼达尼布150 mg b.i.d.治疗,通过RECIST 1.1评估肿瘤反应,根据6个月时PR或SD定义DCB。

2

分析治疗前后的免疫特征

比较有DCB和无DCB患者在治疗前肿瘤和血液中免疫细胞和细胞因子的差异。

通过流式细胞术分析新鲜肿瘤活检和血液样本,检测T细胞亚群、细胞因子分泌;通过RNA-seq分析肿瘤转录组。

3

分析肿瘤基因组改变

探索原发性耐药的肿瘤体细胞基因组特征。

对肿瘤活检样本进行全外显子测序和FISH分析,评估体细胞拷贝数改变(SCNA)和染色体9改变。

4

关联基因组特征与炎症标志物

评估基因组不稳定性与IL6等炎症标志物的相关性。

将SCNA评分与血浆IL6水平进行线性相关分析。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
抗CD3/BUV395抗体BD Biosciences563546
抗CD4/BUV496抗体BD Biosciences564651
抗CD45/BUV805抗体BD Biosciences612891
抗PD-1/BV421抗体BD Biosciences564323
抗OX40/BV650抗体BD Biosciences563658
抗CD39/FITC抗体BD Biosciences561444
抗HLA-DR/PerCP5.5抗体BD Biosciences551764
抗CTLA4/PE抗体BD Biosciences555853
抗41BB/PECF594抗体BD Biosciences309826
抗CD25/PECy7抗体Beckmann CoulterA52882
抗TIGIT/APC抗体BioLegend17-9500-41
抗HLA-ABC/AF700抗体BioLegend311438
抗CD8/APC-H7抗体BD Biosciences560179
Zombie Aqua固定活力试剂盒BioLegend423101
Bio-Plex Pro人趋化因子检测试剂盒(40重)Bio-Rad171AK99MR2
血管生成因子检测试剂盒1(人)Meso Scale DiscoveryK151P3S-1
人PD-1和PD-L1抗体套装Meso Scale DiscoveryF214A-3, F214C-3
Atellica IM白细胞介素6检测试剂盒Siemens Healthineers--
Ventana Benchmark Ultra平台Ventana--
Ventana Discovery Ultra平台Ventana--
ZytoLight SPEC CDKN2A/CEN 9双色探针ZytoVision--
Agilent 2100生物分析仪Agilent--
NanoDrop分光光度计Thermo Fisher Scientific--
SureSelect自动化链特异性RNA文库制备试剂盒Agilent--
Bravo自动化液体处理平台Agilent--
NovaSeq 6000测序仪Illumina--
Covaris E220超声波破碎仪Covaris--
SureSelect临床研究2外显子捕获试剂盒Agilent--
BD Fortessa X20流式细胞仪BD Biosciences--
Gallios流式细胞仪Beckman Coulter--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床试验设计
尼达尼布150 mg b.i.d.,帕博利珠单抗200 mg Q3W,尼达尼布单药导入7天后联合治疗;患者须为晚期胸膜间皮瘤,既往至少一线铂类化疗,未接受过免疫检查点阻断和尼达尼布。
阅读提示:Methods: Study Design, Patients
疗效评估
采用RECIST 1.1评估肿瘤反应,每6周一次;DCB定义为6个月时CR、PR或SD。
阅读提示:Methods: Outcomes, 图1C-E
新鲜肿瘤活检处理
肿瘤活检置于生理盐水中,孵育至少30分钟后收集分泌组;机械解离后用于流式细胞术。
阅读提示:Methods: Analyses of Tumor-Infiltrating Immune Cells from Biopsies by Flow Cytometry
细胞因子检测
使用Bio-Plex 200系统进行多重检测,IL6用Siemens Atellica IM1600确认,样本检测双份取均值。
阅读提示:Methods: Cytokine, Chemokine, and Soluble Angiogenic Factor Measurements
基因组分析
WES和FISH检测SCNA和9p21改变;SCNA评分计算基于ASCAT的绝对拷贝数。
阅读提示:Methods: Whole-Transcriptome RNA-seq, Somatic and Germline WES, WES Analyses