体内抗肿瘤活性评价
评估艾日布林联合伊立替康在多种儿童肿瘤异种移植模型中的抗肿瘤疗效,并与长春新碱联合伊立替康比较。
在12个PDX和CDX模型中,单独或联合给予艾日布林、长春新碱、伊立替康,监测肿瘤体积和事件时间。
Evaluation of Eribulin Combined with Irinotecan for Treatment of Pediatric Cancer Xenografts
包含体内异种移植模型评价、药效学标志物检测、RNA-seq转录组分析、体外细胞毒性实验及Matrigel血管发育实验等多个独立证据层级,并含功能验证和机制验证。
ES-4尤文肉瘤CDX模型 KT-11肾母细胞瘤PDX模型 其他儿科肿瘤PDX/CDX模型(Rh10, Rh30, Rh41, Rh65, KT-14, CHLA258, SK-NEP-1, RBD1)
药物剂量:艾日布林1 mg/kg,伊立替康2.5 mg/kg,长春新碱1 mg/kg或0.5 mg/kg(联合时) 给药方案:艾日布林第1、8天,伊立替康第1-5天,21天周期;长春新碱每周一次共6周 给药途径:腹腔注射 肿瘤体积起始:200-400 mm³ 疗效评估终点:肿瘤体积达治疗起始体积的400%作为事件,PR≥50%体积缩小,CR<40mm³
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估艾日布林联合伊立替康在多种儿童肿瘤异种移植模型中的抗肿瘤疗效,并与长春新碱联合伊立替康比较。
在12个PDX和CDX模型中,单独或联合给予艾日布林、长春新碱、伊立替康,监测肿瘤体积和事件时间。
评估单药和联合治疗对肿瘤中药效学标志物(有丝分裂阻滞、DNA损伤、凋亡)的影响。
在治疗开始后24小时和144小时收集肿瘤样本,通过免疫印迹检测磷酸化组蛋白H3、γ-H2A.X、PARP、caspase 3等蛋白;通过免疫组化检测TP53和cleaved caspase 3。
研究联合治疗对肿瘤基因表达的影响,特别是TP53通路的激活。
对ES-4肿瘤进行RNA-seq,分析差异表达基因,进行聚类和通路富集分析。
在体外评估艾日布林或长春新碱与SN-38(伊立替康活性代谢物)的细胞毒相互作用,以解释体内结果。
使用ES-4细胞,进行alamar blue细胞活力检测,计算组合指数(CI)并进行等效线图分析。
评估艾日布林及其联合治疗对肿瘤相关血管和肿瘤非依赖血管的影响。
对ES-4肿瘤进行CD34和α-SMA免疫组化染色;在Matrigel栓中植入VEGF,观察血管形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | alamar blue试剂 | Bio-Rad Laboratories | BUF012 |
| 蛋白提取 | 细胞裂解缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9803 |
| Halt蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 蛋白定量 | 蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 蛋白质电泳 | NuPAGE Bis-Tris凝胶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质转移 | Immobilon-FL PVDF膜 | MilliporeSigma | -- |
| 免疫印迹 | 一抗 | Cell Signaling Technology | 2118 |
| RRM2B抗体 | Invitrogen | PA5-19970 | |
| Odyssey封闭缓冲液 | LI-COR | -- | |
| 吐温20 | Sigma-Aldrich | -- | |
| IRDye二抗 | LI-COR | -- | |
| Odyssey CLx成像系统 | LI-COR | -- | |
| Image Studio软件 | LI-COR | -- | |
| 免疫组织化学(显色) | 抗原修复液 | Agilent | -- |
| PT Link预处理模块 | Agilent | -- | |
| 抗cleaved caspase 3抗体 | Cell Signaling Technology | 9579 | |
| 抗TP53抗体 | Cell Signaling Technology | 48818 | |
| 抗CD34抗体 | Abcam | ab81289 | |
| 抗α-平滑肌肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 19245 | |
| Dako Autostainer Link 48自动染色仪 | Agilent | -- | |
| EnVision FLEX DAB+显色系统 | Agilent | -- | |
| EasyScan数字玻片扫描仪 | Motic | -- | |
| 免疫荧光 | O.C.T包埋剂 | Scigen Inc. | 4583 |
| 山羊血清 | Cell Signaling Technology | 5425 | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 抗53BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 4937 | |
| 抗磷酸化S10-H3抗体 | Cell Signaling Technology | 53348 | |
| 抗γ-H2A.X抗体 | Abcam | ab26350 | |
| Alexafluor-488二抗 | Abcam | ab150077 | |
| Alexafluor-647二抗 | Abcam | ab150115 | |
| Prolong Gold防淬灭封片剂含DAPI | Cell Signaling Technology | 8961 | |
| FLUOVIEW FV3000激光扫描共聚焦显微镜 | Olympus | -- | |
| Fluoview软件 | Olympus | -- | |
| 血管发育实验 | Matrigel基质胶 | -- | -- |
| 血管内皮生长因子 | -- | -- | |
| RNA-seq | Illumina TruSeq链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- |
| Illumina HiSeq 3000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内抗肿瘤活性评价 | 模型:PDX或CDX类型及来源;药物剂量:艾日布林1 mg/kg,伊立替康2.5 mg/kg,长春新碱单独1 mg/kg或联合0.5 mg/kg;给药方案:艾日布林第1、8天,伊立替康第1-5天,21天周期;给药途径:腹腔注射;治疗起始肿瘤体积:200-400 mm3;每组小鼠数量:10只 阅读提示:Materials and Methods: Evaluation in xenograft models |
| 药效学标志物检测 | 时间点:24小时和144小时;每组样本量:3只小鼠;检测方法:免疫印迹和免疫组化;具体标志物:磷酸化组蛋白H3、γ-H2A.X、cleaved PARP、cleaved caspase 3等 阅读提示:Results: Pharmacodynamic markers of drug action; Figure 2; Supplementary Figure S1 |
| 基因表达分析 | 样本:ES-4肿瘤;时间点:24小时和144小时;差异表达标准:FDR<0.05且倍数变化≥2;分析方法:TopHat2比对,HTSeq计数,DESeq分析,k-means聚类 阅读提示:Materials and Methods: RNA-sequencing library preparation; RNA-seq data analysis; Results: Changes in gene expression |
| 体外药物相互作用评价 | 细胞系:ES-4;细胞密度:3.33×10^3细胞/孔;处理时间:72小时;药物:艾日布林、长春新碱、SN-38;检测方法:alamar blue法;组合指数计算:Bliss独立模型和Loewe加和模型 阅读提示:Materials and Methods: Evaluation of drug synergy; Results: In vitro evaluation of eribulin and SN-38 |
| 血管发育影响评价 | 模型:ES-4肿瘤血管或Matrigel栓;Matrigel含VEGF浓度:100 ng/mL;小鼠品系:C.B.17SC scid-/-;处理时间:7天;检测指标:CD34和α-SMA免疫组化 阅读提示:Materials and Methods: Vascular development assays; Results: Effects of eribulin and irinotecan on tumor-dependent and tumor-independent vasculature |