体外筛选高效PHD2-sshRNA
鉴定能有效沉默兔PHD2 mRNA的sshRNA序列。
设计针对兔PHD2 mRNA的sshRNA,共转染至293FT细胞进行双荧光素酶报告基因检测,并在HaCaT细胞中验证对人PHD2的敲低效果。
Use of Therapeutic RNAs to Accelerate Wound Healing in Diabetic Rabbit Wounds
包含体外细胞实验(sshRNA筛选、luciferase报告基因、RT-qPCR)、体内兔模型(糖尿病神经缺血)和分子检测(miR-210水平),明确功能验证和机制验证。
糖尿病神经缺血兔耳模型 293FT细胞 HaCaT细胞
模型:糖尿病神经缺血兔耳模型,四氧嘧啶诱导糖尿病,结扎中央和尾侧神经血管束 伤口:每耳4个6mm全层伤口,使用活检打孔器制作 分组:SG608(antimiR-210)与裸敷料对照,每组n=12 评估:伤口面积归一化至第0天,采用混合效应模型分析,p=0.038 miR-210敲低:RT-qPCR检测,SG608组Ct值较对照高约8,对应>99%敲低
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能有效沉默兔PHD2 mRNA的sshRNA序列。
设计针对兔PHD2 mRNA的sshRNA,共转染至293FT细胞进行双荧光素酶报告基因检测,并在HaCaT细胞中验证对人PHD2的敲低效果。
提高sshRNA的稳定性和效力。
对SG317和SG328进行2'-O-甲基(2'-OMe)修饰,筛选多种修饰模式,选择高效力且高稳定性的候选。
确认靶向miR-210的antimiR(SG608)的抑制活性。
使用miR-210双荧光素酶生物传感器(pSG247)检测SG608的活性,通过rLuc的去抑制程度反映对miR-210的抑制效果。
将治疗性RNA包覆在伤口敷料上,实现局部缓释。
采用LbL技术在Tegaderm网状敷料上逐层沉积Poly2、DS、LPEI和RNA,形成[Poly2/DS]20[LPEI/RNA]50或[Poly2/DS]20[LPEI/RNA]100的涂层。
评估LbL-RNA敷料对糖尿病神经缺血兔伤口愈合的影响。
用四氧嘧啶诱导糖尿病,随后结扎耳中央和尾侧神经血管束,制造全层伤口;应用LbL-RNA敷料,定期测量伤口面积。
评估LbL-antimiR-210处理的安全性。
术后21天处死动物,取伤口组织进行H&E、Masson三色染色和免疫荧光染色,由病理学家盲法评估炎症细胞、梭形细胞和血管。
验证antimiR-210在组织中的敲低效率。
用RT-qPCR定量伤口组织中miR-210的水平,使用标准曲线计算拷贝数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| LbL敷料制备 | Tegaderm™ 编织网 | 3M | -- |
| 硫酸葡聚糖 | VWR | -- | |
| 线性聚乙烯亚胺 | Polysciences, Inc. | -- | |
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Cambrex | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| RT-qPCR | 高容量cDNA合成试剂盒 | Applied Biosystems | -- |
| TaqMan MicroRNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| 5X HOT FIREPol探针qPCR混合液(ROX) | Solis BioDyne | -- | |
| 体外实验 | psiCHECK™-2质粒 | Promega | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 组织处理 | RNAlater溶液 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | QIAZOL裂解试剂 | Qiagen | -- |
| RNeasy Plus通用微型试剂盒 | Qiagen | -- | |
| 裂解基质D珠 | MP Biomedicals | -- | |
| FastPrep-24匀浆器 | MP Biomedicals | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 兔品种、年龄、体重、四氧嘧啶给药剂量和方式 阅读提示:Methods: Animal model: Diabetes induction and neuroischemia wounding surgery |
| 伤口制备 | 伤口大小、数量、位置、全层伤口 阅读提示:Methods: Animal model: Diabetes induction and neuroischemia wounding surgery |
| LbL敷料配方 | 聚合物(Poly2、DS、LPEI)浓度、pH、RNA浓度、层数、干燥时间 阅读提示:Methods: Formulation of LbL dressings |
| 体外sshRNA活性筛选 | 细胞系、转染浓度、检测时间 阅读提示:Results: Identification of potent sshRNA inhibitors of rabbit PHD2 in vitro |
| RT-qPCR检测miR-210 | RNA提取方法、反转录试剂盒、探针、标准曲线 阅读提示:Methods: Quantification of miR-210 levels in rabbit wounds |