Atg9+囊泡聚集的表征
确定Plekhg5缺陷小鼠中是否存在Atg9+囊泡聚集及其定位。
对脊髓和肌肉组织进行免疫组化染色,使用电镜和dSTORM观察超微结构。
Age-dependent removal of Atg9-containing vesicle accumulations in motoneuron disease models by physical exercise
包含细胞与动物模型(Plekhg5缺陷、SOD1G93A)及体外培养运动神经元,进行功能验证(握力、NMJ形态)和机制验证(自噬流、WIPI2磷酸化),证据层级独立。
Plekhg5缺陷小鼠 SOD1G93A小鼠 原代小鼠运动神经元
动物年龄:3个月和12个月 运动方式:自愿跑轮,持续4周 握力测量:每次至少3次 Atg9+聚集量化方法:Deepflash深度学习分割 自噬流检测:mRFP-GFP-LC3报告基因
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Plekhg5缺陷小鼠中是否存在Atg9+囊泡聚集及其定位。
对脊髓和肌肉组织进行免疫组化染色,使用电镜和dSTORM观察超微结构。
评估4周自愿跑轮运动能否改变Atg9+囊泡聚集、NMJ完整性及运动功能。
3月龄和12月龄小鼠进行跑轮运动,通过免疫组化和深度学习量化脊髓中Atg9+聚集,评估NMJ形态和握力。
检测体育锻炼是否诱导运动神经元自噬,并比较不同年龄的差异。
使用mRFP-GFP-LC3报告小鼠,通过免疫荧光定量自噬体和自噬溶酶体,并通过Western blot检测LC3-II和WIPI2水平。
确定Atg9+囊泡聚集是否也存在于其他MND模型,并检验体育锻炼是否有效。
对8月龄SOD1G93A小鼠脊髓进行免疫组化,并让3月龄SOD1G93A小鼠进行4周跑轮运动,量化Atg9+聚集变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物运动装置 | 跑轮 | Ugo Basile | 1800/50 |
| 握力测量 | 握力计 | Ametek | 93153 |
| 免疫组织化学 | Alexa-488偶联α-银环蛇毒素 | Invitrogen | B13422 |
| FlourSave封片剂 | Merck | 345789 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542-5MG | |
| Western blot | PVDF膜 | Bio-Rad | 1620177 |
| Immobilon显影液 | Merck | WBKLS0500 | |
| 蛋白酶抑制剂 | Millipore Sigma | 5892970001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Millipore Sigma | 4906837001 | |
| 细胞培养 | Neurobasal培养基 | Gibco | -- |
| B-27添加剂 | Gibco | -- | |
| 多聚鸟氨酸/层粘连蛋白 | Sigma-Aldrich | L2020-1MG | |
| 脑源性神经营养因子 | -- | -- | |
| 电镜 | JEOL JEM-2100透射电子显微镜 | JEOL | -- |
| 组织切片 | 徕卡VT1000S振动切片机 | Leica | -- |
| 冷冻切片机 | Leica | CM 1950 | |
| dSTORM成像 | 蔡司Observer Z.1倒置显微镜 | Carl Zeiss AG | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与分组 | 小鼠品系(Plekhg5+/+和Plekhg5-/-、SOD1G93A),年龄(3月龄和12月龄),性别,饲养条件,随机分组 阅读提示:Materials and methods: Mouse handling and voluntary physical exercise; Table S1 |
| 运动方案 | 跑轮型号、运动持续时间(4小时或4周)、每日运动量筛选标准(<800转/4小时排除) 阅读提示:Materials and methods: Mouse handling and voluntary physical exercise |
| 免疫组织化学 | 组织固定(4% PFA)、切片厚度(脊髓40 µm,肌肉纤维分离)、封闭液、一抗和二抗浓度及孵育条件 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry for muscles and spinal cord sections; Tables S2-S3 |
| 图像量化 | 深度学习模型(Deepflash 0.2.3)、训练集数量、dice score≥0.7、粒子大小阈值(>10 pixels) 阅读提示:Materials and methods: Quantification of clusters in spinal cord sections |
| 自噬流检测 | mRFP-GFP-LC3小鼠的构建、运动时间(4小时)、共聚焦显微镜设置 阅读提示:Materials and methods: Quantification of autophagosomes and autolysosomes; Fig. 5 |
| Western blot | 脊髓组织取材、裂解液、抗体(LC3、WIPI2、p-WIPI2、Atg9)、内参(Calnexin, GAPDH) 阅读提示:Materials and methods: Western blots; Table S4 |