Inhba基因敲除小鼠的生成与验证
获得合子activin A缺失的胚胎模型,并验证敲除效果。
利用CRISPR/Cas9在Inhba基因编码外显子1中插入22 bp片段,造成移码突变。通过Sanger测序确认突变,并通过ELISA检测MEF培养基中activin A水平,确认敲除后蛋白显著降低。
Zygotic activin A is dispensable for the mouse preimplantation embryo development and for the derivation and pluripotency of embryonic stem cells†
包含体外胚胎培养与延时成像、谱系标记免疫染色、囊胚体外生长模型、胚胎干细胞衍生与三胚层分化验证等多个独立证据层级。
Inhba敲除小鼠胚胎(C57BL/6/Tar x CBA/Tar混合背景及C57BL/6/Tar近交背景) 小鼠胚胎干细胞(InhbaKO/KO、InhbaKO/WT、InhbaWT/WT) 胚胎体(EBs)
基因型:Inhba-KO等位基因(22 bp插入)通过Sanger测序和PCR+EcoRI消化确认 胚胎培养条件:M16或KSOM培养基,5%或大气氧水平,37.5°C,5% CO2 胚胎发育阶段:从合子培养至囊胚,记录时间-lapse参数(tNEBD、t2等) ES细胞衍生:在表达LIF的培养基中,在野生型或InhbaKO/KO MEF饲养层上培养 胚状体形成:悬滴法(800个ESCs/30 μl液滴,7天培养)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得合子activin A缺失的胚胎模型,并验证敲除效果。
利用CRISPR/Cas9在Inhba基因编码外显子1中插入22 bp片段,造成移码突变。通过Sanger测序确认突变,并通过ELISA检测MEF培养基中activin A水平,确认敲除后蛋白显著降低。
评估合子activin A缺乏对胚胎发育速率和形态的影响。
从合子阶段开始培养InhbaKO/KO、InhbaKO/WT和InhbaWT/WT胚胎,使用延时成像系统记录发育过程,比较各时期时间参数和发育至囊胚的效率。
检测嵌合体囊胚中TE、PE和EPI细胞谱系的正确形成。
对120h和135h的囊胚进行免疫染色,检测CDX2(TE)、SOX17(PE)、Nanog(EPI)等标志物,并统计各谱系细胞比例。
排除培养条件对突变表型的掩盖,在更接近体内环境下验证发育。
将胚胎在5% O2、KSOM培养基改良(高糖和EAA)中培养至囊胚,并检查谱系标志物。
评估activin A缺乏对滋养层功能和植入能力的影响。
将囊胚培养在明胶包被的96孔板上,于标准ESC培养基中培养96小时,测量总面积和ICM面积,并评估滋养层迁移。还用重组activin A处理进行挽救实验。
确定内源性和外源性activin A对ESC衍生和多能性的必要性。
从InhbaKO/KO胚胎在MEF饲养层上(野生型或InhbaKO/KO MEFs)衍生ESC系,在含LIF和2i(PD0325901,CHIR99021)的培养基中维持,检测多能性标志物(SOX2、OCT4、Nanog)和分化标志物(CDX2、SOX17)。
验证activin A缺失的ESC是否保持多能性并能分化为三个胚层。
通过悬滴法形成胚状体(EBs),培养7天,提取RNA进行RT-qPCR检测各胚层标志基因(Mesp2, Mixl1, Eomes, Msgn1, Nodal;Zic1, Pax1, Pax6;Foxa2),并进行免疫荧光检测蛋白表达(Brachyury、SOX17)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因编辑 | CRISPR/Cas9 | -- | -- |
| ELISA检测 | 激活素A免疫测定(人/小鼠/大鼠激活素A Quantikine ELISA试剂盒) | R&D Systems | #DAC00B |
| 胚胎培养 | M16培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| EmbryoMax高级KSOM胚胎培养基 | Sigma-Aldrich | MR-101-D | |
| D-(+)-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 不含L-谷氨酰胺的必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| 透明质酸酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| M2培养基 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | -- | |
| ES细胞衍生 | KnockOut DMEM | Gibco | -- |
| 血清替代物 | Gibco | -- | |
| 非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| GlutaMax | Gibco | -- | |
| β-巯基乙醇 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 小鼠白血病抑制因子 | ESGRO, Chemicon International | -- | |
| PD0325901 | Stemgent | -- | |
| CHIR99021 | Stemgent | -- | |
| FGFR抑制剂 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CDX2抗体(小鼠单克隆) | BioGenex | MU392A-UC |
| 抗CDX2抗体(兔单克隆) | Cell Signaling Technology | 12306S | |
| 抗SOX2抗体(兔多克隆) | Abcam | ab97959 | |
| 抗Nanog抗体(大鼠单克隆) | ThermoFisher Scientific | 14-5761-80 | |
| 抗SOX17抗体(山羊多克隆) | R&D Systems | AF1924 | |
| 抗GATA4抗体(山羊多克隆) | R&D Systems | AF2606 | |
| 抗OCT4抗体(小鼠单克隆) | Santa Cruz Biotechnology | sc-5279 | |
| 抗TROMA1抗体(大鼠单克隆) | Developmental Studies Hybridoma Bank | AB_531826 | |
| 抗Brachyury抗体(山羊多克隆) | R&D Systems | AF2085 | |
| 抗整合素α2抗体(兔单克隆) | Abcam | ab181548 | |
| 二抗 | Invitrogen | -- | |
| Hoechst 33342 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| 色霉素A3 | Sigma-Aldrich | -- | |
| DRAQ5 | Biostatus Ltd. | -- | |
| 成像设备 | PrimoVision成像系统 | Vitrolife | -- |
| 尼康Ti2-U显微镜 | Nikon | -- | |
| 再扫描共聚焦显微镜模块RCM1 | Confocal.nl | -- | |
| ORCA-Flash4.0 LT+相机 | Hamamatsu | -- | |
| iChrome CLE 50激光引擎 | Toptica | -- | |
| 低温培养 | HypoxyLab培养箱 | Oxford Optronix | -- |
| 分子生物学 | RNAqueous-Micro试剂盒 | Ambion | -- |
| Superscript II逆转录酶 | Invitrogen | -- | |
| Taqman探针 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| TaqMan基因表达预混液 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| StepOne实时PCR系统 | Life Technologies | -- | |
| Extract-N-Amp组织PCR试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 快速循环PCR试剂盒 | Qiagen | -- | |
| EcoRI限制酶 | ThermoFisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因敲除小鼠生成 | CRISPR/Cas9靶向Inhba外显子1的插入序列(22 bp),确认移码突变,基因分型方法(PCR+EcoRI digestion) 阅读提示:Methods: Generation of Inhba-KO mouse lines; Mouse genotyping |
| 胚胎培养和图谱分析 | 培养基(M16或KSOM)、氧浓度(大气或5%)、时间-lapse记录参数(tNEBD等)、胚胎数目和重复数 阅读提示:Methods: Time-lapse imaging and morphokinetic analysis; Culture of embryos in hypoxic conditions |
| 囊胚生长试验 | 明胶涂层浓度(0.2%)、培养基成分(无LIF)、培养时间(96h)、重组激活素A浓度(500 ng/ml)、测量面积的方法 阅读提示:Methods: Blastocyst outgrowths formation and measurement of their area |
| ES细胞衍生和培养 | 饲养层类型(野生型或敲除)、培养基成分(LIF、2i等)、传代方法 阅读提示:Methods: ESC derivation and culture |
| 胚状体分化 | 悬滴法参数(细胞数、液滴体积、培养时间)、RT-qPCR引物/探针、内参(β-actin) 阅读提示:Methods: Formation of embryoid bodies; RT-qPCR from embryoid bodies |