临床样本中HSPA13表达检测
明确HSPA13在PVR患者ERMs中的表达定位及与EMT的关系。
收集PVR患者ERMs,进行免疫荧光染色,检测HSPA13与上皮标志物CK8及间充质标志物α-SMA的共定位。
Knockdown of HSPA13 Inhibits TGFβ1-Induced Epithelial-Mesenchymal Transition of RPE by Suppressing the PI3K/Akt Signaling Pathway
包含患者ERMs免疫组化、体外细胞实验(hESC-RPE和ARPE-19)、RNA-seq及大鼠PVR模型等至少两个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
hESC-RPE细胞 ARPE-19细胞 原代小鼠RPE细胞 大鼠PVR模型
TGFβ1处理浓度10 ng/mL及处理时间48小时 HSPA13敲低稳定细胞系构建及敲低效率验证 BAPTA/AM浓度10 μM及孵育时间 PVR大鼠模型细胞注射量4 μl(1 × 105 cells/μl)及PRP体积 Western blot检测p-PI3K和p-Akt水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确HSPA13在PVR患者ERMs中的表达定位及与EMT的关系。
收集PVR患者ERMs,进行免疫荧光染色,检测HSPA13与上皮标志物CK8及间充质标志物α-SMA的共定位。
体外模拟RPE细胞EMT过程,检测HSPA13的表达变化。
hESC-RPE细胞经10 ng/mL TGFβ1处理48小时,观察细胞形态、标志物表达及HSPA13水平变化。
验证TGFβ1是否通过升高细胞内Ca2+上调HSPA13表达。
使用Fluo-8/AM探针检测TGFβ1处理后的Ca2+水平;使用BAPTA/AM螯合Ca2+后检测HSPA13表达。
评估HSPA13敲低对RPE细胞EMT进程的影响。
通过慢病毒转染建立HSPA13敲低稳定细胞系,TGFβ1处理后检测EMT标志物表达、细胞形态和迁移能力。
从全基因组水平揭示HSPA13敲低抑制EMT的分子机制。
对shScramble和shHSPA13细胞经TGFβ1处理进行RNA-seq,分析差异表达基因、GO富集和KEGG通路。
验证HSPA13是否通过PI3K/Akt通路调控EMT,并排除经典TGFβ/Smad及Wnt/β-catenin通路。
Western blot检测PI3K、p-PI3K、Akt、p-Akt蛋白水平,并检测Smad2/3和β-catenin的磷酸化或表达变化。
验证HSPA13敲低在体内对EMT和PVR发展的抑制作用。
建立PVR大鼠模型,注射shScramble或shHSPA13-hESC-RPE细胞与PRP,4周后通过H&E染色和免疫荧光评估视网膜形态和ERM形成。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 基因敲除血清替代物 | Gibco | -- | |
| MEM非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | -- | |
| 基质胶 | 文中未明确说明 | -- | |
| 药物处理 | 重组人TGFβ1 | Sino Biological | -- |
| BAPTA/AM | Selleck Inc. | -- | |
| 钙成像 | Fluo-8/AM | Beyotime | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | TargetMol | -- | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光系统 | Pierce | -- | |
| 抗体 | 抗E-cadherin抗体 | CST | 14472 |
| 抗FN1抗体 | Proteintech | 66042 | |
| 抗HSPA13抗体 | Proteintech | 12667 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 | |
| 抗CK8抗体 | Abcam | ab9023 | |
| 抗PI3K p85抗体 | CST | 4292 | |
| 抗p-PI3K p85/p55抗体 | Beyotime | AF5905 | |
| 抗AKT抗体 | CST | 4691 | |
| 抗p-AKT抗体 | CST | 13038 | |
| 抗ZO-1抗体 | Thermo | 617300 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara | -- |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| qPCR | SYBR Green预混液 | Tiangen | -- |
| Chromo4热循环仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA浓度测定 | Nanodrop 2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 慢病毒构建 | pLVXpuro载体 | 文中未明确说明 | -- |
| 细胞计数 | Countstar细胞计数仪 | ALIT Life Science | -- |
| 免疫组化 | OCT包埋剂 | Tissue-Tek | 4583 |
| 封闭 | 牛血清白蛋白 | Sangon Biotech | -- |
| 核染色 | DAPI | 文中未明确说明 | -- |
| 显微成像 | Nikon A1R荧光显微镜 | Nikon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与EMT诱导 | hESC-RPE细胞培养条件:1% Matrigel包被,密度1.5×10^6/孔(6孔板);EMT诱导需KSR饥饿24小时,TGFβ1浓度10 ng/mL,处理48小时。 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture |
| HSPA13敲低 | 慢病毒载体pLVXpuro,嘌呤霉素浓度1 ng/mL,筛选时间1周;shRNA靶序列GATCCCCGGCTGACGTCTTCCACGTC。 阅读提示:Materials and Methods: Plasmid Construction and Lentivirus Infection |
| Ca2+螯合实验 | BAPTA/AM浓度10 μM,处理时间48小时;Fluo-8/AM浓度2 μM,负载时间45分钟。 阅读提示:Materials and Methods: Live-Cell Ca2+ Imaging; Results: Figure 2 |
| Western blot检测PI3K/Akt通路 | 抗体信息:p-PI3K (Beyotime AF5905)、p-AKT (CST 13038);内参β-actin。 阅读提示:Materials and Methods: Antibodies and Reagents; Results: Figure 6 |
| PVR大鼠模型 | SD大鼠周龄6周;注射细胞量4 μl(1×10^5 cells/μl)和PRP 4 μl;观察时间点4周。 阅读提示:Materials and Methods: Establishment of the PVR Rat Model; Results: Figure 7 |