初级纤毛和Hh成分的定位
确定初级纤毛和Hh配体IHH在胚胎WD中的分布和区域特征。
使用Arl13b-Cetn2转基因小鼠,通过免疫荧光和共聚焦显微镜检测WD不同区域初级纤毛和IHH的分布。
Hedgehog signaling regulates Wolffian duct development through the primary cilium†
研究包含体内基因敲除小鼠模型、体外器官型培养、药物干预、形态学分析、基因表达分析等多层次实验,并通过功能验证和机制研究揭示初级纤毛依赖性Hh信号的作用。
小鼠胚胎沃尔夫管 Pax2Cre; IFT88fl/fl小鼠 Arl13b-Cetn2转基因小鼠 CD-1小鼠
小鼠品系和基因型 药物处理浓度(如SAG 0.5μM, Cyclo 25μM) 培养时间(72小时) 基因表达分析(qPCR, RNAscope) 形态学测量方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定初级纤毛和Hh配体IHH在胚胎WD中的分布和区域特征。
使用Arl13b-Cetn2转基因小鼠,通过免疫荧光和共聚焦显微镜检测WD不同区域初级纤毛和IHH的分布。
评估上皮细胞初级纤毛缺失对WD发育和Hh信号的影响。
比较Pax2Cre; IFT88fl/fl(IFT88 cKO)和对照小鼠的WD形态和Hh靶基因表达。
研究阻断初级纤毛形成和调节Hh信号对WD发育的直接作用。
对E16.5 WD进行器官型培养,分别用CilioD、SAG、Cyclo处理,分析形态变化和基因表达。
全面解析Hh信号激活或抑制引起的转录组变化。
对处理后的WD进行总RNA提取,进行微阵列分析和qPCR验证。
检测SAG引起的WD外腔增厚是否伴随细胞增殖变化。
通过免疫组化检测KI-67阳性细胞,并量化不同细胞类型中的增殖率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| ThinCert组织培养插入物 | Greiner Bio-One | -- | |
| 胰岛素-转铁蛋白-硒 | -- | -- | |
| 睾酮 | -- | -- | |
| 药物处理 | Ciliobrevin D | -- | -- |
| Smoothened激动剂 | -- | -- | |
| 环杷明 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | αSMA抗体 | Abcam | ab5694 |
| IHH抗体 | Abcam | ab52919 | |
| IFT88抗体 | Proteintech | 13967-1-AP | |
| γ-微管蛋白抗体 | Abcam | ab27074 | |
| α-乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma | T7451 | |
| DAPI | Vector Laboratories | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | BioRad | -- | |
| Clarity Western ECL底物 | BioRad | -- | |
| 免疫组化 | 波形蛋白抗体 | Abcam | ab20346 |
| KI-67抗体 | Biosciences | SolA15 | |
| RNAscope | RNAscope多重荧光试剂盒v2 | Advanced Cell Diagnostics | -- |
| Mm-ptch2探针 | Advanced Cell Diagnostics | 435131 | |
| Mm-hhip探针 | Advanced Cell Diagnostics | 448441 | |
| 3-plex阳性对照探针 | Advanced Cell Diagnostics | 320881 | |
| 阴性对照探针 | Advanced Cell Diagnostics | 320871 | |
| RNA提取 | RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| 无RNA酶的DNase | Qiagen | -- | |
| qPCR | iScript Advanced cDNA合成试剂盒 | Biorad | -- |
| SsoAdvanced Universal SYBR Green Supermix | Biorad | -- | |
| 微阵列 | Affymetrix小鼠Clariom S芯片 | ThermoFisher | -- |
| GeneChip WT Plus试剂盒 | Affymetrix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、基因型和胚胎日龄(E16.5) 阅读提示:Methods: Animals and isolation of WDs |
| 器官型培养 | 培养条件:DMEM/F12培养基、ITS、睾酮浓度、培养时间(72小时) 阅读提示:Methods: Organotypic cultures of WDs |
| 药物处理 | 药物浓度:CilioD 20μM、SAG 0.5μM、Cyclo 25μM;溶剂对照 阅读提示:Methods: Organotypic cultures of WDs |
| 形态学测量 | 测量参数:伸长、盘曲数、腔内面积、外腔厚度;测量方法 阅读提示:Methods: Measurement of WD morphological features |
| 基因表达分析 | RNA提取方法、微阵列平台、qPCR引物序列和条件 阅读提示:Methods: RNA extraction, purification, and microarray analysis; Quantitative PCR |