候选肽酶鉴定
筛选卵母细胞中表达的、定位于细胞外或质膜的肽酶作为潜在介导分离的候选分子
利用公共转录组数据GSE70116和另外三个数据集,结合MEROPS数据库和GO注释,筛选出43个候选肽酶,并选择10种小分子抑制剂进行后续实验。
Initial detachment of the mouse oocyte from the zona pellucida is mediated by metallopeptidase activity†
包含体外卵母细胞培养、小分子抑制剂筛选、定量附着评分、免疫荧光检测及时间成像等多层级实验,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠GV期卵母细胞 CD1小鼠
使用50 mM GI254023X抑制ADAM10显著阻止分离(IC50 2.3 μM) 卵母细胞从卵巢分离后1.5小时进行分离评分 使用高渗Hepes-KSOM(750或1000 mOsM)揭示附着状态 通过酸Tyrode's溶液去除透明带后检测跨膜ZP3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选卵母细胞中表达的、定位于细胞外或质膜的肽酶作为潜在介导分离的候选分子
利用公共转录组数据GSE70116和另外三个数据集,结合MEROPS数据库和GO注释,筛选出43个候选肽酶,并选择10种小分子抑制剂进行后续实验。
验证定量分离检测方法的可靠性和卵母细胞活性
将GV期卵母细胞培养不同时间,用450、750或1000 mOsM的高渗Hepes-KSOM处理,根据虚拟网格评分分离程度,并观察成熟至MII的比例。
确定哪类肽酶活性参与卵母细胞-ZP分离
将卵母细胞分别与10种小分子抑制剂共培养1.5小时,然后进行分离评分,并检测卵母细胞成熟至MII的百分比以评估毒性。
确认金属肽酶作用并初步区分可能家族
测试marimastat、GM6001、fetuin B、KP457和GI254023X对分离的影响,并测定剂量-反应曲线。
评估抑制剂阻止分离的持续时间和可逆性
在4小时和20小时时测定抑制剂作用,并测试去除抑制剂后分离是否恢复;通过延时成像观察卵母细胞成熟过程。
验证分离过程中ZP蛋白的切割
用酸Tyrode's溶液去除透明带,免疫荧光检测剩余跨膜ZP3,在0.5、1.5、2.5、4.0小时测定其水平,并检测抑制剂的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 抑制剂处理 | GI254023X | Sigma | SML0789 |
| Batimastat | Sigma | SML0041 | |
| Marimastat | Sigma | M26699 | |
| GM6001 | Sigma | CC1000 | |
| KP457 | Medchem Express | HY-110397 | |
| 培养基 | α-MEM培养基 | Life Technologies | 12561-056 |
| 抗体 | 抗ZP3大鼠单克隆抗体IE-10 | ATCC | CRL-2462 |
| 二抗 | 山羊抗大鼠Alexa-fluor 555 | Invitrogen | A-21434 |
| 重组蛋白 | 重组小鼠Fetuin B | Sino Biological | 50572-M08H |
| 抑制剂处理 | DAPT | Tocris | 2634 |
| LY411575 | Sigma | SML0506 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 卵母细胞收集和体外成熟 | 小鼠品系和年龄:CD1雌性小鼠5-8周龄;超排处理:5 I.U. eCG;培养基:MEMα添加1 mg/ml聚乙烯醇;培养条件:37°C,5% CO2。 阅读提示:见Materials and methods:Oocyte collection and in vitro maturation |
| 分离实验 | 高渗培养基渗透压(450, 750, 1000 mOsM);分离后时间点(0.5, 1.0, 1.5, 2.5, 4.0, 20小时);评分方法:6级(0-6)使用虚拟网格;抑制剂浓度。 阅读提示:见Materials and methods:Oocyte-ZP adhesion assay 以及相应图例 |
| 抑制剂处理 | 抑制剂浓度和溶剂对照;处理时间:1.5小时或更长时间;洗脱实验。 阅读提示:见Materials and methods:Chemicals and media 以及相应图例 |
| 免疫荧光检测跨膜ZP3 | 酸Tyrode's处理时间:4分钟;固定和透化条件;抗体浓度和孵育时间;图像采集设置(激光源、滤镜等)。 阅读提示:见Materials and methods:ZP3 immunofluorescence imaging |
| 延时成像 | 显微镜平台:DeltaVision Elite;环境控制:37°C,5% CO2;图像间隔:4分钟;时长可达13.5小时。 阅读提示:见Materials and methods:Time-lapse imaging |