时间序列转录组分析揭示PANoptosis在真菌性角膜炎中的关键作用

目的：真菌性角膜炎（FK）是一种致残率高的严重角膜感染。宿主免疫反应是一把双刃剑，既能清除真菌病原体，又能造成角膜损伤，决定FK的严重程度、进展和预后。然而，其潜在的免疫发病机制仍不清楚。方法：对FK小鼠模型进行时间序列转录组测序，以阐明动态免疫景观。整合的生物信息学分析包括差异表达基因鉴定、时间序列聚类、基因本体论富集和浸润免疫细胞推断。基因表达通过定量聚合酶链反应（qPCR）、Western blot或免疫组织化学验证。结果：FK小鼠表现出动态免疫反应，临床评分、转录改变和免疫细胞浸润评分均在感染后第3天（dpi）达到峰值，呈现协同趋势。FK早期、中期和晚期依次出现底物代谢紊乱、广泛的免疫激活和角膜伤口愈合。同时，浸润的先天性和适应性免疫细胞的动态变化呈现出不同特征。树突状细胞的比例随着真菌感染呈现总体下降趋势，而巨噬细胞、单核细胞和中性粒细胞的比例在早期急剧上升，随后随着炎症消退逐渐下降。在感染晚期也观察到适应性免疫细胞的激活。此外，不同时间点均显示出共享的免疫反应以及AIM2、pyrin和ZBP1介导的PANoptosis的激活。结论：我们的研究描绘了动态免疫景观，并强调了PANoptosis在FK发病机制中的关键作用。这些发现为宿主对真菌的反应提供了新的见解，并有助于开发针对FK患者的PANoptosis靶向治疗。