长链非编码RNA NEAT1/miR-320a/HIF-1α竞争性内源RNA调控网络在糖尿病视网膜病变中的调控作用

Regulation of Long Noncoding RNA NEAT1/miR-320a/HIF-1α Competitive Endogenous RNA Regulatory Network in Diabetic Retinopathy

作者信息Xiaodan Zhu, Yan Wang, Lei Cheng, Hongyu Kuang
PMID37432846
发布时间2023-07
DOI10.1167/iovs.64.10.11

实验完整度

研究包含体外细胞模型(ARPE-19)、分子机制验证(双荧光素酶、RIP)、体内大鼠模型,明确功能验证(迁移、侵袭、通透性)和机制验证(ANGPTL4/p-STAT3通路),证据层级至少两个以上。

主要模型

ARPE-19细胞 STZ诱导的糖尿病大鼠模型

重点核对

高糖处理条件:30 mM葡萄糖处理48小时,对照5.5 mM葡萄糖 lncNEAT1 shRNA敲低效率:筛选三种shRNA,sh-NEAT1(2)效果最佳 HIF-1α shRNA敲低效率:筛选三种shRNA,sh-HIF-1α(1)效果最佳 miR-320a结合验证:双荧光素酶报告实验和RIP实验 大鼠模型:STZ注射诱导糖尿病,血糖>16.7 mmol/L,玻璃体腔注射lentivirus-shRNA

摘要

目的:确定长链非编码RNA NEAT1(lncNEAT1)/miR-320a竞争性内源RNA(ceRNA)网络在ARPE-19细胞中调控缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)的机制及其在糖尿病视网膜病变(DR)中的潜在作用。方法:ARPE-19细胞在正常或高糖(HG)培养基中培养,通过划痕、Transwell和FITC-葡聚糖染色实验检测细胞迁移、侵袭和通透性。检测LncNEAT1、HIF-1α、ZO-1、occludin、N-cadherin和vimentin水平。通过双荧光素酶报告基因实验验证lncNEAT1与miR-320a的结合,通过RIP实验验证miR-320a与HIF-1α的结合。用lncNEAT1或HIF-1α shRNA或miR-320a agomir处理ARPE-19细胞,以确定ANGPTL4/p-STAT3通路的激活。在DR大鼠模型中确定了lncNEAT1在DR中的作用及其对miR-320a和HIF-1α的调控。结果:HG处理促进了ARPE-19细胞的迁移、侵袭和通透性。沉默lncNEAT1后,HIF-1α、N-cadherin和vimentin水平下调,ZO-1和occludin水平上调,HG处理的ARPE-19细胞的迁移、通透性和侵袭受到抑制。然而,HIF-1α过表达增加了N-cadherin和vimentin的表达,降低了ZO-1和occludin的表达,并促进了ARPE-19细胞的迁移、通透性和侵袭。预测并证实了miR-320a与lncNEAT1和HIF-1α的结合。在糖尿病大鼠模型中,沉默lncNEAT1抑制了HIF-1α/ANGPTL4/p-STAT3通路的激活并减轻了视网膜病变。结论:lncNEAT1/miR-320a/HIF-1α ceRNA网络激活ANGPTL4/p-STAT3通路,促进HG诱导的ARPE-19细胞侵袭和迁移。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
高糖环境下,lncNEAT1/miR-320a/HIF-1α ceRNA网络是否通过ANGPTL4/p-STAT3通路调控ARPE-19细胞的侵袭和迁移,以及在糖尿病大鼠模型中是否影响视网膜病变?
核心机制
lncNEAT1通过竞争性结合miR-320a,解除miR-320a对HIF-1α的抑制,上调HIF-1α表达,激活ANGPTL4/p-STAT3通路,促进ARPE-19细胞侵袭和迁移。
主要证据
体外实验:高糖处理ARPE-19细胞,通过qRT-PCR、Western blot、划痕、Transwell和FITC-dextran实验验证敲低lncNEAT1或过表达miR-320a抑制细胞迁移、侵袭和通透性。双荧光素酶和RIP实验验证lncNEAT1和HIF-1α与miR-320a的结合。体内实验:STZ诱导糖尿病大鼠,玻璃体腔注射lncNEAT1 shRNA,H&E染色和分子检测显示沉默lncNEAT1减轻视网膜病变。
研究意义
研究为靶向lncNEAT1/miR-320a ceRNA网络治疗糖尿病视网膜病变提供了理论基础,可能为DR提供新的生物标志物。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立体外高糖模型

模拟糖尿病视网膜病变的体外环境,观察高糖对ARPE-19细胞的影响。

将ARPE-19细胞用30 mM葡萄糖处理48小时(HG组),对照组用5.5 mM葡萄糖处理。

2

验证lncNEAT1对HIF-1α及细胞行为的影响

确定lncNEAT1是否调控HIF-1α表达并影响细胞迁移、侵袭和通透性。

转染lncNEAT1 shRNA进入ARPE-19细胞,在高糖条件下培养,通过qRT-PCR和Western blot检测lncNEAT1、HIF-1α及下游蛋白表达,通过划痕、Transwell和FITC-dextran实验检测细胞功能。

3

验证lncNEAT1和HIF-1α与miR-320a的竞争性结合

确认lncNEAT1、miR-320a和HIF-1α之间的ceRNA调控关系。

使用starBase预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证结合,并通过qRT-PCR检测miR-320a表达变化。

4

验证HIF-1α对ANGPTL4/p-STAT3通路及细胞功能的影响

探究HIF-1α是否通过激活ANGPTL4/p-STAT3通路影响ARPE-19细胞功能。

转染HIF-1α shRNA或过表达载体,检测ANGPTL4、p-STAT3等蛋白表达,以及细胞迁移、侵袭、通透性和紧密连接蛋白变化。

5

验证miR-320a对HIF-1α及通路的影响

确定miR-320a是否通过下调HIF-1α抑制ANGPTL4/p-STAT3通路和细胞迁移。

转染miR-320a agomir或与pcDNA3.1-HIF-1α共转染,检测相关表达和细胞功能。

6

验证lncNEAT1/miR-320a/HIF-1α轴对通路和细胞功能的影响

确认lncNEAT1通过miR-320a调节HIF-1α并激活ANGPTL4/p-STAT3通路。

共转染lncNEAT1 shRNA和miR-320a antagomir,检测相关表达和细胞功能。

7

体内验证lncNEAT1沉默对糖尿病大鼠视网膜病变的影响

在体内模型中验证lncNEAT1的沉默是否通过上调miR-320a抑制HIF-1α并减轻视网膜病变。

STZ诱导糖尿病大鼠,玻璃体腔注射lncNEAT1 shRNA慢病毒,通过H&E染色观察视网膜形态,并通过qRT-PCR和Western blot检测相关分子表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清----
青霉素/链霉素----
D-葡萄糖----
Lipofectamine 2000Invitrogen--
lncNEAT1 shRNAGenePharma--
miR-320a agomirGenePharma--
miR-320a antagomirGenePharma--
HIF-1α shRNAGenePharma--
pcDNA3.1-HIF-1αGenePharma--
阴性对照(agomir NC、antagomir NC、pcDNA3.1-NC、NC shRNA)GenePharma--
TRIzolInvitrogen--
PrimeScript逆转录试剂盒Takara--
miRcute Plus miRNA第一链cDNA合成试剂盒Tiangen Biotech--
SYBR Green MixRoche--
LightCycler 480 PCR仪Roche--
RIPA裂解液Boster--
BCA蛋白定量试剂盒Beyotime Institute of Biotechnology--
上样缓冲液Beyotime Institute of Biotechnology--
一抗:β-actin(4970S)Cell Signaling Technology4970S
一抗:HIF-1α(14179S)Cell Signaling Technology14179S
一抗:ANGPTL4(ab196746)Abcamab196746
一抗:N-cadherin(14215S)Cell Signaling Technology14215S
一抗:vimentin(5741S)Cell Signaling Technology5741S
一抗:STAT3(9139S)Cell Signaling Technology9139S
一抗:p-STAT3(9145S)Cell Signaling Technology9145S
一抗:ZO-1(sc-33725)Santa Cruz Biotechnologysc-33725
一抗:occludin(91131S)Cell Signaling Technology91131S
化学发光成像系统Bio-Rad Life Science--
6孔板----
Transwell小室Corning--
Matrigel基质胶BD Bioscience--
结晶紫----
FITC-葡聚糖Sigma-Aldrich--
荧光酶标仪Molecular Devices--
RIP试剂盒Millipore--
Ago2抗体(ab186733)Abcamab186733
IgG抗体(ab172730)Abcamab172730
pGL3-Promoter载体----
链脲佐菌素Sigma-AldrichS0130
柠檬酸缓冲液----
慢病毒包装的lncNEAT1 shRNA----
慢病毒包装的NC shRNA----
伊红----
显微镜Olympus--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与高糖处理
ARPE-19细胞来源、培养基成分、高糖浓度(30 mM)、处理时间(48小时)、对照组浓度(5.5 mM)
阅读提示:Methods: ARPE-19 Cell Culture and Transfection
细胞转染
转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染浓度(未明确)、转染时间(48小时)、shRNA序列(表1)
阅读提示:Methods: ARPE-19 Cell Culture and Transfection; Table 1
qRT-PCR
RNA提取方法、逆转录试剂盒、PCR条件(95°C 10s; 45 cycles of 95°C 5s, 60°C 10s, 72°C 10s; 72°C 5min)、内参(β-Actin、U6)、引物序列(Table 1)
阅读提示:Methods: QRT-PCR; Table 1
Western blot
蛋白提取方法、抗体稀释比例(如β-actin 1:1000)、孵育时间、显影方法
阅读提示:Methods: Western Blot
划痕实验
细胞接种密度(2×10^6 cells/well)、培养时间(24小时)、划痕工具(200 µL枪头)、观察时间(0和24小时)
阅读提示:Methods: Scratch Assay
Transwell侵袭实验
细胞密度(5×10^4 per well)、Matrigel浓度(200 µg/mL,0.1 mL/well)、培养时间(24小时)、固定和染色时间
阅读提示:Methods: Transwell Invasion Assay
FITC-葡聚糖通透性实验
细胞密度(1×10^4)、培养时间(48小时)、FITC-葡聚糖浓度(0.01%)、检测时间(60分钟)
阅读提示:Methods: FITC-Dextran Assay
RIP实验
RIP试剂盒品牌、细胞裂解条件、磁珠用量(50 µL)、抗体浓度(Ago2 5 µg)、孵育时间(4°C overnight)
阅读提示:Methods: RNA Immunoprecipitation
双荧光素酶报告基因实验
预测软件(starBase)、突变构建、载体(pGL3-Promoter)、miR-320a agomir浓度(30 nM)、检测相对荧光素酶活性
阅读提示:Methods: Dual-Luciferase Reporter Assay
动物实验
大鼠品系、体重(200±20 g)、STZ剂量(65 mg/kg)、注射方式(腹腔注射)、血糖标准(>16.7 mmol/L)、慢病毒注射体积(1 µL,109 PFU/mL)、注射时间(第7天)、取材时间(4周后)
阅读提示:Methods: Animal Experiment
H&E染色
固定液(4%多聚甲醛)、切片厚度(5 µm)、染色时间(苏木精3-5分钟,伊红5分钟)
阅读提示:Methods: H&E Staining of Retinal Tissue