建立体外高糖模型
模拟糖尿病视网膜病变的体外环境,观察高糖对ARPE-19细胞的影响。
将ARPE-19细胞用30 mM葡萄糖处理48小时(HG组),对照组用5.5 mM葡萄糖处理。
Regulation of Long Noncoding RNA NEAT1/miR-320a/HIF-1α Competitive Endogenous RNA Regulatory Network in Diabetic Retinopathy
研究包含体外细胞模型(ARPE-19)、分子机制验证(双荧光素酶、RIP)、体内大鼠模型,明确功能验证(迁移、侵袭、通透性)和机制验证(ANGPTL4/p-STAT3通路),证据层级至少两个以上。
ARPE-19细胞 STZ诱导的糖尿病大鼠模型
高糖处理条件:30 mM葡萄糖处理48小时,对照5.5 mM葡萄糖 lncNEAT1 shRNA敲低效率:筛选三种shRNA,sh-NEAT1(2)效果最佳 HIF-1α shRNA敲低效率:筛选三种shRNA,sh-HIF-1α(1)效果最佳 miR-320a结合验证:双荧光素酶报告实验和RIP实验 大鼠模型:STZ注射诱导糖尿病,血糖>16.7 mmol/L,玻璃体腔注射lentivirus-shRNA
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟糖尿病视网膜病变的体外环境,观察高糖对ARPE-19细胞的影响。
将ARPE-19细胞用30 mM葡萄糖处理48小时(HG组),对照组用5.5 mM葡萄糖处理。
确定lncNEAT1是否调控HIF-1α表达并影响细胞迁移、侵袭和通透性。
转染lncNEAT1 shRNA进入ARPE-19细胞,在高糖条件下培养,通过qRT-PCR和Western blot检测lncNEAT1、HIF-1α及下游蛋白表达,通过划痕、Transwell和FITC-dextran实验检测细胞功能。
确认lncNEAT1、miR-320a和HIF-1α之间的ceRNA调控关系。
使用starBase预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证结合,并通过qRT-PCR检测miR-320a表达变化。
探究HIF-1α是否通过激活ANGPTL4/p-STAT3通路影响ARPE-19细胞功能。
转染HIF-1α shRNA或过表达载体,检测ANGPTL4、p-STAT3等蛋白表达,以及细胞迁移、侵袭、通透性和紧密连接蛋白变化。
确定miR-320a是否通过下调HIF-1α抑制ANGPTL4/p-STAT3通路和细胞迁移。
转染miR-320a agomir或与pcDNA3.1-HIF-1α共转染,检测相关表达和细胞功能。
确认lncNEAT1通过miR-320a调节HIF-1α并激活ANGPTL4/p-STAT3通路。
共转染lncNEAT1 shRNA和miR-320a antagomir,检测相关表达和细胞功能。
在体内模型中验证lncNEAT1的沉默是否通过上调miR-320a抑制HIF-1α并减轻视网膜病变。
STZ诱导糖尿病大鼠,玻璃体腔注射lncNEAT1 shRNA慢病毒,通过H&E染色观察视网膜形态,并通过qRT-PCR和Western blot检测相关分子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| D-葡萄糖 | -- | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | -- |
| lncNEAT1 shRNA | GenePharma | -- | |
| miR-320a agomir | GenePharma | -- | |
| miR-320a antagomir | GenePharma | -- | |
| HIF-1α shRNA | GenePharma | -- | |
| pcDNA3.1-HIF-1α | GenePharma | -- | |
| 阴性对照(agomir NC、antagomir NC、pcDNA3.1-NC、NC shRNA) | GenePharma | -- | |
| RNA提取 | TRIzol | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | PrimeScript逆转录试剂盒 | Takara | -- |
| miRNA逆转录 | miRcute Plus miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| qRT-PCR | SYBR Green Mix | Roche | -- |
| LightCycler 480 PCR仪 | Roche | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Boster | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 上样缓冲液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 一抗:β-actin(4970S) | Cell Signaling Technology | 4970S | |
| 一抗:HIF-1α(14179S) | Cell Signaling Technology | 14179S | |
| 一抗:ANGPTL4(ab196746) | Abcam | ab196746 | |
| 一抗:N-cadherin(14215S) | Cell Signaling Technology | 14215S | |
| 一抗:vimentin(5741S) | Cell Signaling Technology | 5741S | |
| 一抗:STAT3(9139S) | Cell Signaling Technology | 9139S | |
| 一抗:p-STAT3(9145S) | Cell Signaling Technology | 9145S | |
| 一抗:ZO-1(sc-33725) | Santa Cruz Biotechnology | sc-33725 | |
| 一抗:occludin(91131S) | Cell Signaling Technology | 91131S | |
| 化学发光成像系统 | Bio-Rad Life Science | -- | |
| 划痕实验 | 6孔板 | -- | -- |
| Transwell侵袭实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| Matrigel基质胶 | BD Bioscience | -- | |
| 结晶紫 | -- | -- | |
| FITC-葡聚糖实验 | FITC-葡聚糖 | Sigma-Aldrich | -- |
| 荧光酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| RIP实验 | RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| Ago2抗体(ab186733) | Abcam | ab186733 | |
| IgG抗体(ab172730) | Abcam | ab172730 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pGL3-Promoter载体 | -- | -- |
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | Sigma-Aldrich | S0130 |
| 柠檬酸缓冲液 | -- | -- | |
| 慢病毒包装的lncNEAT1 shRNA | -- | -- | |
| 慢病毒包装的NC shRNA | -- | -- | |
| H&E染色 | 伊红 | -- | -- |
| 显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与高糖处理 | ARPE-19细胞来源、培养基成分、高糖浓度(30 mM)、处理时间(48小时)、对照组浓度(5.5 mM) 阅读提示:Methods: ARPE-19 Cell Culture and Transfection |
| 细胞转染 | 转染试剂(Lipofectamine 2000)、转染浓度(未明确)、转染时间(48小时)、shRNA序列(表1) 阅读提示:Methods: ARPE-19 Cell Culture and Transfection; Table 1 |
| qRT-PCR | RNA提取方法、逆转录试剂盒、PCR条件(95°C 10s; 45 cycles of 95°C 5s, 60°C 10s, 72°C 10s; 72°C 5min)、内参(β-Actin、U6)、引物序列(Table 1) 阅读提示:Methods: QRT-PCR; Table 1 |
| Western blot | 蛋白提取方法、抗体稀释比例(如β-actin 1:1000)、孵育时间、显影方法 阅读提示:Methods: Western Blot |
| 划痕实验 | 细胞接种密度(2×10^6 cells/well)、培养时间(24小时)、划痕工具(200 µL枪头)、观察时间(0和24小时) 阅读提示:Methods: Scratch Assay |
| Transwell侵袭实验 | 细胞密度(5×10^4 per well)、Matrigel浓度(200 µg/mL,0.1 mL/well)、培养时间(24小时)、固定和染色时间 阅读提示:Methods: Transwell Invasion Assay |
| FITC-葡聚糖通透性实验 | 细胞密度(1×10^4)、培养时间(48小时)、FITC-葡聚糖浓度(0.01%)、检测时间(60分钟) 阅读提示:Methods: FITC-Dextran Assay |
| RIP实验 | RIP试剂盒品牌、细胞裂解条件、磁珠用量(50 µL)、抗体浓度(Ago2 5 µg)、孵育时间(4°C overnight) 阅读提示:Methods: RNA Immunoprecipitation |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 预测软件(starBase)、突变构建、载体(pGL3-Promoter)、miR-320a agomir浓度(30 nM)、检测相对荧光素酶活性 阅读提示:Methods: Dual-Luciferase Reporter Assay |
| 动物实验 | 大鼠品系、体重(200±20 g)、STZ剂量(65 mg/kg)、注射方式(腹腔注射)、血糖标准(>16.7 mmol/L)、慢病毒注射体积(1 µL,109 PFU/mL)、注射时间(第7天)、取材时间(4周后) 阅读提示:Methods: Animal Experiment |
| H&E染色 | 固定液(4%多聚甲醛)、切片厚度(5 µm)、染色时间(苏木精3-5分钟,伊红5分钟) 阅读提示:Methods: H&E Staining of Retinal Tissue |