临床评估与影像学检查
评估患者症状和肿瘤特征。
患者因视力下降就诊,接受脑部MRI检查发现沿左视神经鞘的强化肿块。
Genetic characterization of an aggressive optic nerve pilocytic glioma
包含全外显子测序、组织病理学、影像学和临床随访,但缺乏功能验证或机制实验。
患者来源的视神经肿瘤活检标本 配对血液样本
体细胞突变:NF1 p.Y1613X、FGFR1 p.N546K、PTPN11 p.A72T 全外显子测序覆盖度:肿瘤300×,血液133× BRAF/KIAA1549融合:FISH检测为阴性 放疗剂量:50.4 Gy,分28次 化疗方案:替莫唑胺6个周期,150–200 mg/m²,5/28天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估患者症状和肿瘤特征。
患者因视力下降就诊,接受脑部MRI检查发现沿左视神经鞘的强化肿块。
尝试控制肿瘤生长。
患者拒绝活检后接受局灶性放疗50.4 Gy。
明确肿瘤的组织学类型。
放疗后肿瘤进展,患者接受了左视神经活检,病理确认为WHO I级毛细胞型星形细胞瘤。
鉴定肿瘤中的体细胞突变和拷贝数变异。
对活检肿瘤标本和配对血液样本进行全外显子测序,分析体细胞SNV、INDEL和CNV。
稳定肿瘤生长并监测治疗反应。
活检后,患者接受了6个周期的辅助替莫唑胺化疗,并随访MRI。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 全外显子测序 | IDT xGen外显子研究面板v1 | IDT | -- |
| Illumina NovaSeq6000 | Illumina | -- | |
| 免疫组织化学 | GFAP抗体 | -- | -- |
| Ki-67抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者年龄、性别、症状持续时间、影像学特征 阅读提示:Case description部分 |
| 放疗 | 放疗剂量、分割方案、等剂量线 阅读提示:Case description部分 |
| 活检与组织病理学 | 活检部位、组织学诊断标准 阅读提示:Case description部分 |
| 全外显子测序 | DNA提取方法、外显子捕获平台、测序平台、覆盖度、生物信息学流程 阅读提示:Methods部分: Whole exome sequencing and analysis |
| 化疗 | 化疗药物、剂量、周期、给药方案 阅读提示:Case description部分 |