侵袭性视神经毛细胞型星形细胞瘤的遗传特征

Genetic characterization of an aggressive optic nerve pilocytic glioma

作者信息Christopher S Hong, Greg Fliney, Adeniyi Fisayo, Yi An, Pallavi P Gopal, Antonio Omuro, Renelle Pointdujour-Lim, E Zeynep Erson-Omay, S Bulent Omay
PMID33098465
发布时间2021-01
DOI10.1007/s10014-020-00383-x

实验完整度

中

包含全外显子测序、组织病理学、影像学和临床随访,但缺乏功能验证或机制实验。

主要模型

患者来源的视神经肿瘤活检标本 配对血液样本

重点核对

体细胞突变:NF1 p.Y1613X、FGFR1 p.N546K、PTPN11 p.A72T 全外显子测序覆盖度:肿瘤300×,血液133× BRAF/KIAA1549融合:FISH检测为阴性 放疗剂量:50.4 Gy,分28次 化疗方案:替莫唑胺6个周期,150–200 mg/m²,5/28天

摘要

视神经胶质瘤(ONG)是一种罕见的、通常生长缓慢的WHO I级肿瘤,影响视觉通路。ONG最常见于儿科人群,与1型神经纤维瘤病综合征相关。然而,散发性成人病例也可能发生,并且尽管组织病理学为良性,但临床上可能表现得更具侵袭性。这些肿瘤的遗传特征,特别是在成人群体中,尚缺乏。一名39岁女性因左侧视神经鞘沿增强性肿块导致进行性左侧视力丧失1个月就诊。初始经验性局灶性放疗未能阻止肿瘤进展,促使进行开放活检,显示视神经WHO I级毛细胞型星形细胞瘤。活检标本的全外显子测序揭示了NF1、FGFR1和PTPN11的体细胞突变,可能为分子引导治疗提供可操作的靶点。ONG的遗传特征缺乏,但需要指导这些罕见但复杂肿瘤的管理。本病例报告的基因组改变有助于理解成人散发性ONG的病理生理学,并可能有助于未来的临床预后判断和靶向治疗的发展。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
成人散发性视神经胶质瘤的遗传特征及其与侵袭性临床行为的关系。
核心机制
NF1功能丧失突变、FGFR1激活突变和PTPN11激活突变可能共同驱动肿瘤的发生和侵袭性,其中PTPN11突变可能通过激活AKT/mTOR信号通路促进肿瘤发生。
主要证据
全外显子测序发现NF1、FGFR1和PTPN11的体细胞突变,结合组织病理学确认WHO I级毛细胞型星形细胞瘤,以及临床影像学显示肿瘤持续生长。
研究意义
为理解成人散发性ONG的病理生理学提供遗传学见解,可能有助于未来临床预后判断和靶向治疗的发展。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

临床评估与影像学检查

评估患者症状和肿瘤特征。

患者因视力下降就诊,接受脑部MRI检查发现沿左视神经鞘的强化肿块。

2

经验性放疗

尝试控制肿瘤生长。

患者拒绝活检后接受局灶性放疗50.4 Gy。

3

开放活检与组织病理学诊断

明确肿瘤的组织学类型。

放疗后肿瘤进展,患者接受了左视神经活检,病理确认为WHO I级毛细胞型星形细胞瘤。

4

全外显子测序分析

鉴定肿瘤中的体细胞突变和拷贝数变异。

对活检肿瘤标本和配对血液样本进行全外显子测序,分析体细胞SNV、INDEL和CNV。

5

辅助化疗

稳定肿瘤生长并监测治疗反应。

活检后,患者接受了6个周期的辅助替莫唑胺化疗,并随访MRI。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
IDT xGen外显子研究面板v1IDT--
Illumina NovaSeq6000Illumina--
GFAP抗体----
Ki-67抗体----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
临床样本收集
患者年龄、性别、症状持续时间、影像学特征
阅读提示:Case description部分
放疗
放疗剂量、分割方案、等剂量线
阅读提示:Case description部分
活检与组织病理学
活检部位、组织学诊断标准
阅读提示:Case description部分
全外显子测序
DNA提取方法、外显子捕获平台、测序平台、覆盖度、生物信息学流程
阅读提示:Methods部分: Whole exome sequencing and analysis
化疗
化疗药物、剂量、周期、给药方案
阅读提示:Case description部分