EPS提取与结构表征
分离并鉴定植物乳杆菌H6产生的胞外多糖,确定其作为后续功能研究对象的理化性质。
从L. plantarum H6培养物中提取cEPS和rEPS,经DEAE纤维素和凝胶色谱纯化获得EPS-D1,通过SEC-MALLS-RI测定分子量,使用HPAEC-PAD分析单糖组成,通过甲基化GC-MS和NMR波谱分析糖苷键和结构,并通过SEM观察表面形态。
A novel exopolysaccharide from Lactiplantibacillus plantarum H6 improves cholesterol metabolism via Muribaculum- mediated activation of the enterohepatic FXR-FGF15 axis
包含多项独立证据层级:体外多糖结构表征与活性试验、高胆固醇饮食小鼠模型、FMT实验验证肠道菌群作用、M. intestinale菌株回补实验、SCFAs与BAs靶向代谢组学,以及RT-qPCR和Western blot机制验证。
高胆固醇饮食C57BL/6小鼠 肠道共生菌Muribaculum intestinale(GDMCC 1.4667) 植物乳杆菌H6来源EPS-D1处理体系
EPS-D1给药剂量300 mg/kg BW,灌胃六周 M. intestinale给药剂量1×10^10 CFU/mL,灌胃六周 高胆固醇饮食诱导小鼠高胆固醇血症模型 FMT实验中受体小鼠经抗生素清除肠道菌群一周 16S rRNA测序及FMT验证肠道菌群变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
分离并鉴定植物乳杆菌H6产生的胞外多糖,确定其作为后续功能研究对象的理化性质。
从L. plantarum H6培养物中提取cEPS和rEPS,经DEAE纤维素和凝胶色谱纯化获得EPS-D1,通过SEC-MALLS-RI测定分子量,使用HPAEC-PAD分析单糖组成,通过甲基化GC-MS和NMR波谱分析糖苷键和结构,并通过SEM观察表面形态。
评估不同EPS组分的体外胆固醇结合和胆汁酸胶束溶解抑制能力,筛选出最具活性的组分用于后续研究。
通过胆固醇吸附实验和胆固醇胶束溶解度抑制实验,比较EPS-D1和EPS-D2的体外降胆固醇活性。
验证EPS-D1在动物水平上对高胆固醇饮食诱导的高胆固醇血症的改善作用。
对高胆固醇饮食小鼠灌胃EPS-D1六周,检测血清和肝脏脂质、肝损伤标志物、肝脏组织病理学变化。
验证EPS-D1调节的肠道微生物群是否足以介导其降胆固醇作用。
收集EPS-D1处理或HCD模型小鼠的粪便,移植给经抗生素清除肠道菌群的受体小鼠五周,检测脂质水平和肠道菌群变化。
通过相关性和差异分析鉴定可能介导EPS-D1降胆固醇作用的肠道核心菌株,并在小鼠模型中验证其功能。
结合16S rRNA测序和生物信息学分析,鉴定出Muribaculum和Ligilactobacillus等潜在关键菌株;进一步对高胆固醇饮食小鼠分别灌胃M. intestinale和L. salivarius六周,检测脂质水平、肝脏病理和回肠/粪便TC水平。
探究EPS-D1和M. intestinale改善胆固醇代谢的分子机制是否涉及肠肝FXR-FGF15信号通路。
通过RT-qPCR和Western blot检测肝脏和回肠中胆固醇代谢相关基因(如CYP7A1、LDLR、FXR、FGF15、NPC1L1、ASBT等)的mRNA和蛋白表达水平。
探究M. intestinale对肠道微生物代谢产物(SCFAs和BAs)的影响,以支持其作用机制。
采用GC-MS检测肠道中SCFAs含量,通过LC-MS进行胆汁酸靶向代谢组学分析,比较不同组间的代谢物谱。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 多糖提取 | MRS培养基 | -- | -- |
| 多糖分离纯化 | DEAE-纤维素柱 | -- | -- |
| Sephacryl S-400 HR 层析柱 | -- | -- | |
| 多糖结构表征 | DAWN HELEOS-II 激光光度计 | -- | -- |
| Optilab T-rEX 示差折光检测器 | -- | -- | |
| 单糖组成分析 | Dionex ICS 5000+ 系统 | Thermo Scientific | -- |
| CarboPac PA-20 色谱柱 | Thermo Scientific | -- | |
| NMR分析 | Bruker AVANCE NEO 500M 核磁共振波谱仪 | Bruker | -- |
| 体外活性测定 | 胆固醇标准溶液 | -- | 57-88-5 |
| 菌株培养 | 血平板培养基 | -- | -- |
| 动物实验 | 辛伐他汀 | -- | 79902-63-9 |
| 万古霉素 | -- | 1404-93-9 | |
| 庆大霉素 | -- | 1403-66-3 | |
| 链霉素 | -- | 57-92-1 | |
| 血清及组织生化检测 | 总胆固醇检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- |
| 甘油三酯检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 低密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 高密度脂蛋白胆固醇检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 总胆汁酸检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 天冬氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 丙氨酸氨基转移酶检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | -- | |
| 组织病理学分析 | 伊红 | -- | 17372-87-1 |
| 16S rRNA测序 | Illumina NextSeq 2000 | Illumina | -- |
| SCFAs检测 | Agilent HP-INNOWAX 毛细管柱 | Agilent | -- |
| Thermo Trace 1310 气相色谱系统 | Thermo Scientific | -- | |
| Thermo ISQ LT 质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| BAs检测 | ACQUITY UPLC BEH C18 色谱柱 | Waters | -- |
| RT-qPCR | RNA提取液 | Servicebio | G3013 |
| cDNA逆转录试剂盒 | Servicebio | G3337 | |
| SYBR Green qPCR 预混液 | Servicebio | G3326 | |
| CFX Connect 荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002 |
| 蛋白酶抑制剂 | Servicebio | G2008 | |
| LDLR抗体 | ABclonal | A20808 | |
| FXR抗体 | ABclonal | A24015 | |
| CYP7A1抗体 | ABclonal | A10615 | |
| FGF15抗体 | Abmart | PK15481S | |
| NPC1L1抗体 | Biodragon | BD-PT8127 | |
| ASBT抗体 | Baijia | IPB13168 | |
| ABCG5抗体 | Baijia | IPB0314 | |
| ABCG8抗体 | Affinit | DF6673 | |
| 数据分析与统计 | GraphPad Prism 8.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 动物品系、周龄、性别、饲养环境(SPF级,温度25±1°C,12/12小时光暗周期)、适应性喂养时间(一周)、饮食类型(正常饲料或高胆固醇饲料)。 阅读提示:Methods - Animal experiments |
| 多糖制备与表征 | L. plantarum H6培养条件(MRS培养基37°C培养24h)、cEPS和rEPS提取方法(离心转速、超生破碎功率、TCA去蛋白、醇沉、透析、冻干)、纯度检测(苯酚-硫酸法,纯度>70%)、EPS-D1纯化步骤(DEAE-纤维素柱、Sephacryl S-400 HR柱)。 阅读提示:Methods - Preparation of cEPS and rEPS, Isolation and purification of rEPS |
| 体外活性测定 | 胆固醇吸附和胆固醇胶束溶解度抑制实验的具体条件(初始胆固醇浓度、EPS-D1浓度、孵育时间、温度、离心条件),以及计算方式。 阅读提示:Methods - In vitro determination of cholesterol-lowering activity |
| 体内干预 | EPS-D1给药剂量(300 mg/kg BW)、给药途径(灌胃)、给药周期(六周);M. intestinale和L. salivarius的给药剂量(1×10^10 CFU/mL)、给药途径、给药周期。 阅读提示:Methods - Animal experiments |
| FMT实验 | 供体粪便收集和处理方法(每日收集,每100 mg粪便重悬于1 mL生理盐水)、受体小鼠的抗生素清除处理(四种抗生素混合物,具体浓度)、FMT剂量(10 mL/kg BW)和周期(五周)。 阅读提示:Methods - Animal experiment 3, Germ-free mice |
| 基因和蛋白表达分析 | RT-qPCR检测的组织来源(肝脏、回肠)、内参基因(β-actin)、计算方法(2^-ΔΔCt);Western blot检测的组织、抗体品牌和货号、凝胶浓度(8%或12%)。 阅读提示:Methods - Real-time qPCR, Western blot |
| 代谢物检测 | SCFAs检测的具体样品处理(上清液体积、磷酸内标、衍生化条件)、GC-MS参数(色谱柱型号、升温程序、离子源温度);BAs检测的样品处理方法、LC-MS参数(色谱柱、流动相梯度、质谱条件)。 阅读提示:Methods - Detection of targeted SCFAs, Detection of targeted BAs |