一项关于试管婴儿后胎盘DNA甲基化强度和估计细胞组成的胎儿性别特异性差异的Meta分析

不孕症影响着全球高达17.5%的育龄夫妇。为帮助受孕，许多夫妇求助于辅助生殖技术（ART），如体外受精（IVF）。IVF可能引入物理和环境应激源，从而可能改变DNA甲基化调控，而这是胎儿早期发育中一个重要且动态的过程。本Meta分析旨在评估自然受孕与IVF妊娠之间胎盘DNA甲基化组的差异。通过在NCBI基因表达综合数据库（GEO）中搜索2023年11月之前发表的与IVF相关的人类参与者研究的关键词，识别潜在的数据集。在我们的合并胎儿性别群体（N = 575）中，来自三个符合条件的GEO数据集的127个常染色体胞嘧啶鸟嘌呤二核苷酸（CpG）在IVF（n = 96）和自然受孕（n = 479）胎盘中显著（错误发现率（FDR）<0.05），其中47个CpG被认为是差异甲基化的（FDR < 0.05且|Δβ| > 0.05）。按胎儿性别分层显示，在女胎胎盘中（N = 281）未发现显著的常染色体CpG；然而，在男胎胎盘中（N = 294），我们识别出九个常染色体CpG在IVF（n = 56）和自然受孕（n = 238）胎盘之间达到统计学显著性，其中三个CpG被认为是差异甲基化的。无论受孕方式如何，与女胎胎盘相比，男胎胎盘的滋养细胞（P < 0.0001）和基质细胞（P = 0.007）比例较低，而合体滋养细胞（P = 0.0001）比例较高。无论性别如何，与自然受孕胎盘相比，IVF胎盘的基质细胞比例较高（P = 0.01），合体滋养细胞比例较低（P = 0.01）。在线性模型中控制细胞类型比例可减少检验统计量膨胀，并识别出可能先前被细胞类型异质性掩盖的新的显著CpG。本Meta分析的结果对于进一步理解IVF对组织表观遗传学的影响至关重要，这可能有助于理解IVF与不良妊娠结局之间的联系。此外，我们的研究表明，胎儿性别特异性的胎盘DNA甲基化和细胞组成差异应被视为未来胎盘DNA甲基化分析的考虑因素。