体内验证MYO1F在T细胞活化中的作用
探究MYO1F在T细胞中缺失对体内抗肿瘤免疫和自身免疫反应的影响。
建立MC38和B16皮下肿瘤模型及B16转移模型,比较T细胞特异性Myo1f敲除小鼠与对照小鼠的肿瘤生长、转移和T细胞浸润;诱导EAE模型,评估临床评分和病理变化。
MYO1F regulates T-cell activation and glycolytic metabolism by promoting the acetylation of GAPDH
包含体外细胞实验、小鼠肿瘤模型、EAE模型、患者样本分析等多个独立证据层级,并有功能验证(敲除/过表达)和机制验证(磷酸化、乙酰化修饰)。
T细胞特异性Myo1f敲除小鼠 hVAV1-MYO1F敲入小鼠 Jurkat细胞 人PTCL患者样本
T细胞特异性Myo1f敲除小鼠的构建方式(LCK-Cre) 抗CD3/CD28刺激浓度(2 μg/mL)及时间(5小时) GAPDH活性测定试剂盒(ab204732,Abcam) KA给药剂量(1 mg/kg,腹腔注射) 患者样本中MYO1F-VAV1融合基因检测方法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究MYO1F在T细胞中缺失对体内抗肿瘤免疫和自身免疫反应的影响。
建立MC38和B16皮下肿瘤模型及B16转移模型,比较T细胞特异性Myo1f敲除小鼠与对照小鼠的肿瘤生长、转移和T细胞浸润;诱导EAE模型,评估临床评分和病理变化。
验证MYO1F对人和小鼠T细胞活化和增殖的直接影响。
用siRNA敲低人T细胞中的MYO1F或使用Myo1f敲除小鼠的T细胞,用抗CD3/CD28刺激,检测IL-2产生、TCR信号通路蛋白磷酸化和增殖标志物;在Jurkat细胞中过表达MYO1F,观察活化标志。
确定MYO1F调控T细胞活化的分子机制,特别是GAPDH乙酰化的作用。
通过免疫沉淀和质谱鉴定MYO1F相互作用蛋白;用免疫共沉淀、免疫荧光、PLA实验验证MYO1F与GAPDH的相互作用;检测MYO1F对GAPDH乙酰化水平和酶活性的影响。
验证GAPDH乙酰化位点(K84/86/227)对其酶活性和T细胞功能的重要性。
质谱鉴定乙酰化位点;构建GAPDH突变体(K84R、K86R、K227R、K3R),检测乙酰化水平、酶活性、与MYO1F结合以及T细胞活化和代谢。
验证LCK对MYO1F的磷酸化是否影响MYO1F与α-TAT1的结合以及下游GAPDH乙酰化。
通过免疫共沉淀验证MYO1F与LCK的相互作用;质谱鉴定LCK磷酸化的酪氨酸位点;构建Y2F突变体,检测磷酸化、与α-TAT1的结合、GAPDH乙酰化、T细胞活化和代谢。
阐明VAV1-MYO1F融合蛋白如何驱动T细胞过度活化和PTCL。
比较VAV1-MYO1F融合蛋白与野生型MYO1F与α-TAT1和GAPDH的相互作用;检测GAPDH乙酰化水平、酶活性、T细胞活化和代谢;在hVAV1-MYO1F敲入小鼠中验证GAPDH抑制剂KA的治疗效果。
验证人类PTCL样本中MYO1F-VAV1融合与GAPDH过度乙酰化的关联。
收集PTCL患者样本,检测MYO1F-VAV1融合基因,并通过免疫组化检测GAPDH乙酰化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| T细胞分选 | EasySep™小鼠CD4+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19852 |
| EasySep™小鼠初始CD4+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19765 | |
| EasySep™小鼠初始CD8+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19858 | |
| EasySep™小鼠CD8+ T细胞分选试剂盒 | STEMCELL | 19853 | |
| GAPDH活性测定 | GAPDH活性检测试剂盒 | Abcam | ab204732 |
| 免疫印迹 | 抗p-Zap-70抗体 | Cell Signaling Technology | 2717 |
| 抗Zap-70抗体 | Cell Signaling Technology | 3165 | |
| 免疫沉淀 | 抗HA抗体 | Sigma | H9658 |
| 抗Flag抗体 | Sigma | F1804 | |
| 免疫印迹 | 抗MYO1F抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-376534 |
| 抗p-ERK抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-81492 | |
| 抗磷酸化酪氨酸抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-13524 | |
| 抗HSP90抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-130068 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-8432 | |
| 抗GAPDH抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-271269 | |
| 抗ERK抗体 | SANTA CRUZ BIOTECHNOLOGY | sc-293335 | |
| 抗LCK抗体 | ABclonal | A2177 | |
| 抗Flag标签抗体 | ABclonal | AE024 | |
| 抗Myc标签抗体 | ABclonal | AE070 | |
| 抗p-Lck抗体(Y394) | R&D Systems | MAB7500 | |
| 抗乙酰赖氨酸抗体 | Abcam | ab21623 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD3抗体 | BioLegend | 100221 |
| 抗小鼠CD4抗体 | BioLegend | 100405 | |
| 抗人CD4抗体 | BioLegend | 980802 | |
| 抗小鼠CD8抗体 | BioLegend | 100705 | |
| 抗人CD8抗体 | BioLegend | 980908 | |
| 抗小鼠CD45抗体 | BioLegend | 103132 | |
| 抗小鼠CD11b抗体 | BioLegend | 101212 | |
| 抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123110 | |
| 抗小鼠Ly-6C抗体 | BioLegend | 128036 | |
| 抗小鼠Ly-6G抗体 | BioLegend | 127628 | |
| 抗小鼠B220抗体 | BioLegend | 102222 | |
| 抗小鼠IFN-γ抗体 | BioLegend | 505808 | |
| 抗人IFN-γ抗体 | BioLegend | 383303 | |
| 抗小鼠IL-17A抗体 | BioLegend | 506916 | |
| 抗小鼠CD69抗体 | BioLegend | 104513 | |
| 抗人CD69抗体 | BioLegend | 310910 | |
| 抗小鼠Ki-67抗体 | BioLegend | 652404 | |
| 抗人Ki-67抗体 | BioLegend | 350503 | |
| Zombie Violet细胞活力检测试剂盒 | BioLegend | 423114 | |
| 代谢分析 | Seahorse XF HS Mini细胞外通量分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | -- | |
| 细胞培养 | 2-脱氧-D-葡萄糖 | -- | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| 葡萄糖 | -- | -- | |
| IV型胶原酶 | Sigma | -- | |
| 脱氧核糖核酸酶I | Biofroxx | -- | |
| 细胞过滤器 | Biologix Group Limited | -- | |
| 免疫组织化学 | DAB显色试剂盒 | BD Pharmingen | -- |
| Harris苏木素 | Fisher Scientific | -- | |
| EAE诱导 | MOG35-55肽 | -- | -- |
| 完全弗氏佐剂 | Difco | -- | |
| 百日咳毒素 | -- | -- | |
| 体内处理 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 庚二酸 | -- | -- | |
| 转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| RfectSP siRNA转染试剂 | Biogenerating Biotechnology | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | -- | -- |
| RT-PCR | SuperScript® II逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| SYBR Green实时定量PCR预混液 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 蔡司LSM 900显微镜 | Zeiss | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 山羊血清 | -- | -- | |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | A-Sepharose珠 | -- | -- |
| G-Sepharose珠 | -- | -- | |
| 质谱分析 | Agilent Zorbax 300SB-C18色谱柱 | Agilent | -- |
| Eskigent纳升液相色谱系统 | -- | -- | |
| Thermo LTQ-ETD-Orbitrap质谱仪 | Thermo | -- | |
| Advion Triversa nanomate纳喷雾源 | Advion | -- | |
| 生物信息学 | PyMOL软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体内动物模型 | 小鼠品系、基因敲除策略、肿瘤细胞系、注射剂量和途径、EAE诱导条件、KA给药剂量和方式 阅读提示:材料与方法:Mice、In vivo tamoxifen and KA treatment;图1、图6、补充图2 |
| T细胞分离与刺激 | 小鼠品系、组织来源、分选试剂盒、刺激抗体浓度和刺激时间 阅读提示:材料与方法:T-cell isolation and stimulation;图2、补充图4 |
| 分子相互作用与修饰验证 | 质粒构建、转染细胞系、抗体克隆号、免疫沉淀条件、质谱参数 阅读提示:材料与方法:Reagents、Immunoblotting and immunoprecipitation、Mass spectrometry;图3、图4、图5 |
| GAPDH活性与代谢分析 | 试剂盒品牌货号、细胞处理、ECAR检测设备及浓度设置 阅读提示:材料与方法:GAPDH activity measurement、ECAR;图3、图4、图6 |
| 患者样本分析 | 样本来源与数量、融合基因检测方法、IHC抗体和评分方法 阅读提示:材料与方法:Human PTCL sample study、Immunohistochemistry;图7 |