临床样本与小鼠模型中GITR表达和LPC水平分析
探究脓毒症中脂质代谢变化与炎症损伤的关系,并评估GITR表达与脓毒症严重程度及LPC水平的相关性。
分析脓毒症患者血清LDL-C、LPC水平及单核细胞GITR表达,通过ELISA和流式细胞术检测;在CLP小鼠模型中检测GITR表达和LPC水平。
GITR exacerbates lysophosphatidylcholine-induced macrophage pyroptosis in sepsis via posttranslational regulation of NLRP3
体外巨噬细胞实验、体内CLP与LPS脓毒症模型、临床样本分析及机制研究(Co-IP、GST pull-down、PTM检测)等多层次验证。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 永生化小鼠BMDM细胞系(iBMDM) CLP诱导的脓毒症小鼠模型 LPS诱导的内毒素血症小鼠模型
LPC处理BMDMs的浓度(100 μM)和时间(3h) LPS priming浓度(200 ng/mL)及nigericin/ATP处理时间 MCC950(NLRP3抑制剂)预处理浓度(10 μM)和时间(1h) DTA-1(抗GITR激动性抗体)体内注射剂量(0.5 mg)和时间(CLP前6h) LPC体内注射剂量(10 mg/kg)和LPS剂量(20 mg/kg)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究脓毒症中脂质代谢变化与炎症损伤的关系,并评估GITR表达与脓毒症严重程度及LPC水平的相关性。
分析脓毒症患者血清LDL-C、LPC水平及单核细胞GITR表达,通过ELISA和流式细胞术检测;在CLP小鼠模型中检测GITR表达和LPC水平。
验证GITR是否促进巨噬细胞对LPC的摄取以及LPC诱导的NLRP3炎症小体激活和焦亡。
使用WT和Gitr-/- BMDMs,或Casp1-/- BMDMs,给予LPC处理,检测LPC摄取、LDH释放、IL-1β分泌、GSDMD/caspase-1/IL-1β裂解。
确定GITR是否特异性地促进NLRP3炎症小体而非其他炎症小体的激活。
使用NLRP3特异性激活剂(LPS+nigericin或ATP)处理WT和Gitr-/- BMDMs及GITR过表达iBMDMs,检测caspase-1/IL-1β裂解和分泌;同时用LPS转染、flagellin转染、poly(dA:dT)转染激活非经典、NLRC4和AIM2炎症小体。
探究GITR如何影响NLRP3蛋白水平及NLRP3炎症小体组装。
比较WT和Gitr-/- BMDMs中NLRP3 mRNA和蛋白水平,检测ASC寡聚化、ASC斑点形成及NLRP3-ASC相互作用(Co-IP)。
揭示GITR通过竞争结合MARCH7调节NLRP3泛素化和乙酰化的机制。
在BMDMs和HEK293T细胞中检测NLRP3泛素化水平;通过Co-IP和GST pull-down验证GITR与MARCH7的相互作用及对NLRP3-MARCH7结合的影响;检测SIRT2蛋白水平和稳定性。
评估GITR在脓毒症体内模型中对炎症损伤和致死率的影响,并验证其依赖性。
对Gitrfl/flLyz2-cre和Gitrfl/fl小鼠进行CLP手术,观察生存率和肺损伤;对WT、Nlrp3-/-、Casp1-/-、Il1bfl/flLyz2-cre小鼠注射DTA-1或IgG后进行CLP;LPS模型给予LPC或对照,观察生存率和炎症因子。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 溶血磷脂酰胆碱(855675P) | Sigma-Aldrich | 855675P |
| 脂多糖(L4130) | Sigma-Aldrich | L4130 | |
| 尼日利亚霉素(tlrl-nig) | Invivogen | tlrl-nig | |
| 三磷酸腺苷(tlrl-atp) | Invivogen | tlrl-atp | |
| poly(dA:dT)(tlrl-patn) | Invivogen | tlrl-patn | |
| 鞭毛蛋白(tlrl-epstfla) | Invivogen | tlrl-epstfla | |
| 抑制剂处理 | 鲁索替尼 | -- | -- |
| BAY-7085 | -- | -- | |
| MCC950 | -- | -- | |
| 巴弗洛霉素A1 | -- | -- | |
| MG132 | -- | -- | |
| 抗体 | 抗FLAG M2亲和凝胶(A2220) | Sigma-Aldrich | A2220 |
| 抗c-Myc琼脂糖凝胶(A7470) | Sigma-Aldrich | A7470 | |
| Western blot | 抗β-肌动蛋白(A1978) | Sigma-Aldrich | A1978 |
| 抗GST(2625S) | Cell Signaling Technology | 2625S | |
| 抗HA(3724S) | Cell Signaling Technology | 3724S | |
| 抗Flag(2368S) | Cell Signaling Technology | 2368S | |
| 抗ASC(67824S) | Cell Signaling Technology | 67824S | |
| 抗泛素(3933S) | Cell Signaling Technology | 3933S | |
| 抗乙酰化赖氨酸(9441S) | Cell Signaling Technology | 9441S | |
| 抗Caspase-1 p20(AG-20B-0042) | AdipoGen | AG-20B-0042 | |
| 抗NLRP3(AG-20B-0014) | AdipoGen | AG-20B-0014 | |
| 抗MARCH7(H00064844-M01) | NOVUS | H00064844-M01 | |
| 抗GSDMD(ab209845) | Abcam | ab209845 | |
| 抗SIRT2(19655-1-AP) | Proteintech | 19655-1-AP | |
| 抗HSP90(13171-1-AP) | Proteintech | 13171-1-AP | |
| 抗组蛋白H3(17168-1-AP) | Proteintech | 17168-1-AP | |
| 抗细胞角蛋白18(10830-1-AP) | Proteintech | 10830-1-AP | |
| 抗SP1(21962-1-AP) | Proteintech | 21962-1-AP | |
| ELISA | 抗IL-1β(AF-401-NA) | R&D | AF-401-NA |
| 流式细胞术 | 抗GITR(MAB5241, MAB62412) | R&D | MAB5241, MAB62412 |
| Western blot | 抗His(MAB050) | R&D | MAB050 |
| 流式细胞术 | 抗人/小鼠CD11b(101206) | BioLegend | 101206 |
| 抗人CD3(317336) | BioLegend | 317336 | |
| 抗人CD4(317408) | BioLegend | 317408 | |
| 抗人CD8(344722) | BioLegend | 344722 | |
| 抗人CD357(311604) | BioLegend | 311604 | |
| 抗小鼠F4/80(123118) | BioLegend | 123118 | |
| 抗小鼠CD357(126310) | BioLegend | 126310 | |
| 抗IL-1β(2016884) | Invitrogen | 2016884 | |
| 抗TNF-α(506306) | BioLegend | 506306 | |
| 抗IL-6(504508) | BioLegend | 504508 | |
| 细胞培养 | OptiMEM培养基 | -- | -- |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 |
| 亚细胞分级 | 亚细胞蛋白分级分离试剂盒(78840) | ThermoFisher | 78840 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher | -- |
| SYBR Green预混液 | Promega | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| Western blot | New-SUPER ECL化学发光底物(KGP1128) | KeyGEN | KGP1128 |
| ASC寡聚化 | 双琥珀酰亚胺辛二酸酯(DSS) | -- | -- |
| LDH检测 | CytoTox 96非放射性细胞毒性检测试剂盒 | Promega | -- |
| SPR | CM5芯片 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 荧光显微镜(Olympus) | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验(BMDM) | LPC浓度100 μM,处理时间3-12小时;LPS浓度200 ng/mL,priming 3小时;nigericin 20 μM或ATP 5 mM处理40分钟;GITR敲除或过表达验证 阅读提示:Methods中的Cell culture和Inflammasome stimulation小节,Figure 2、3图注 |
| 炎症小体激活特异性验证 | NLRP3特异性激活剂(LPS+nigericin/ATP)与非经典(LPS转染)、NLRC4(flagellin转染)、AIM2(poly(dA:dT)转染)激活条件;MCC950预处理浓度10 μM、1小时 阅读提示:Methods中的Inflammasome stimulation小节,Figure 3图注 |
| 体内CLP脓毒症模型 | 小鼠品系(C57BL/6J或Gitrfl/flLyz2-cre等);CLP手术细节(穿刺次数、针头规格);DTA-1注射剂量0.5 mg、时间(术前6h);观察生存率和肺损伤 阅读提示:Methods中的Animal experiments和In vivo sepsis model小节,Figure 7图注 |
| 体内LPS脓毒症模型 | LPC注射剂量10 mg/kg、LPS剂量20 mg/kg,腹腔注射,间隔6小时;观察生存率和肺损伤 阅读提示:Methods中的Animal experiments和In vivo sepsis model小节,Figure 8图注 |
| 蛋白互作与PTM检测 | Co-IP抗体(抗Flag、HA、Myc、NLRP3)、泛素化/乙酰化检测抗体;泛素化位点突变质粒(K324、K430、K689、K799);GST pull-down纯化蛋白浓度 阅读提示:Methods中的Immunoprecipitation和GST pull-down小节,Figure 5、6图注 |