双硫仑通过靶向RNF115改善STING/MITA依赖性炎症和自身免疫

Disulfiram ameliorates STING/MITA-dependent inflammation and autoimmunity by targeting RNF115

作者信息Zhi-Dong Zhang, Chang-Rui Shi, Fang-Xu Li, Hu Gan, Yanhong Wei, Qianhui Zhang, Xin Shuai, Min Chen, Yu-Lin Lin, Tian-Chen Xiong, Xiaoqi Chen, Bo Zhong, Dandan Lin
PMID38267694
发布时间2024-03
DOI10.1038/s41423-024-01131-3

实验完整度

高

包含基因敲除小鼠模型(Rnf115–/–Trex1–/–、Rnf115–/–STINGN153S/WT)、骨髓嵌合小鼠模型、体外细胞实验(GM-DCs/Macs、MLFs、MPMECs、PBMCs)及机制验证(泛素化、寡聚化、细胞内定位)。

主要模型

Trex1–/–小鼠 STINGN153S/WT小鼠及骨髓嵌合小鼠 骨髓来源树突状细胞和巨噬细胞(GM-DCs/Macs) SLE患者外周血单个核细胞(PBMCs)

重点核对

RNF115敲除对Trex1–/–小鼠生存率和炎症因子水平的影响 RNF115敲除对STINGN153S/WT骨髓嵌合小鼠生存率和免疫细胞发育的影响 RNF115敲除或DSF处理对SLE患者PBMCs中IFN-α、IFN-γ和促炎细胞因子表达的抑制作用 RNF115敲除对STING和STINGN153S K63链接泛素化、寡聚化及高尔基体定位的影响 DSF处理对Trex1–/–小鼠和NS→WT嵌合小鼠自身免疫表型的改善作用

摘要

STING(也称为MITA)是一种衔接蛋白,介导胞质DNA触发的信号传导,胞质自身DNA或功能获得性突变导致的STING/MITA异常激活会引起严重炎症。在这里,我们展示了STING介导的炎症和自身免疫由RNF115促进,并由RNF115抑制剂双硫仑(DSF)缓解。敲除RNF115或DSF治疗可显著抑制Trex1–/–小鼠和STINGN153S/WT骨髓嵌合小鼠的全身性炎症和自身免疫致死性,并恢复免疫细胞发育。此外,敲低或药理学抑制RNF115可显著下调外周血dsDNA浓度高的系统性红斑狼疮(SLE)患者PBMCs中IFN-α、IFN-γ和促炎细胞因子的表达。机制上,敲除或抑制RNF115会损害多种cGAMP转染细胞以及Trex1–/–小鼠器官和细胞中STING的寡聚化和高尔基体定位。有趣的是,敲除RNF115抑制了髓系细胞中STINGN153S的激活和高尔基体定位以及促炎细胞因子的表达,但在内皮细胞或成纤维细胞中则不然。总之,这些发现强调了RNF115介导的STING和STINGN153S的细胞类型特异性调节,并为STING相关自身免疫疾病提供了潜在的靶向干预策略。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
RNF115是否以及如何调节STING介导的炎症和自身免疫?
核心机制
RNF115通过催化STING和STINGN153S的K63链接多聚泛素化,促进其寡聚化和从内质网到高尔基体的转运,从而激活下游信号和炎症因子表达。
主要证据
在Trex1–/–小鼠和STINGN153S/WT小鼠模型中,敲除RNF115或使用DSF可抑制STING的K63泛素化、寡聚化、高尔基体定位及下游炎症因子表达,减轻自身免疫表型;在SLE患者PBMCs中,敲低或抑制RNF115可降低IFN和促炎因子表达。
研究意义
文章提出靶向RNF115的DSF是STING相关自身免疫疾病(如SLE)的潜在治疗策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定STING相互作用蛋白

寻找TREX1缺陷介导的自身免疫中STING的潜在调控因子。

通过免疫沉淀联合质谱分析,鉴定与STING相互作用的E3泛素连接酶RNF115。

2

基因敲除小鼠模型验证RNF115在自身免疫中的作用

验证RNF115是否促进Trex1–/–小鼠和STINGN153S/WT小鼠的自身免疫表型。

生成Rnf115–/–Trex1–/–小鼠和Rnf115–/–STINGN153S/WT小鼠,分析生存率、体重、器官病理、免疫细胞组成及炎症因子表达。

3

骨髓嵌合小鼠验证造血细胞中RNF115的作用

确定RNF115在造血细胞中是否调节STINGN153S驱动的自身免疫。

将野生型、NS或115NS小鼠的骨髓细胞移植到致死性照射的野生型或Rnf115–/–小鼠中,评估生存、免疫细胞发育和炎症指标。

4

体外细胞实验验证RNF115对STINGN153S的细胞类型特异性作用

验证RNF115是否特异性地调节髓系细胞中STINGN153S的激活。

比较野生型、NS和115NS小鼠的GM-DCs/Macs、MLFs和MPMECs中炎症因子表达,以及STINGN153S的亚细胞定位。

5

机制研究:泛素化和寡聚化分析

明确RNF115是否通过催化K63泛素化促进STING和STINGN153S的寡聚化和激活。

通过变性IP、免疫沉淀、SDD-AGE等方法检测STING的泛素化、寡聚化及其与TBK1的相互作用。

6

药理学验证:DSF对STING信号和自身免疫的影响

验证RNF115抑制剂DSF是否能抑制STING介导的炎症和自身免疫。

用DSF处理细胞和小鼠,检测STING泛素化、寡聚化、下游基因表达及自身免疫表型。

7

临床样本验证:SLE患者PBMCs

验证RNF115在SLE患者PBMCs中调节炎症因子表达的作用。

收集SLE患者外周血,分离PBMCs,敲低RNF115或DSF处理,检测ISG15、CXCL10、CCL5、IFN-α、IFN-γ等表达。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM培养基----
胎牛血清----
青霉素-链霉素----
粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子CHAMOT Biotechnology--
双硫仑TargetMol--
鲁索替尼TargetMol--
环状GMP-AMPInvivoGen1441190-66-4
二甲基亚砜Sigma--
Ficoll-Plaque PLUS试剂盒GE Healthcare17-1440-02
Ultra Fection 2.0转染试剂4A BiotechFXP092-010
TRIzol试剂Life Technologies15596026
氯仿----
异丙醇----
乙醇----
All-in-One cDNA合成超混合液Aidlab Biotechnologies--
Hieff® qPCR SYBR Green Master MixYeasen Biotechnology11201ES08
NP-40裂解缓冲液----
蛋白酶和磷酸酶抑制剂APExBIOK1015
蛋白G琼脂糖----
抗FLAG磁珠----
抗STING抗体Cell Signaling Technology/ABclonal13647
抗RNF115抗体Abcamab187642
抗TBK1抗体Abcam96328-11
抗磷酸化STING (Ser365)抗体Cell Signaling Technology72971S
抗磷酸化TBK1 (Ser172)抗体Abcamab109272
抗FLAG抗体SigmaF3165
抗Tubulin抗体ABclonalA12289
抗K63链接泛素抗体Millipore05-1308
抗泛素抗体Santa Cruz Biotechnologysc-8017
HRP标记的山羊抗小鼠IgGThermo ScientificPA1-86717
HRP标记的山羊抗兔IgGThermo ScientificSA1-9510
抗小鼠CD11b-PE抗体Biolegend101208
抗小鼠CD11c-PerCP抗体Biolegend117328
抗小鼠Ly6G-APC-Cy7抗体Biolegend127624
抗小鼠F4/80-BV421抗体Biolegend123137
抗小鼠CD3-FITC抗体Biolegend100306
抗小鼠CD19-APC抗体Biolegend152409
抗小鼠GL7-PerCP抗体Biolegend144610
抗小鼠FAS-PE抗体Biolegend152608
抗小鼠CD3-APC抗体Biolegend100312
抗小鼠CD4-FITC抗体Biolegend100406
抗小鼠CD8-BV510抗体Biolegend100751
抗小鼠NK1.1-APC抗体Biolegend156506
抗小鼠CD69-FITC抗体Biolegend104506
抗小鼠GzmB-PE抗体Biolegend372208
抗小鼠CD4-BV421抗体Biolegend100427
抗小鼠Sca-1-APC抗体Biolegend108111
抗小鼠Lineage生物素抗体BD Biosciences559971
链霉亲和素-APC-CY7BD Biosciences554063
抗c-Kit-PE抗体Biolegend105807
抗人CD3-PE抗体ABclonalA22795
抗人CD4-FITC抗体ABclonalA22773
抗人CD8-APC抗体ABclonalA24799
抗人IFN-γ-PE-CY7抗体BD Biosciences557643
抗人IFN-α-PE抗体BD Biosciences560097
佛波醇酯SigmaP8139
离子霉素SigmaI0634
高尔基体阻断剂BD Biosciences554724
肺解离试剂盒Miltenyi Biotech--
抗CD45磁珠Miltenyi Biotec--
抗CD31抗体----
I型胶原酶Worthington--
脱氧核糖核酸酶ISigma-Aldrich--
PEI转染试剂Polysciences, Inc.24765-1
单纯疱疹病毒1型----
玉米油----
血清/血浆循环DNA提取试剂盒TiangenDP336
Qubit dsDNA HS检测试剂盒ABclonalRK30140
ABplex定制多因子ELISA试剂盒ABclonal Technology--
串联泛素结合实体LifeSensors--
奥林巴斯FV1000荧光显微镜Olympus--
Aperio VERSA 8扫描仪Leica--
琼脂糖凝胶Bio-Rad--
FACS Celesta流式细胞仪BD--
Fortessa流式细胞仪BD--
EASY-nLC 1200液相色谱系统Thermo Scientific--
Orbitrap Exploris 480质谱仪Thermo Scientific--
Proteome Discoverer软件Thermo Scientific2.4

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型
小鼠品系和基因型:Rnf115–/–、Trex1+/–、STINGN153S/WT、Rnf115–/–Trex1–/–、Rnf115–/–STINGN153S/WT;年龄匹配;SPF环境。
阅读提示:Methods: Mice
骨髓嵌合小鼠
受体小鼠:野生型或Rnf115–/–,10周龄,致死性照射(9 Gy,分两次4.5 Gy);供体骨髓细胞:1×10^6,尾静脉注射。
阅读提示:Methods: Bone marrow chimeric mice
细胞培养
GM-DCs/Macs分化:骨髓细胞+GM-CSF (20 ng/ml);MLFs:原代肺成纤维细胞;MPMECs:CD31+肺微血管内皮细胞;培养基:DMEM+10% FBS+1%青霉素-链霉素。
阅读提示:Methods: Cell culture; Isolation of MPMECs
药物处理
DSF剂量:体外5 μM;体内:HSV-1模型20 mg/kg,自身免疫模型50 mg/kg(腹腔注射,隔日一次);Ruxolitinib处理浓度未明确说明。
阅读提示:Methods: DSF administration; Reagents
cGAMP转染
cGAMP浓度1 μg/μl,用PBS稀释(体积为培养基的50%),处理30分钟,然后换液培养3小时。
阅读提示:Methods: Transfection of cGAMP
临床样本
SLE患者诊断标准(EULAR/ACR 2019);PBMCs分离:Ficoll-Paque PLUS;dsDNA定量:血浆dsDNA浓度,cutoff为0.1 μg/ml;siRNA或DSF处理24小时。
阅读提示:Methods: Clinical samples; Generation and treatment of PBMCs