B细胞中增强的CD19活性导致ICF综合征基因Zbtb24缺陷小鼠的免疫缺陷

Enhanced CD19 activity in B cells contributes to immunodeficiency in mice deficient in the ICF syndrome gene Zbtb24

作者信息Zhengzhou Ying, Swanand Hardikar, Joshua B Plummer, Tewfik Hamidi, Bin Liu, Yueping Chen, Jianjun Shen, Yunxiang Mu, Kevin M McBride, Taiping Chen
PMID37990035
发布时间2023-12
DOI10.1038/s41423-023-01106-w

实验完整度

包含条件性基因敲除小鼠模型(体内)、细胞系(CH12F3)基因编辑(体外)、RNA-seq、流式细胞术、ELISA、蛋白印迹、亚硫酸盐测序等多层级验证,具备功能与机制验证。

主要模型

Vav-Cre介导的造血系Zbtb24条件敲除小鼠(VAV-CKO) CD19-Cre介导的B细胞Zbtb24条件敲除小鼠(CD19-CKO) Zbtb24敲除的CH12F3小鼠B细胞淋巴瘤细胞系 小鼠原代边缘区(MZ)和滤泡(FO)B细胞

重点核对

Vav-Cre介导的Zbtb24条件敲除小鼠(VAV-CKO) CD19-Cre介导的B细胞Zbtb24条件敲除小鼠(CD19-CKO) Zbtb24敲除的CH12F3小鼠B细胞淋巴瘤细胞系 小鼠原代边缘区(MZ)和滤泡(FO)B细胞

摘要

免疫缺陷、着丝粒不稳定和面部异常(ICF)综合征是一种罕见的常染色体隐性遗传病,其特征是DNA低甲基化和抗体缺陷。它由DNMT3B、ZBTB24、CDCA7或HELLS的突变引起。虽然在阐明这些基因在调控DNA甲基化中的作用方面取得了进展,但对危及生命的低丙种球蛋白血症表型的发病机制知之甚少。在这里,我们表明造血谱系中Zbtb24缺陷的小鼠重现了ICF综合征患者的主要临床特征。具体来说,Vav-Cre介导的Zbtb24敲除不影响淋巴细胞发育,但导致浆细胞减少和IgM、IgG1及IgA水平降低。Zbtb24缺陷小鼠对T依赖性和T非依赖性2型抗原分别表现出高反应性和低反应性,并且边缘区B细胞活化受损。机制上,Zbtb24缺陷的B细胞在Il5ra(白细胞介素-5受体α亚基)的启动子区域显示严重的DNA甲基化丢失,Il5ra的去抑制导致CD19磷酸化升高。Cd19的杂合破坏可以逆转Zbtb24缺陷小鼠的低丙种球蛋白血症表型。我们的结果提示增强的CD19活性在ICF综合征免疫缺陷中的潜在作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
ICF综合征中Zbtb24缺陷导致抗体缺陷(低丙种球蛋白血症)的细胞和分子机制是什么?
核心机制
Zbtb24缺失导致B细胞中Il5ra启动子区域DNA甲基化丢失,引起Il5ra去抑制,IL-5Rα表达上调,进而增强CD19磷酸化,最终导致低丙种球蛋白血症。
主要证据
通过Vav-Cre条件敲除小鼠在体内重现低丙种球蛋白血症,发现B细胞中Il5ra启动子甲基化丧失和CD19磷酸化增强;在CH12F3细胞中过表达IL-5Rα或敲低Il5ra分别增强或减弱CD19磷酸化;杂合破坏Cd19可逆转小鼠的表型。
研究意义
研究为ICF综合征的免疫缺陷提供了小鼠模型和机制见解,提示靶向IL-5、IL-5Rα、CD19和BCR信号通路的现有治疗药物可能用于治疗ICF综合征。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

小鼠模型建立与基因型验证

构建Zbtb24条件敲除小鼠并验证敲除效率。

通过同源重组生成Zbtb24条件敲除等位基因,与Vav-Cre等Cre转基因小鼠交配建立造血系和B细胞特异性敲除小鼠,使用PCR和Western blot验证B220+ B细胞和CD3+ T细胞中的Zbtb24缺失。

2

免疫表型分析:基础Ig水平和淋巴细胞亚群

评估Zbtb24缺陷对淋巴细胞发育和血清免疫球蛋白水平的影响。

通过ELISA检测不同年龄小鼠血清中IgG1、IgM、IgA等水平,通过流式细胞术分析骨髓和脾脏中B细胞和T细胞亚群以及浆细胞比例和数量。

3

免疫功能评估:免疫原刺激

评估Zbtb24缺陷小鼠对T依赖和T非依赖抗原的体液免疫应答。

用NP-KLH(TD抗原)、NP-LPS(TI-1)和NP-Ficoll/NP-dextran(TI-2)免疫小鼠,收集血清并检测NP特异性抗体,同时分析脾脏生发中心B细胞。

4

体外B细胞功能验证:增殖与活化

验证Zbtb24缺陷对B细胞活化增殖的影响。

分选FO和MZ B细胞,用CTV标记后分别用抗IgM或LPS刺激72小时,流式细胞术检测增殖;另用抗IgM或IL-5刺激后收集细胞进行Western blot检测信号分子磷酸化。

5

机制研究:转录组、甲基化及靶基因鉴定

鉴定Zbtb24调控的下游分子及表观遗传机制。

对分选的FO和MZ B细胞进行RNA-seq,筛选差异表达基因;通过RT-qPCR验证候选基因;通过亚硫酸盐测序分析Il5ra启动子CpG甲基化状态;在CH12F3细胞中通过过表达/敲低验证Il5ra功能。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI 1640培养基----
胎牛血清----
CellTrace Violet细胞增殖试剂盒Thermo Fisher Scientific--
抗小鼠IgM(F(ab')2片段)Jackson ImmunoResearch--
Tissue-Tek O.C.T.包埋剂ProSciTech--
花生凝集素-FITCSigma‒Aldrich--
Triton X-100Sigma‒Aldrich--
含DAPI封片剂Life Technologies--
小鼠MZ和FO B细胞分选试剂盒Miltenyi--
LS柱Miltenyi--
RNeasy Mini试剂盒Qiagen--
Illumina HiSeq 3000Illumina--
TRIzol试剂Invitrogen--
ProtoScript第一链cDNA合成试剂盒New England Biolabs--
iTaq Universal SYBR Green PCR预混液Bio-Rad--
ABI 7900实时荧光定量PCR系统Thermo Fisher Scientific--
蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物Thermo Fisher Scientific--
抗Zbtb24抗体MBLPM085
抗CD19抗体Cell Signaling Technology3574
抗磷酸化CD19 (Tyr531)抗体Cell Signaling Technology3571
抗磷酸化Akt抗体Cell Signaling Technology9271
抗磷酸化PLCγ抗体Cell Signaling Technology50535
抗磷酸化CD79a抗体Cell Signaling Technology5173
抗β-actin抗体Sigma‒AldrichA5441
抗HA标签抗体Cell Signaling Technology3724
Clonotyping System-HRPSouthern Biotech--
小鼠免疫球蛋白亚型标准品Southern Biotech--
BD CBA小鼠/大鼠可溶性蛋白制备缓冲液试剂盒BD Biosciences558266
BD CBA小鼠IL-5 Flex SetBD Biosciences558302
BD LSRFortessa流式细胞仪BD Biosciences--
FACSFusion流式细胞仪BD Biosciences--
Zeiss LSM880共聚焦显微镜Zeiss--
CH12F3细胞系----
293T细胞----
pMD2.G载体Addgene12259
psPAX2载体Addgene12260
pCDH-EF1-FHC载体Addgene64874
pLKO.1 puro载体Addgene8453
pL-CRISPR.EFS.GFP载体Addgene57818
聚凝胺----
嘌呤霉素----
明矾Thermo Fisher Scientific--
NP(7)-BSA、NP(20)-BSABiosearch Technologies--
重组小鼠IL-5R&D Systems--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
小鼠模型
Zbtb242lox等位基因的构建和验证,Cre品系(Vav-Cre、CD19-Cre、Lck-Cre等)的选用,小鼠背景和年龄
阅读提示:Materials and methods - Mice; Results - 第1段
免疫球蛋白检测
血清采集时间点、ELISA试剂盒(Clonotyping System-HRP)、NP特异性ELISA的包被抗原(NP(7)-BSA/NP(20)-BSA)
阅读提示:Materials and methods - ELISA; Results - 图1C-E
免疫应答实验
抗原类型(NP-KLH、NP-Ficoll、NP-dextran)、剂量(100 μg)、佐剂(alum)、给药途径(腹腔注射)、加强免疫时间、血清收集时间点
阅读提示:Materials and methods - Immunization; Results - 第3节
B细胞增殖实验
FO和MZ B细胞分选方法、刺激物(抗IgM、LPS)浓度(10 μg/ml)、刺激时间(72小时)、CTV标记
阅读提示:Materials and methods - B-cell culture, activation, and proliferation; Results - 第4节
机制研究
RNA-seq分析方法(DESeq2阈值)、Il5ra启动子甲基化检测区域和位点、CH12F3细胞Zbtb24敲除方法、Il5ra过表达/敲低方法、CD19磷酸化检测条件
阅读提示:Materials and methods - RNA-seq, bisulfite sequencing, CH12F3 experiments; Results - 第6节