小鼠模型建立与基因型验证
构建Zbtb24条件敲除小鼠并验证敲除效率。
通过同源重组生成Zbtb24条件敲除等位基因,与Vav-Cre等Cre转基因小鼠交配建立造血系和B细胞特异性敲除小鼠,使用PCR和Western blot验证B220+ B细胞和CD3+ T细胞中的Zbtb24缺失。
Enhanced CD19 activity in B cells contributes to immunodeficiency in mice deficient in the ICF syndrome gene Zbtb24
包含条件性基因敲除小鼠模型(体内)、细胞系(CH12F3)基因编辑(体外)、RNA-seq、流式细胞术、ELISA、蛋白印迹、亚硫酸盐测序等多层级验证,具备功能与机制验证。
Vav-Cre介导的造血系Zbtb24条件敲除小鼠(VAV-CKO) CD19-Cre介导的B细胞Zbtb24条件敲除小鼠(CD19-CKO) Zbtb24敲除的CH12F3小鼠B细胞淋巴瘤细胞系 小鼠原代边缘区(MZ)和滤泡(FO)B细胞
Vav-Cre介导的Zbtb24条件敲除小鼠(VAV-CKO) CD19-Cre介导的B细胞Zbtb24条件敲除小鼠(CD19-CKO) Zbtb24敲除的CH12F3小鼠B细胞淋巴瘤细胞系 小鼠原代边缘区(MZ)和滤泡(FO)B细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
构建Zbtb24条件敲除小鼠并验证敲除效率。
通过同源重组生成Zbtb24条件敲除等位基因,与Vav-Cre等Cre转基因小鼠交配建立造血系和B细胞特异性敲除小鼠,使用PCR和Western blot验证B220+ B细胞和CD3+ T细胞中的Zbtb24缺失。
评估Zbtb24缺陷对淋巴细胞发育和血清免疫球蛋白水平的影响。
通过ELISA检测不同年龄小鼠血清中IgG1、IgM、IgA等水平,通过流式细胞术分析骨髓和脾脏中B细胞和T细胞亚群以及浆细胞比例和数量。
评估Zbtb24缺陷小鼠对T依赖和T非依赖抗原的体液免疫应答。
用NP-KLH(TD抗原)、NP-LPS(TI-1)和NP-Ficoll/NP-dextran(TI-2)免疫小鼠,收集血清并检测NP特异性抗体,同时分析脾脏生发中心B细胞。
验证Zbtb24缺陷对B细胞活化增殖的影响。
分选FO和MZ B细胞,用CTV标记后分别用抗IgM或LPS刺激72小时,流式细胞术检测增殖;另用抗IgM或IL-5刺激后收集细胞进行Western blot检测信号分子磷酸化。
鉴定Zbtb24调控的下游分子及表观遗传机制。
对分选的FO和MZ B细胞进行RNA-seq,筛选差异表达基因;通过RT-qPCR验证候选基因;通过亚硫酸盐测序分析Il5ra启动子CpG甲基化状态;在CH12F3细胞中通过过表达/敲低验证Il5ra功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | CellTrace Violet细胞增殖试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 流式细胞术 | 抗小鼠IgM(F(ab')2片段) | Jackson ImmunoResearch | -- |
| 免疫荧光 | Tissue-Tek O.C.T.包埋剂 | ProSciTech | -- |
| 花生凝集素-FITC | Sigma‒Aldrich | -- | |
| Triton X-100 | Sigma‒Aldrich | -- | |
| 含DAPI封片剂 | Life Technologies | -- | |
| 细胞分选 | 小鼠MZ和FO B细胞分选试剂盒 | Miltenyi | -- |
| LS柱 | Miltenyi | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA-seq | Illumina HiSeq 3000 | Illumina | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| ProtoScript第一链cDNA合成试剂盒 | New England Biolabs | -- | |
| iTaq Universal SYBR Green PCR预混液 | Bio-Rad | -- | |
| ABI 7900实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗Zbtb24抗体 | MBL | PM085 | |
| 抗CD19抗体 | Cell Signaling Technology | 3574 | |
| 抗磷酸化CD19 (Tyr531)抗体 | Cell Signaling Technology | 3571 | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗磷酸化PLCγ抗体 | Cell Signaling Technology | 50535 | |
| 抗磷酸化CD79a抗体 | Cell Signaling Technology | 5173 | |
| 抗β-actin抗体 | Sigma‒Aldrich | A5441 | |
| 抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| ELISA | Clonotyping System-HRP | Southern Biotech | -- |
| 小鼠免疫球蛋白亚型标准品 | Southern Biotech | -- | |
| 血清细胞因子检测 | BD CBA小鼠/大鼠可溶性蛋白制备缓冲液试剂盒 | BD Biosciences | 558266 |
| BD CBA小鼠IL-5 Flex Set | BD Biosciences | 558302 | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| FACSFusion流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 免疫荧光 | Zeiss LSM880共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 细胞培养 | CH12F3细胞系 | -- | -- |
| 293T细胞 | -- | -- | |
| 基因编辑 | pMD2.G载体 | Addgene | 12259 |
| psPAX2载体 | Addgene | 12260 | |
| pCDH-EF1-FHC载体 | Addgene | 64874 | |
| pLKO.1 puro载体 | Addgene | 8453 | |
| pL-CRISPR.EFS.GFP载体 | Addgene | 57818 | |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| 免疫 | 明矾 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| NP(7)-BSA、NP(20)-BSA | Biosearch Technologies | -- | |
| 细胞培养 | 重组小鼠IL-5 | R&D Systems | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | Zbtb242lox等位基因的构建和验证,Cre品系(Vav-Cre、CD19-Cre、Lck-Cre等)的选用,小鼠背景和年龄 阅读提示:Materials and methods - Mice; Results - 第1段 |
| 免疫球蛋白检测 | 血清采集时间点、ELISA试剂盒(Clonotyping System-HRP)、NP特异性ELISA的包被抗原(NP(7)-BSA/NP(20)-BSA) 阅读提示:Materials and methods - ELISA; Results - 图1C-E |
| 免疫应答实验 | 抗原类型(NP-KLH、NP-Ficoll、NP-dextran)、剂量(100 μg)、佐剂(alum)、给药途径(腹腔注射)、加强免疫时间、血清收集时间点 阅读提示:Materials and methods - Immunization; Results - 第3节 |
| B细胞增殖实验 | FO和MZ B细胞分选方法、刺激物(抗IgM、LPS)浓度(10 μg/ml)、刺激时间(72小时)、CTV标记 阅读提示:Materials and methods - B-cell culture, activation, and proliferation; Results - 第4节 |
| 机制研究 | RNA-seq分析方法(DESeq2阈值)、Il5ra启动子甲基化检测区域和位点、CH12F3细胞Zbtb24敲除方法、Il5ra过表达/敲低方法、CD19磷酸化检测条件 阅读提示:Materials and methods - RNA-seq, bisulfite sequencing, CH12F3 experiments; Results - 第6节 |