验证HIF-1β表达及与HIF-2α的相互作用
确认缺氧条件下HIF-1β在滋养层细胞中的表达变化及与HIF-2α的相互作用。
将BeWo、JAR和JEG-3细胞在缺氧条件下培养24小时,通过qRT-PCR和Western blot检测HIF-1β表达,通过免疫共沉淀检测HIF-1β与HIF-2α的相互作用。
Hypoxia-inducible factor-1β is essential for upregulation of the hypoxia-induced FLT1 gene in placental trophoblasts
包含细胞系模型、原代滋养层细胞以及多种功能验证(siRNA敲低、抑制剂)和机制验证(免疫共沉淀、报告基因、亚硫酸氢盐测序),证据层级独立。
BeWo、JAR、JEG-3滋养层细胞系 人原代滋养层细胞 化学模拟缺氧模型(DMOG处理)
缺氧条件:2% O2, 5% CO2和93% N2,24小时 siRNA敲低效率大于70% DMOG处理浓度100 μM 去甲基化处理5azadC浓度10 μM,处理72小时 HIF-2α抑制剂TC-S7009浓度30 μM
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认缺氧条件下HIF-1β在滋养层细胞中的表达变化及与HIF-2α的相互作用。
将BeWo、JAR和JEG-3细胞在缺氧条件下培养24小时,通过qRT-PCR和Western blot检测HIF-1β表达,通过免疫共沉淀检测HIF-1β与HIF-2α的相互作用。
评估HIF-1β对缺氧诱导的FLT1基因表达和sFLT1分泌的必要性。
将BeWo细胞和原代滋养层细胞转染HIF-1β siRNA,然后暴露于缺氧或常氧条件,检测FLT1 mRNA和sFLT1蛋白水平。
确认化学模拟缺氧条件下HIF-1β和HIF-2α对FLT1基因上调的作用。
用DMOG处理BeWo细胞,检测FLT1 mRNA表达,并使用siRNA和HIF-2α抑制剂TC-S7009验证HIF的参与。
探讨在去甲基化增强FLT1表达的基础上,HIF-2α/HIF-1β复合物是否参与进一步上调。
用5azadC处理BeWo细胞以诱导去甲基化,同时转染siRNA,然后暴露于缺氧或DMOG,检测FLT1 mRNA表达。
验证FLT1启动子中的已知缺氧反应元件(-966至-962)是否介导缺氧或DMOG诱导的转录上调。
使用包含FLT1启动子区域的荧光素酶报告质粒pFLT1-Luc转染BeWo细胞,检测缺氧或DMOG处理后的荧光素酶活性;使用亚硫酸氢盐测序评估该区域CpG甲基化状态。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12培养基 | Nacalai Tesque, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 缺氧处理 | 多气体培养箱(WAKEN 9000EX) | WAKEN B TECH Co., Ltd | -- |
| 药物处理 | 二甲基草酰甘氨酸 | Enzo Life Sciences | -- |
| 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- | |
| DNA去甲基化 | 5'-氮杂-2'-脱氧胞苷 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | I型胶原包被的12孔培养板 | Sumitomo Bakelite Co., Ltd | -- |
| Western blotting | 抗HIF-1α抗体 | Cell Signaling Technology | 3716 |
| 抗HIF-2α抗体 | Novus Biologicals | NB100-122 | |
| 抗HIF-1β抗体 | Novus Biologicals | NB100-110 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4967 | |
| 抗TATA结合蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-421 | |
| 抗人FLT1 N端区域抗体 | -- | -- | |
| 免疫沉淀 | Dynabeads Protein G | Invitrogen | -- |
| 正常兔IgG | Cell Signaling Technology | 2729 | |
| sFLT1浓缩 | 肝素Sepharose 6 Fast Flow | GE Healthcare | -- |
| 免疫荧光染色 | 抗HIF-1β单克隆抗体 | Novus Biologicals | NB100-124 |
| Alexa Fluor 488偶联二抗 | Invitrogen | A-11029 | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Wako Pure Chemicals | -- | |
| 荧光显微镜(Biozero BZ-8000) | Keyence | -- | |
| siRNA转染 | Silencer Select阴性对照siRNA No.1 | Ambion | 4390843 |
| 靶向HIF-1α的siRNA (s6541) | Ambion | s6541 | |
| 靶向HIF-2α的siRNA (s4699) | Ambion | s4699 | |
| 靶向HIF-1β的siRNA #1 (s1613) | Ambion | s1613 | |
| 靶向HIF-1β的siRNA #2 (s1614) | Ambion | s1614 | |
| Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | TC-S7009 | Tocris Biosciences | -- |
| 细胞活力测定 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| 荧光素酶报告基因分析 | pGL4.10载体 | Promega | -- |
| pGL4.74 (hRuc/TK)载体 | Promega | -- | |
| Viafect转染试剂 | Promega | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| 发光检测仪(Gene Light 210A) | Microtech Nichion | -- | |
| 亚硫酸氢盐测序 | EpiTaq HS | Takara Bio | -- |
| pGEM-T easy载体 | Promega | -- | |
| 统计分析 | Excel 2011 | Microsoft | -- |
| Statcel4 | OMS | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | BeWo、JAR、JEG-3细胞系来源(JCRB/ATCC),培养基Ham's F-12含10% FBS、100 U/ml青霉素和100 μg/ml链霉素,培养条件37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and methods: Trophoblast-derived choriocarcinoma cell lines and cell culture |
| 缺氧处理 | 缺氧条件:2% O2, 5% CO2和93% N2,24小时;细胞接种密度4.35 × 10^4 cells/cm^2 阅读提示:Materials and methods: Trophoblast-derived choriocarcinoma cell lines and cell culture |
| siRNA转染 | siRNA浓度10 nM;BeWo细胞转染72小时,原代滋养层细胞转染48小时;敲低效率需>70% 阅读提示:Materials and methods: Transfection with siRNA |
| 药物处理 | DMOG浓度100 μM;TC-S7009浓度30 μM;5azadC浓度10 μM,处理72小时(用于去甲基化实验) 阅读提示:Materials and methods: Drug treatments; Treatment with the HIF-2α-specific inhibitor TC-S7009; DNA demethylation |
| 原代滋养层细胞 | 正常足月胎盘分离细胞滋养层,伦理委员会批准,分离及培养条件参照参考文献 阅读提示:Materials and methods: Isolation and culture of human primary trophoblasts |