抗体分离与筛选
从慢性丙肝患者中分离出特异性结合E2并具有广谱中和活性的单克隆抗体
从患者外周血中分选E2特异性记忆B细胞,单细胞RT-PCR扩增抗体基因,构建重组抗体,筛选结合和中和活性最佳的抗体8D6
Junctional and somatic hypermutation-induced CX4C motif is critical for the recognition of a highly conserved epitope on HCV E2 by a human broadly neutralizing antibody
包含体外结合、中和实验、表位作图和功能验证、突变分析、胚系抗体重建以及体内病毒实验等多个独立证据层级。
Huh7.5.1细胞 HCVcc病毒株 HEK293T细胞 患者来源的B细胞
CX4C基序中的C104和C109突变对8D6中和活性和结合的影响 N448糖基化位点对8D6识别E2的作用 8D6 iGL对PR79L9株的特异性中和
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从慢性丙肝患者中分离出特异性结合E2并具有广谱中和活性的单克隆抗体
从患者外周血中分选E2特异性记忆B细胞,单细胞RT-PCR扩增抗体基因,构建重组抗体,筛选结合和中和活性最佳的抗体8D6
评估8D6与不同基因型E2的结合能力及对多种HCVcc的中和效力
ELISA检测8D6与来自基因型1-6的可溶性E2的结合,中和实验检测对12种HCVcc及临床分离株的中和活性
探究8D6抑制HCV进入的机制,特别是对E2-CD81相互作用的阻断
通过时间依赖性中和实验确定8D6作用于病毒附着阶段,ELISA检测8D6对E2-CD81结合的阻断
定位8D6在E2上的结合表位,并比较与其他bNAbs的表位差异
竞争ELISA、丙氨酸扫描诱变、HVR缺失突变体结合分析、糖基化突变体分析、HADDOCK对接
分析8D6的胚系基因和体细胞突变,确定关键突变对功能的影响
序列分析确定VH7-4-1*02和VL1-39*01基因,构建胚系回复突变体,定点突变分析CDRH3中的CX4C基序
评估8D6 iGL的结合和中和活性,筛选对iGL敏感的病毒株作为潜在疫苗株
重组表达8D6 iGL抗体,检测其对HCVcc的中和活性及与可溶性E2的结合,发现PR79L9株敏感
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 抗体表达 | ExpiCHO-S细胞 | Invitrogen | -- |
| ExpiCHO表达培养基 | Invitrogen | -- | |
| PBMC分离 | Lympholyte-H密度梯度分离液 | GE | -- |
| 重组蛋白纯化 | His Trap Excel柱 | GE | -- |
| 蛋白标记 | EZ-Link Sulfo-NHS-LC-生物素 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 突变体构建 | KOD-Plus诱变试剂盒 | TOYOBO | -- |
| 中和实验 | GenePulser电穿孔系统 | Bio-Rad | -- |
| 免疫荧光 | Olympus IX53共聚焦显微镜 | Olympus | -- |
| 动力学分析 | Octet Red仪器 | ForteBio | -- |
| ELISA | HRP偶联抗6xHis单抗 | Pierce | -- |
| HRP偶联山羊抗人Fc抗体 | Sigma | -- | |
| HRP偶联山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | -- | |
| 免疫印迹 | HRP偶联抗His标签单抗 | Proteintech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗体分离 | 患者样本来源、单B细胞分选门控策略、扩增引物 阅读提示:Materials and methods: Isolation of monoclonal antibodies |
| 结合和中和实验 | E2蛋白浓度、抗体浓度梯度、病毒株种类、细胞接种密度、孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Neutralization assay, ELISA |
| 表位作图 | 丙氨酸突变体列表、参考抗体浓度、竞争实验条件 阅读提示:Materials and methods: HCV E2 truncation and site-directed mutagenesis |
| 突变体功能验证 | 突变体种类(C104A、C109A等)、中和实验浓度范围 阅读提示:Figure 4 and Supplementary Figure 11 |
| iGL重建和筛选 | 胚系序列来源、重组抗体表达系统、中和病毒panel 阅读提示:Materials and methods: Germline antibody design and antibody engineering |