组织表达谱分析
确定TRIML1和TRIML2在猪各组织及发育阶段的表达特异性。
收集猪各组织(脑、肌肉、胃等)及卵母细胞、胚胎(2细胞至囊胚)、胚胎(12、15天)和胎盘组织(21、30天),提取RNA,进行终点PCR检测TRIML1和TRIML2表达。
Expression of tripartite motif family-like protein 1 and 2 in early conceptus development and placentation in the pig
包含组织表达谱分析(PCR和原位杂交)及CRISPR/Cas9敲除后的体细胞核移植胚胎移植实验,涵盖体内妊娠维持和形态学评估。
猪胎儿成纤维细胞(TRIML1−/−和TRIML2−/−) 猪早期胚胎(体外受精和体细胞核移植) 猪妊娠模型(胚胎移植后的代孕母猪)
TRIML1和TRIML2的组织特异性表达模式(PCR和原位杂交) CRISPR/Cas9介导的TRIML1和TRIML2敲除效率及纯合性(DNA和mRNA水平) SCNT胚胎的体外发育能力和移植后的妊娠率 妊娠和胎盘发育的形态学和组织学评估(天数15-36)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TRIML1和TRIML2在猪各组织及发育阶段的表达特异性。
收集猪各组织(脑、肌肉、胃等)及卵母细胞、胚胎(2细胞至囊胚)、胚胎(12、15天)和胎盘组织(21、30天),提取RNA,进行终点PCR检测TRIML1和TRIML2表达。
验证TRIML1和TRIML2在睾丸和胎盘中的细胞特异性表达。
使用RNAscope原位杂交检测TRIML1(睾丸)和TRIML2(睾丸、胚胎、胎盘)的mRNA;免疫组化检测睾丸中TRIML1蛋白。
产生TRIML1和TRIML2敲除的猪胎儿成纤维细胞系,用于后续SCNT。
设计靶向TRIML1外显子1起始密码子和TRIML2外显子2-3的gRNA,克隆至pX330-mCherry载体,电转猪胎儿成纤维细胞,经克隆筛选和测序验证敲除。
验证TRIML1或TRIML2敲除对胚胎发育和妊娠建立的影响。
将TRIML1−/−或TRIML2−/−成纤维细胞作为供体进行SCNT,胚胎体外培养至桑葚胚或囊胚,移植入代孕母猪,收集不同妊娠天数的胚胎和胎盘进行形态学和组织学评估。
评估基因敲除对胚胎和胎盘发育的影响。
对妊娠21-22和34-36天的胎儿和胎盘进行宏观形态学观察(大小、血管化、羊水)和组织学染色(H&E)评估母胎界面。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | RNeasy Mini Kit | Qiagen | 74104 |
| PicoPure RNA提取试剂盒 | Applied Biosystems | 12204-01 | |
| 无RNase DNase试剂盒 | Qiagen | 79254 | |
| RNA质量检测 | NanoDrop ND-1000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| cDNA合成 | iScript cDNA合成试剂盒 | BioRad | 1708891 |
| PCR | OneTaq热启动DNA聚合酶 | New England BioLabs | M0481S |
| LA Taq DNA聚合酶 | Takara | -- | |
| 原位杂交 | RNAscope多重荧光试剂盒v2 | ACDbio | -- |
| RNAscope DapB探针 | ACDbio | -- | |
| TSA vivid荧光染料 | ACDbio | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| VectaMount封片剂 | VectorLabs | -- | |
| 免疫组化 | Reveal Decloaker抗原修复液 | Biocare Medical | RV1000M |
| 兔抗TRIML1抗体 | Cusabio | CSB-PA822741LA01HU | |
| Vectastain Elite ABC试剂盒 | VectorLabs | -- | |
| DAB底物 | VectorLabs | -- | |
| 基因编辑 | pX330-mCherry载体 | Addgene | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| GlutaMax添加剂 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 成纤维细胞生长因子 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 庆大霉素 | Gibco | -- | |
| SNCT | BTX电融合仪 | Harvard Apparatus | -- |
| 菲咯啉 | -- | -- | |
| scriptaid | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 组织表达分析 | RNA提取方法、cDNA合成条件(RNA量、反转录温度和时间)、PCR循环数(TRIML1 33循环、TRIML2 32循环) 阅读提示:Materials and methods中的Total RNA isolation和cDNA synthesis and PCR analysis部分 |
| 原位杂交 | 探针序列和稀释度、组织固定和预处理条件(烤片时间、温度、靶标修复时间) 阅读提示:Materials and methods中的TRIML1 and TRIML2in situ hybridization assays部分 |
| 基因编辑 | gRNA序列、电转参数(电压、脉冲数、质粒量)、筛选克隆的PCR和测序条件 阅读提示:Materials and methods中的CRISPR/Cas9 guides design and transfection和Clonal expansion and colony screening部分 |
| 体细胞核移植 | 卵母细胞来源、成熟条件、融合参数(电压、持续时间)、激活方法(phenanthroline处理时间和浓度)、胚胎培养条件(MU4培养基,培养时间) 阅读提示:Materials and methods中的Somatic cell nuclear transfer部分 |
| 胚胎移植 | 受体母猪的品种、年龄、体重、发情同步处理、移植胚胎数量和移植位置 阅读提示:Materials and methods中的Animals和Embryo transfer部分 |
| 妊娠分析 | 收集妊娠天数、样本处理(固定、切片、染色)、形态学和组织学评估标准 阅读提示:Materials and methods中的Embryo collection和Tissue fixation and paraffin-embedding部分,以及Results中的相关描述 |