牙源性成釉细胞瘤BRAFV600E突变检测方法的比较研究

背景：成釉细胞瘤是一种生长侵袭性强、复发率高的牙源性颌骨肿瘤。其与BRAFV600E突变的关联是进行BRAFV600E抑制剂治疗的指征。本研究旨在寻找一种敏感且低成本的检测方法用于BRAFV600E阳性成釉细胞瘤。我们假设，在实验室资源不足以进行分子检测时，对福尔马林固定石蜡包埋组织进行BRAFV600E突变的免疫组织化学染色可作为BRAFV600E基因测序的低成本替代方案。方法：从40例成釉细胞瘤样本中获取组织，样本来源包括福尔马林固定石蜡包埋块、RNAlater™保存液或意外在转移至RNAlater™前预先用福尔马林固定的样本。通过直接Sanger测序、扩增阻滞突变系统PCR和免疫组织化学检测BRAFV600E突变。结果：免疫组织化学、扩增阻滞突变系统PCR和直接Sanger测序分别检测到93.33%、52.5%和30%的样本存在BRAFV600E突变。以直接Sanger测序为标准BRAFV600E检测方法，三种检测方法间存在显著差异（𝜒2(2)=31.34，p<0.0001）。免疫组织化学的敏感性和特异性分别为0.8（95%CI：0.64-0.90）和0.9（95%CI：0.75-0.99），阳性预测值和阴性预测值分别为0.9和0.8（Fisher检验，p<0.0001）。扩增阻滞突变系统PCR检测方法的敏感性和特异性分别为0.7（95%CI：0.53-0.80）和0.9（95%CI：0.67-0.98），阳性预测值和阴性预测值分别为0.9和0.6（Fisher检验，p<0.0001）。结论：免疫组织化学的低成本及对组织质量要求较低的特点，使其成为成釉细胞瘤中BRAFV600E检测的可行替代方案。对BRAFV600E进行连续双重免疫组织化学和分子检测将减少不确定结果，避免部分患者被排除在BRAFV600E抑制剂治疗之外。