成釉细胞瘤中BRAFV600E突变检测方法的比较

引言：成釉细胞瘤是一种侵袭性生长、高复发的牙源性颌骨肿瘤。其与BRAFV600E突变的相关性是BRAFV600E抑制剂治疗的指征。本研究旨在确定一种敏感且低成本的检测BRAFV600E阳性成釉细胞瘤的检测方法。我们假设，在实验室资源不足以进行分子检测时，福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织的BRAFV600E突变免疫组织化学染色（IHC）是BRAFV600E基因测序的低成本替代方法。方法：从40例成釉细胞瘤样本中获取组织，这些样本来自FFPE块、RNAlater™稳定液（RSS）或意外在转移至RNAlater™前用福尔马林预固定的样本（FFRSS）。通过直接Sanger测序（DSS）、扩增阻滞突变系统（ARMS）-PCR和IHC评估BRAFV600E突变。结果：IHC、ARMS-PCR和DSS分别检测到93.33%、52.5%和30%的样本存在BRAFV600E突变。以DSS作为标准BRAFV600E检测方法，三种检测方法之间存在显著差异（χ2(2)=31.34，p<0.0001）。IHC的敏感性和特异性分别为0.8（95% CI: 0.64–0.90）和0.9（95% CI: 0.75–0.99），阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV）分别为0.9和0.8（Fisher检验，p<0.0001）。ARMS-PCR检测方法的敏感性和特异性分别为0.7（95% CI: 0.53–0.80）和0.9（95% CI=0.67–0.98），PPV和NPV分别为0.9和0.6（Fisher检验，p<0.0001）。结论：低成本且受组织质量影响较小的IHC使其成为检测成釉细胞瘤BRAFV600E的可行替代检测方法。序贯联合使用IHC和分子检测进行BRAFV600E检测将减少可能将一些患者排除在BRAFV600E抑制剂治疗之外的模棱两可的结果。