临床样本收集与表型分析
识别具有TFF表型的不育男性及其家庭
招募五名经历TFF的男性患者及其家庭成员,收集精液参数和辅助生殖结局。
Novel PLCZ1 compound heterozygous mutations indicate gene dosage effect involved in total fertilisation failure after ICSI
至少两个独立证据层级:患者样本(临床数据、精子形态、定位)与功能验证(HEK293T细胞表达、小鼠卵母细胞Ca2+振荡),并包含机制验证(分子动力学模拟、共分离分析)。
HEK293T细胞转染模型 小鼠MII卵母细胞cRNA注射模型 患者精子样本 患者家庭系谱与临床队列
患者类型:正常精子症男性,TFF后ICSI 突变类型:PLCZ1复合杂合突变(如M138V、R391*) 功能分析剂量:cRNA 600 ng/μL 显微注射 检测指标:Ca2+振荡频率和强度(3小时内)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
识别具有TFF表型的不育男性及其家庭
招募五名经历TFF的男性患者及其家庭成员,收集精液参数和辅助生殖结局。
确定PLCZ1基因中的致病变异
对患者外周血DNA进行全外显子组测序,并通过Sanger测序验证候选变异。
评估突变对PLCZ1转录和蛋白质表达的影响
将野生型和突变体PLCZ1质粒转染HEK293T细胞,通过western blotting和RT-qPCR检测表达水平。
预测突变对PLCZ蛋白质构象的影响
使用AlphaFold预测野生型PLCZ结构,使用GROMACS模拟分子动力学50 ns,分析RMSD和RMSF。
验证突变对PLCZ诱导Ca2+振荡能力的影响
将野生型或突变型PLCZ1 cRNA(600 ng/μL)显微注射至小鼠MII卵母细胞,用Fluo-3 AM监测Ca2+振荡3小时。
评估患者精子中PLCZ的表达和定位
对病例5患者精子进行Papanicolaou染色、TEM、western blotting和免疫荧光分析,观察PLCZ表达水平和亚细胞定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因突变鉴定 | DNeasy血液和组织试剂盒 | Qiagen | 69504 |
| SureSelectXT人类全外显子组试剂盒 | Agilent | 5190-8864 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 11965092 |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F8318 | |
| 细胞转染 | jetPEI转染试剂盒 | Poly-Plus Transfection | -- |
| 免疫荧光 | PLCZ抗体 | Abcam | ab181816 |
| Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A21206 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013C |
| Halt™蛋白酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 78425 | |
| 抗Flag抗体 | Invitrogen | PA5-98556 | |
| ECL化学底物 | Millipore | WBKLS0100 | |
| cRNA合成 | 通用DNA纯化试剂盒 | TIANGEN | DP214-03 |
| T7高效RNA转录试剂盒 | Novoprotein | E131 | |
| RNA清洁浓缩器-5 | Zymo Research | R1015 | |
| Ca2+监测 | Fluo-3 AM | Beyotime | S1056 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 基因突变鉴定 | 患者和家庭成员的临床样本、DNA提取、全外显子组测序平台和数据分析流程 阅读提示:Materials and methods中Whole exome sequencing and Sanger sequencing部分 |
| 体外表达分析 | 细胞系(HEK293T)、转染试剂和方法、质粒构建、培养条件 阅读提示:Materials and methods中Plasmid construction and cell culture部分 |
| 钙振荡功能验证 | 小鼠品系和年龄、超排卵方案、卵母细胞采集时间、cRNA注射剂量和浓度、Ca2+监测时长和参数 阅读提示:Materials and methods中Ca2+ monitoring部分 |
| 精子表型分析 | 患者精液样本处理方法、固定和染色条件、抗体稀释比例、显微镜型号和设置 阅读提示:Materials and methods中Papanicolaou staining、Immunofluorescence staining和Western blotting analysis部分 |
| 结构模拟 | AlphaFold模型、分子动力学模拟软件和参数、分析指标 阅读提示:Materials and methods中Bioinformatic analysis and molecular modelling部分 |