细胞学涂片中提取的DNA是PCR分子检测的宝贵来源

DNA Extracted from Cytologic Slides Is a Valuable Source for PCR-Based Molecular Tests

作者信息Hyo Sum Kwon, Dong Hoon Shin, So Young Kim, Chung Su Hwang, Arhong Kim, Hyun Jung Lee, JooYoung Na, Jung Hee Lee, Jee Yeon Kim
PMID36455541
发布时间2023
DOI10.1159/000526634

摘要

引言:从细胞学样本中提取的DNA偶尔被用于各种分子检测。本研究旨在评估从不同制备方法的细胞学玻片中提取的DNA,这些DNA可用于基于PCR的分子检测。方法:针对23例甲状腺乳头状癌或结直肠腺癌组织,每组制备了六张接触印迹细胞学玻片(第1∼3组),剩余组织则制成福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织块(第4组)。细胞学玻片根据制备方法分组:空气干燥玻片(第1组)、固定玻片(第2组)和染色玻片(第3组)。固定玻片进一步分为95%乙醇固定(第2A组)和CytoRich Red Preservative溶液固定(第2B组)。染色玻片分为三种方式:吉姆萨染色、巴氏染色和H&E染色(分别为第3A、3B和3C组)。对从每组提取的DNA进行了浓度、260/280比值、DNA完整性数值(DIN)和突变检测的评估。结果:DNA浓度在第1组最高,在第2B组最低。DIN值在第2A组最高,在第2B组最低。在18个FFPE组织样本中检测到BRAF或KRAS基因的突变。从第1组、第2A组和第3组提取的DNA与FFPE组织的结果一致,而第2B组的DNA样本中仅有四个成功进行了突变检测。结论:除CytoRich Red Preservative固定的玻片外,大多数样本的突变检测效果良好。本研究表明,染色和未染色的细胞学玻片是适合进行基于PCR的分子检测的来源,只要它们用乙醇固定或在空气干燥条件下短时间储存。

实验方法

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