建立肺I/R和H/R模型
模拟肺缺血再灌注损伤,用于研究FLRT3的表达变化及功能。
小鼠左肺缺血60分钟再灌注120分钟;HPMECs缺氧12小时复氧4小时。
FLRT3 Overexpression Attenuates Ischemia-Reperfusion Induced Vascular Hyperpermeability and Lung Injury Through RND3
包含小鼠体内模型、HPMECs体外模型、分子机制研究(Co-IP、GST pulldown、RhoA活性检测)、功能验证(迁移、屏障功能)及RND3敲低回补实验。
小鼠肺I/R模型 人肺微血管内皮细胞(HPMECs)H/R模型
小鼠:C57BL/6J雄性,6-8周龄,体重20-26g,左肺缺血60分钟,再灌注120分钟 慢病毒注射:尾静脉注射1×10^9 TU/ml,100μl,I/R术前3天 HPMECs H/R处理:12小时缺氧(1% O2),4小时复氧 RND3敲低:使用RND3 shRNA克隆到GV493载体 RhoA通路激活剂:U-46619处理浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟肺缺血再灌注损伤,用于研究FLRT3的表达变化及功能。
小鼠左肺缺血60分钟再灌注120分钟;HPMECs缺氧12小时复氧4小时。
观察I/R损伤后FLRT3的表达水平和细胞定位变化。
通过Western blot检测FLRT3蛋白水平,免疫荧光检测FLRT3与CD31共定位。
验证LV-FLRT3预处理是否减轻I/R诱导的组织损伤、血管通透性和功能障碍。
尾静脉注射LV-FLRT3后建立I/R模型,通过H&E、cleaved caspase-3免疫组化、血气分析、湿干比、伊文思蓝外渗、TEM评估。
在体外H/R模型中验证FLRT3对细胞活力、迁移和屏障功能的保护作用。
慢病毒转导HPMECs过表达或敲低FLRT3,进行H/R处理,检测细胞活力、迁移(划痕和Transwell)及屏障功能(TEER、伊文思蓝)。
确定H/R条件下FLRT3下调是通过翻译后降解,并明确降解途径。
使用放线菌酮追踪蛋白稳定性,MG132、NH4Cl、CQ、Baf-A1处理抑制特定降解途径。
寻找FLRT3的下游效应分子,预测并验证FLRT3与RND3的相互作用。
通过数据库预测、Co-IP、GST pulldown、免疫荧光共定位验证FLRT3与RND3结合。
证实FLRT3过表达的保护作用依赖于RND3,并通过抑制RhoA通路实现。
在HPMECs中敲低RND3或使用RhoA激动剂U-46619,检测迁移、屏障功能、细胞骨架、连接蛋白及RhoA通路蛋白表达。
在动物模型中确认RND3是FLRT3发挥保护作用的关键下游分子。
小鼠注射LV-FLRT3和/或sh-RND3,建立I/R模型,检测肺损伤、通透性、连接蛋白和RhoA通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 试剂 | MG132 | Selleck | S2619 |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma-Aldrich | M9281 | |
| 氯化铵 | Sigma-Aldrich | A9434 | |
| 氯喹 | Sigma-Aldrich | C6628 | |
| U-46619 | Sigma-Aldrich | D8174 | |
| 慢病毒载体构建 | GV492载体 | GeneChem | -- |
| GV493载体 | GeneChem | -- | |
| 细胞转染 | Lipo3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 免疫组织化学 | 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 |
| DAB检测试剂盒 | ZSGB-Bio | -- | |
| 伊文思蓝染色 | 伊文思蓝染料 | Merck KGaA | E2129 |
| 透射电子显微镜 | 透射电子显微镜 | FEI | Tecnai-G220-TWIN |
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 内皮细胞生长因子 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞转导 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 体外通透性测定 | Transwell小室 | Costar | 3472 |
| TEER测量 | 电阻系统 | Merck Millipore | MERS00002 |
| 细胞活力 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| Transwell迁移实验 | Transwell板 | CoStar | 3464 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Roche Applied Science | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗FLRT3抗体 | Abcam | ab223047 | |
| 抗RND3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53874 | |
| 抗VE-钙黏蛋白抗体 | Abcam | ab205336 | |
| 抗ZO-1抗体 | Abcam | ab276131 | |
| 抗claudin-5抗体 | Abcam | ab131259 | |
| 抗occludin抗体 | Abcam | ab216327 | |
| 抗p-MYPT1抗体 | Abcam | ab59203 | |
| 抗MYPT1抗体 | Abcam | ab59235 | |
| 抗RhoA抗体 | Abcam | ab187027 | |
| 抗p-MCL1抗体 | Cell Signaling Technology | 4579 | |
| 抗MCL1抗体 | Cell Signaling Technology | 94296 | |
| 抗LC3I/II抗体 | Cell Signaling Technology | 4108 | |
| RhoA活性检测 | RhoA激活检测试剂盒 | Merck Millipore | -- |
| GST pulldown | His-FLRT3重组蛋白 | ProteinTech | -- |
| GST-RND3重组蛋白 | ProteinTech | -- | |
| 免疫共沉淀 | FLRT3抗体 | Cell Signaling Technology | 3462 |
| RND3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53874 | |
| 蛋白Dynabeads | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| F-actin染色 | FITC标记鬼笔环肽 | Molecular Probes | -- |
| FluorSave封片剂 | Calbiochem | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy微型试剂盒 | Qiagen | -- |
| Quantitect SYBR Green RT-PCR试剂盒 | Qiagen | -- | |
| ABI 7300实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 免疫荧光 | 抗原修复液 | Vector Laboratories | -- |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab76533 | |
| 靶标修复液 | Dako | -- | |
| FITC标记二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 含DAPI的Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | -- | version |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠肺I/R模型 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉方式;机械通气参数;缺血时间;再灌注时间;实验分组 阅读提示:Methods: Animal Model and Experimental Design |
| 慢病毒干预 | 病毒滴度、注射体积、注射途径、注射时间点 阅读提示:Methods: Animal Model and Experimental Design; Methods: Construction of Lentiviral Vectors |
| HPMECs培养和H/R处理 | 细胞来源;培养基成分;缺氧和复氧的时间及氧气浓度 阅读提示:Methods: Cell Culture |
| FLRT3过表达和敲低 | 慢病毒感染MOI、polybrene浓度、感染时间 阅读提示:Methods: Cell Transduction |
| 屏障功能检测 | TEER测量时间点;Evans blue-albumin浓度;Transwell孔径 阅读提示:Methods: Evans Blue-Albumin Monolayer Permeability Assay In Vitro; Methods: Trans-endothelial Electric Resistance (TEER) Measurements |
| 蛋白降解机制研究 | CHX、MG132、NH4Cl、CQ、Baf-A1的浓度和处理时间 阅读提示:Results: FLRT3 Protein Is Destabilized After H/R; Methods: Reagents |
| 体内RND3敲低实验 | sh-RND3病毒注射剂量和时间;RND3敲低效果验证 阅读提示:Methods: Animal Model and Experimental Design; Results: Knockdown RND3 Reduces FLRT3 Overexpression Related Protective Effects on I/R-Induced Lung Injury in Mice |