临床样本采集与处理
获取登革疫苗或挑战病毒感染后皮肤活检,评估病毒存在和炎症反应。
从I期临床试验参与者中,对出现或未出现皮疹者采集皮肤活检(3mm打孔),皮疹者取皮疹和非皮疹部位各一,非皮疹者取一例对照。共63例活检,经固定、包埋、切片。
Localized Inflammation in Dengue Vaccine-Induced Skin Rash Is Not Associated with Continuous Presence of Dengue Virus Genome
包含人类皮肤活检样本的RNA原位杂交、组织学评分、体外细胞感染验证及离体皮肤感染实验,但未进行动物模型或独立的功能验证。
K562-DC-SIGN细胞 人类皮肤活检(疫苗/挑战后皮疹与非皮疹部位) 离体人皮肤外植体
RNAScope探针特异性:针对DENV1-4和DENV2的NS2A及E基因区域设计并验证 皮肤活检样本RNA完整性:通过PPIB探针评估,43/63样本RNA完整 组织学炎症分级:基于血管周围淋巴单核细胞浸润密度建立0-3级评分系统 病毒学检测:通过病毒蚀斑实验检测血清病毒血症,FRNT50检测中和抗体
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取登革疫苗或挑战病毒感染后皮肤活检,评估病毒存在和炎症反应。
从I期临床试验参与者中,对出现或未出现皮疹者采集皮肤活检(3mm打孔),皮疹者取皮疹和非皮疹部位各一,非皮疹者取一例对照。共63例活检,经固定、包埋、切片。
检测皮肤活检中是否存在登革病毒基因组。
使用RNAScope技术,采用DENV1-4混合探针和DENV2特异性NS2A探针检测福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织,同时用PPIB探针评估RNA完整性,dapB作为阴性对照。
比较皮疹与非皮疹部位的组织学差异,确定炎症反应特征。
对全部63例活检进行H&E染色,按血管周围淋巴单核细胞浸润密度分为0-3级(0级无炎症,1-3级递增),由两名读片者盲法评分。
验证RNAScope探针的特异性和灵敏度。
用野生型登革病毒(DENV1-4)感染K562-DC-SIGN细胞,通过流式细胞术检测2H2抗体阳性,制备细胞蜡块进行RNAScope染色,确保探针特异性。
验证RNAscope在人类皮肤组织中检测DENV基因组的能力。
用含DENV1-4的四价疫苗混合物感染离体人皮肤外植体,通过RNAScope检测病毒基因组,活病毒感染阳性对照,热灭活病毒和培养基阴性对照。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA原位杂交 | RNAscope 2.5 LSx 试剂盒(红色) | Advanced Cell Diagnostics | 322750 |
| Leica Bond RXm 自动染色机 | Leica | -- | |
| VERSA 8 全玻片扫描仪 | Leica | -- | |
| 组织学 | VectaMount 封片剂 | Vector Labs | H-5000 |
| 细胞培养 | IMDM培养基 | Gibco | 12200-036 |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologicals | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 24孔组织培养板 | Corning | 3526 | |
| 流式细胞术 | 2H2小鼠抗DENV prM单克隆抗体 | -- | -- |
| AlexaFluor488标记试剂盒 | Invitrogen | A10235 | |
| 细胞蜡块制备 | 组织凝血活酶-DS | Pacific Hemostasis / ThermoFisher Scientific | 292274 |
| 临床采样 | 皮肤打孔活检笔 | -- | -- |
| 组织固定 | Michel溶液 | -- | -- |
| 原位杂交 | Superfrost-plus 载玻片 | ThermoFisher | 1255015 |
| 组织包埋 | OCT包埋剂 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 皮肤活检采集 | 活检部位(皮疹、非皮疹、对照)、时间点(相对于接种/感染日)、受试者分组(疫苗/挑战/安慰剂) 阅读提示:Study design and clinical procedures; Skin Biopsy Procedure; Figure 3 |
| RNA原位杂交检测 | 探针序列和特异性和靶基因区域、RNA完整性标准(PPIB阳性)、染色平台和试剂盒 阅读提示:Materials and Methods - RNAscope in situ hybridization; Table 2; Figure 2 |
| 组织学炎症评估 | 组织学分级标准(0-3级)、读片者盲法、样本数量(63例) 阅读提示:Results - 组织学分级描述; Figure 6 |
| 病毒血症和中和抗体检测 | 采样频率(隔天)、检测方法(FFU、FRNT50)、下限(3 FFU/mL) 阅读提示:Materials and Methods - Measurement of viremia and neutralizing antibody |
| 体外细胞感染 | 细胞系(K562-DC-SIGN)、MOI=1、感染时间(3天)、病毒株(DENV1/2/3/4) 阅读提示:Materials and Methods - Preparation of DENV-infected positive human cell controls; Figure 2 |