检测穿孔素在病变和引流淋巴结的组织特异性表达
验证穿孔素表达是否仅限于利什曼病感染的皮肤。
感染硕大利什曼原虫的小鼠,2周后通过流式细胞术分析引流淋巴结和病变中CD8 T细胞的穿孔素和颗粒酶B表达。
Hypoxia and IL-15 Cooperate to Induce Perforin Expression by CD8 T Cells and Promote Damage to the Skin in Murine Cutaneous Leishmaniasis
包含体外细胞培养、小鼠感染模型、流式细胞术、qPCR及单细胞RNA测序分析,并进行了功能验证(穿孔素抑制剂治疗)和机制验证(Blimp-1缺陷、IL-15/低氧协同)。
硕大利什曼原虫感染的小鼠模型(C57BL/6、Blimp-1cKO、RAG-/-重建CD8 T细胞) 巴西利什曼原虫感染的RAG-/-重建CD8 T细胞小鼠模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDM)
低氧条件(1% O2)和IL-15(50 ng/mL)处理对穿孔素表达的影响 Blimp-1缺陷(Blimp-1cKO)对低氧诱导穿孔素表达的影响 SN34960给药途径(腹腔注射100 mg/kg,局部外用0.05%凝胶)及方案 感染时间点及处理时长(感染后3周开始治疗,持续至5周)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证穿孔素表达是否仅限于利什曼病感染的皮肤。
感染硕大利什曼原虫的小鼠,2周后通过流式细胞术分析引流淋巴结和病变中CD8 T细胞的穿孔素和颗粒酶B表达。
确定穿孔素表达细胞是皮肤微环境诱导还是由淋巴结选择性招募。
感染后2天开始每日腹腔注射FTY720或对照,持续10天,分析引流淋巴结和病变中CD8 T细胞穿孔素表达。
评估低氧是否足以诱导CD8 T细胞表达颗粒酶B和穿孔素。
从感染小鼠的引流淋巴结制备单细胞悬液,用抗CD3和抗CD28刺激,在常氧(21% O2)或低氧(1% O2)下培养48小时后流式检测颗粒酶B和穿孔素表达。
确定低氧诱导穿孔素是否与颗粒酶B一样依赖转录因子Blimp-1。
使用Blimp-1cKO和WT小鼠感染硕大利什曼原虫,比较病变大小、寄生虫数量及CD8 T细胞中颗粒酶B和穿孔素表达;同时体外培养WT和Blimp-1cKO细胞在低氧下检测。
验证IL-15是否与低氧协同促进CD8 T细胞穿孔素表达。
引流淋巴结单细胞在常氧或低氧下刺激,并加入IL-15、IL-2或JAK1/3抑制剂tofacitinib,48小时后流式检测穿孔素。
确定病变中Il15的来源细胞,并探究低氧是否能诱导巨噬细胞Il15表达。
利用公开的单细胞RNA-seq数据分析病变皮肤中Il15表达细胞类型;培养BMDM,在常氧或低氧下孵育24小时,qPCR检测Il15 mRNA。
验证全身及局部应用穿孔素抑制剂SN34960能否减轻CD8 T细胞介导的皮肤病理。
使用RAG-/-小鼠感染巴西利什曼原虫并重建CD8 T细胞,3周后给予SN34960腹腔注射或局部凝胶治疗,测量耳厚度、寄生虫载量和中性粒细胞浸润。
评估穿孔素抑制在自愈模型中的疗效及对寄生虫控制的影响。
感染硕大利什曼原虫的C57BL/6小鼠,在病变出现后给予SN34960全身或局部治疗,测量病变大小和寄生虫载量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Thermo Fisher | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| ACK裂解液 | Gibco | -- | |
| 寄生虫培养 | Schneider昆虫培养基 | GIBCO | -- |
| 组织消化 | Liberase TL | Roche Diagnostics | -- |
| DNA酶I | Sigma | -- | |
| gentleMACS组织解离器(带加热器) | Miltenyi Biotec | -- | |
| 细胞分离 | 细胞过滤器 | BD Pharmingen | -- |
| CD8 T细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 细胞刺激 | 抗CD3抗体(克隆145-2C11) | Invitrogen | -- |
| 抗CD28抗体(克隆37.51) | Invitrogen | -- | |
| 白细胞介素-15 | Biolegend | 566304 | |
| 白细胞介素-2 | Hoffman La-Roche | Ro | |
| 托法替尼 | Selleckchem | CP-690550 | |
| 低氧培养 | 调模式培养箱室 | Billups-Rothenberg | -- |
| Baker Ruskin InvivO2 400低氧培养箱 | Baker Ruskin | -- | |
| 流式细胞术 | LIVE/DEAD可固定死细胞染色试剂盒(aqua) | Thermo Fisher | L34957 |
| LIVE/DEAD可固定死细胞染色试剂盒(blue) | Thermo Fisher | L23105 | |
| eBioscience可固定活力染料eFluor-780 | Thermo Fisher | 65-0865-14 | |
| 抗CD45抗体(克隆30-F11) | Invitrogen, BioLegend | 47-0451-82, | |
| 抗颗粒酶B抗体(克隆GB11) | Invitrogen | GRB05, | |
| 抗CD11b抗体(克隆M1/70) | Invitrogen | 48-0112-82 | |
| 抗CD3抗体(克隆17A2) | BD Biosciences | 741319 | |
| 抗CD44抗体(克隆IM7) | BD Biosciences | 751414 | |
| 抗CD8β抗体(克隆YTS156.7.7) | BioLegend | 126610, | |
| 抗Ly6G抗体(克隆1A8) | BioLegend | 127614 | |
| 抗穿孔素抗体(克隆S16009A) | BioLegend | 154304 | |
| BD FACSymphony A3流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| FACSCanto II流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Cytek Aurora 4激光流式细胞仪 | Cytek | -- | |
| qPCR | NucleoSpin RNA Mini试剂盒 | Macherey-Nagel | -- |
| iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | -- | |
| ABS Proflex热循环仪 | Thermo Fisher | -- | |
| C1000 RT-PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| iTaq Universal SYBR Green Supermix | Bio-Rad | -- | |
| 药物处理 | FTY720 | Cayman Chemical | -- |
| SN34960 | -- | -- | |
| β-环糊精 | -- | -- | |
| 羟丙基甲基纤维素 | -- | -- | |
| 2-(2-乙氧基乙氧基)乙醇 | Gattefosse | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 感染模型建立 | 寄生虫种类、剂量、感染途径、小鼠品系和年龄 阅读提示:Materials & Methods: Parasites, Mice;结果中描述感染细节 |
| 体外刺激 | 抗CD3/CD28浓度、低氧浓度、IL-15/IL-2浓度、tofacitinib浓度、培养时间 阅读提示:Materials & Methods: In vitro stimulation |
| 体内药物处理 | SN34960剂量、给药途径(腹腔 vs 局部)、给药频率、开始时间、持续时间 阅读提示:Materials & Methods: In vivo drug treatment;Figure 6示意图 |
| Blimp-1缺陷验证 | 小鼠基因型、Cre品系、对照选择 阅读提示:Materials & Methods: Mice;Figure 3图注 |
| 体外低氧培养 | 氧气浓度、培养时间、细胞类型 阅读提示:Materials & Methods: Cell culture under hypoxic conditions |