皮肤活检样本收集
获取健康AGR、非病变HS和病变HS皮肤样本以比较免疫特征。
从8名健康个体和10名HS患者腋窝区域收集皮肤活检,分别代表健康AGR、非病变和病变状态。
Primary alterations during the development of hidradenitis suppurativa
研究包含健康、非病变和病变HS皮肤三组样本,使用RNASeq、RT-qPCR、IHC和IF多种方法,并进行功能与机制验证。
健康个体AGR皮肤活检样本 HS患者非病变皮肤活检样本 HS患者病变皮肤活检样本 角质形成细胞 Th17细胞
样本来源:健康个体(n=8)和HS患者(n=10)的腋窝皮肤活检 分组:健康AGR、非病变HS、病变HS 检测方法:RNASeq、RT-qPCR、IHC、IF 角质形成细胞相关介质表达:S100A7、S100A8、S100A9、DEFB4B等 Th1/Th17相关转录因子:TBX21、RORC的表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取健康AGR、非病变HS和病变HS皮肤样本以比较免疫特征。
从8名健康个体和10名HS患者腋窝区域收集皮肤活检,分别代表健康AGR、非病变和病变状态。
检测目标分子的mRNA表达水平。
从皮肤活检中提取总RNA,进行RNASeq和RT-qPCR分析目标基因表达。
在蛋白水平检测并定位目标分子表达。
使用IHC和IF对皮肤切片进行染色,检测免疫细胞、角质形成细胞相关介质及Th1/Th17相关因子。
量化蛋白表达并比较三组间的差异。
使用Pannoramic Viewer软件定量蛋白水平,进行组间统计分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | TriReagent | Sigma-Aldrich | -- |
| 组织研磨器 | QIAGEN | -- | |
| RNA质量检测 | NanoDrop分光光度计 | Thermo Scientific | -- |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| RNA处理 | DNase I | Applied Biosystems | -- |
| 逆转录 | High Capacity cDNA Archive Kit | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | TaqMan基因表达预混液 | Applied Biosystems | -- |
| LightCycler 480系统 | Roche | -- | |
| IHC | Vector ImmPACT NovaRED试剂盒 | VECTOR Laboratories | -- |
| 抗小鼠/兔HRP标记二抗 | Dako | -- | |
| IL-17一抗 | Bioss Antibodies | bs-2140R | |
| IFN-γ一抗 | Novus Biologicals | NBP1-19761 | |
| CCL2/MCP1一抗 | Novus Biologicals | NBP2-22115 | |
| CCL20/MIP-3-α一抗 | Abcam | ab9829 | |
| S100A8一抗 | Sigma-Aldrich | HPA024372 | |
| lipocalin/NGAL一抗 | Invitrogen | PA5-32476 | |
| TNF-α一抗 | Sigma-Aldrich | SAB1404480-100UG | |
| CD4一抗 | Abcam | ab133616 | |
| CD11c一抗 | Abcam | ab52632 | |
| CD163一抗 | Origene | BM4041B | |
| IL-10一抗 | Covalab | mab30207 | |
| IL-1β一抗 | Abcam | ab9722 | |
| IL-6一抗 | Sigma-Aldrich | SAB1400139-50UG | |
| IL-23一抗 | Thermo Fisher Scientific | PA5-20239 | |
| TGFβ-1一抗 | Invitrogen | MA1-34093 | |
| IL-12一抗 | Origene | CF808081 | |
| β-2防御素一抗 | Abcam | ab63982 | |
| IF | Alexa Fluor 555山羊抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 皮肤样本保存 | RNAlater | Qiagen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 皮肤活检样本收集 | 健康个体和HS患者的样本量、年龄、性别、取材部位 阅读提示:Materials and methods, Skin biopsies; Table 1 |
| RNA提取和基因表达分析 | RNA提取试剂、逆转录试剂盒、RT-qPCR使用的TaqMan探针序列 阅读提示:Materials and methods, RNA isolation, reverse transcription; Real-time quantitative PCR |
| 蛋白水平检测和定位 | 一抗的克隆号、稀释度、抗原修复条件、染色流程 阅读提示:Materials and methods, Immunohistochemistry; Immunofluorescent staining |
| 蛋白定量和统计分析 | 蛋白定量方法、统计检验类型 阅读提示:Materials and methods, Statistical analysis |