靶向蛋白的筛选与表征
获得并验证靶向KK-LC-1和CD28的设计锚蛋白重复蛋白的特异性结合能力。
利用噬菌体展示技术筛选靶向KK-LC-1和CD28的设计锚蛋白重复蛋白K1和CD28-DARPin,通过SPR测定亲和力,并通过流式、免疫荧光、SPR和体内成像验证结合特异性。
Non-superagonist CD28-based dual-signal T cell engager targeting
包含分子结合(SPR、流式)、细胞功能(激活、杀伤)、三维肿瘤球、体内异种移植模型及与PD-1×CTLA-4联合的机制与疗效验证,层级丰富。
MKN45胃癌细胞系 HGC27胃癌细胞系(KK-LC-1过表达株) BALB/c裸鼠皮下异种移植瘤模型 MKN45腹腔转移瘤模型
靶蛋白设计锚蛋白重复蛋白K1与KK-LC-1的结合亲和力KD=8.985 nM 双特异性分子KK-LC-1×CD3和KK-LC-1×CD28与靶抗原结合活性 T细胞活化检测(CD69/CD25表达及细胞因子分泌) 体外细胞毒性实验的效靶比和浓度依赖性 体内联合治疗对肿瘤生长抑制和T细胞浸润的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证靶向KK-LC-1和CD28的设计锚蛋白重复蛋白的特异性结合能力。
利用噬菌体展示技术筛选靶向KK-LC-1和CD28的设计锚蛋白重复蛋白K1和CD28-DARPin,通过SPR测定亲和力,并通过流式、免疫荧光、SPR和体内成像验证结合特异性。
构建KK-LC-1×CD3和KK-LC-1×CD28双特异性分子,并验证其与靶抗原和T细胞的特异性结合。
将K1与CD3 scFv或CD28 DARPin通过(GGGGS)3连接子融合,构建KK-LC-1×CD3和KK-LC-1×CD28,经SDS-PAGE和HPLC验证纯度,SPR测定亲和力,流式和免疫荧光检测结合活性。
评估KK-LC-1×CD3单独或联合KK-LC-1×CD28对T细胞活化和细胞因子分泌的影响。
将PBMCs与肿瘤细胞共培养,加入不同处理组,流式检测CD69和CD25表达,收集上清用LEGENDplex检测细胞因子(IFN-γ、TNF-α、IL-2、IL-6、IL-10)。
验证KK-LC-1×CD3及其与KK-LC-1×CD28联合对肿瘤细胞的杀伤效果及特异性。
使用荧光素酶标记的肿瘤细胞,在2D单层和3D多细胞肿瘤球模型中,以不同浓度和效靶比与PBMCs共培养,检测特异性杀伤率。
在体内验证双信号T细胞衔接器联合治疗对肿瘤生长的抑制效果。
在MKN45皮下和腹腔转移模型中,荷瘤小鼠静脉注射PBMCs后,连续5天给药KK-LC-1×CD3和/或KK-LC-1×CD28,监测肿瘤体积和生物发光信号,评估抗肿瘤效果。
评估三药联合(KK-LC-1×CD3 + KK-LC-1×CD28 + PD-1×CTLA-4)是否进一步增强抗肿瘤疗效。
在HGC27(oe-KK-LC-1)皮下瘤模型中,给予三药联合治疗,比较肿瘤生长抑制和生存期。同时通过流式分析肿瘤浸润T细胞表型。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白表达与纯化 | pET-30a载体 | Genscript | -- |
| pET-21a载体 | Genscript | -- | |
| 异丙基β-D-1-硫代半乳糖苷 | Beyotime | ST098 | |
| 蛋白纯化 | Ni-NTA树脂 | Cytiva | 17524701 |
| SUMO蛋白酶 | Thermo Fisher | 12588018 | |
| 分子克隆 | Q5高保真DNA聚合酶 | NEB | -- |
| T4 DNA连接酶 | TaKaRa | 2011A | |
| EcoRI限制酶 | NEB | -- | |
| XhoI限制酶 | NEB | -- | |
| DH5α感受态细胞 | TransGen Biotech | CD201 | |
| 蛋白纯度分析 | 岛津LC-20A高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| BioCore RP-1000色谱柱 | -- | -- | |
| 质谱分析 | 赛默飞MAbPac反相色谱柱 | Thermo Scientific | 90182-C08H |
| 赛默飞QE-HF-X质谱仪 | Thermo Fisher | -- | |
| 圆二色谱分析 | Jasco J-810圆二色谱仪 | Jasco | -- |
| SPR分析 | Biacore T200系统 | Cytiva | -- |
| CM5传感芯片 | GE Healthcare | -- | |
| 重组KK-LC-1胞外域 | GenScript | -- | |
| 重组人CD3胞外域 | Sino Biological | 10977-H08H | |
| 重组人CD28胞外域 | Sino Biological | 90182-C08H | |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Beyotime | C0222 | |
| 嘌呤霉素 | Beyotime | ST551 | |
| AIM-V培养基 | Gibco | 12055091 | |
| Ficoll分离液 | -- | -- | |
| 结合分析 | 抗His标签抗体(iFluor 647) | GenScript | A01802 |
| 流式分析 | CD3-APC/Cy750抗体 | BioLegend | 300470 |
| FITC抗人CD4抗体 | BioLegend | 300506 | |
| Brilliant Violet 510抗人CD8抗体 | BioLegend | 344732 | |
| CD56-ECD抗体 | Beckman Coulter | A82943 | |
| FITC抗人CD11c抗体 | BioLegend | 337214 | |
| PE抗人CD19抗体 | BioLegend | 392506 | |
| 7-AAD活力染色溶液 | BioLegend | 420403 | |
| Beckman CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 免疫荧光染色 | DAPI | Beyotime | C1002 |
| 小鼠抗KK-LC-1单克隆抗体 | Abcam | ab21997 | |
| FITC标记的山羊抗小鼠IgG二抗 | Elabscience | E-AB-1015 | |
| 细胞因子检测 | LEGENDplex人Th1/Th2细胞因子检测试剂盒 | BioLegend | 741030 |
| 体外细胞毒性实验 | D-荧光素 | -- | -- |
| Varioskan LUX多功能酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 3D肿瘤球实验 | 超低吸附96孔板 | Corning | 3474 |
| Calcein/PI细胞活力/细胞毒性检测试剂盒 | Beyotime | C2015M | |
| ZEISS ZEN 880显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 体内实验 | Matrigel基质胶 | Corning | 356234 |
| 数显卡尺 | Mitutoyo | 500-752 | |
| 体内成像 | Cy7染料 | -- | -- |
| CRi Maestro活体成像系统 | Cambridge Research & Instrumentation | -- | |
| Living Image软件 | -- | -- | |
| 体内疗效评估 | IVIS Lumina III成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 联合治疗 | PD-1×CTLA-4双特异性抗体(卡度尼利单抗) | Akeso, Inc. | -- |
| 组织学分析 | IV型胶原酶 | -- | -- |
| 抗K1一抗 | -- | -- | |
| 抗PD-1抗体 | PTG | 66220-1-Ig | |
| 抗CTLA-4抗体 | Abclonal | A2063 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abclonal | AS007 | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | ab150113 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 9.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 蛋白表达与纯化 | IPTG浓度、诱导温度和时间、Ni-NTA纯化缓冲液成分及洗脱咪唑浓度 阅读提示:Methods 'Expression and characterization of anti-KK-LC-1 designed ankyrin repeat protein' 小节 |
| SPR结合分析 | 固定化配体浓度、分析物浓度范围、流速及结合解离时间 阅读提示:Methods 'Surface plasmon resonance' 小节 |
| T细胞激活实验 | 效靶比、蛋白浓度、孵育时间、检测标志物(CD69/CD25) 阅读提示:Methods 'T cell activation assay and cytokine secretion assay' 小节 |
| 体外细胞毒性实验 | 效靶比、KK-LC-1×CD3浓度范围、KK-LC-1×CD28浓度、孵育时间 阅读提示:Methods 'Cytotoxicity assay' 小节 |
| 体内异种移植模型 | 细胞接种量、PBMCs输注时间和数量、给药剂量、给药时间、实验终点 阅读提示:Methods 'In vivo antitumor efficacy study' 小节及Figure 5 legend |
| 联合治疗实验 | PD-1×CTLA-4剂量、给药频率、治疗时间线 阅读提示:Results 'KK-LC-1-targeted CD3/CD28 co-stimulation therapy ...' 小节及Figure 6 legend |